Protein–RNA interactions for Protein: Q9NUN5

LMBRD1, Probable lysosomal cobalamin transporter, humanhuman

Predictions only

Length 540 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMBRD1Q9NUN5 AC068888.1-207ENST00000546793 2863 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
LMBRD1Q9NUN5 LRRC20-201ENST00000355790 3414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LMBRD1Q9NUN5 GNAS-215ENST00000371102 3438 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
LMBRD1Q9NUN5 CPA5-205ENST00000466363 2099 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
LMBRD1Q9NUN5 PRKD1-209ENST00000616995 3498 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
LMBRD1Q9NUN5 TBL3-205ENST00000568546 6803 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LMBRD1Q9NUN5 THBS4-201ENST00000350881 3222 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LMBRD1Q9NUN5 DCTN1-203ENST00000409240 4365 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LMBRD1Q9NUN5 C19orf70-201ENST00000309324 896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LMBRD1Q9NUN5 PIGU-202ENST00000374820 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LMBRD1Q9NUN5 SERF1B-202ENST00000380751 703 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LMBRD1Q9NUN5 CSHL1-204ENST00000392824 823 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LMBRD1Q9NUN5 UBE2C-206ENST00000405520 641 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
LMBRD1Q9NUN5 AL591424.1-201ENST00000442569 1213 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
LMBRD1Q9NUN5 LINC02055-207ENST00000524346 706 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
LMBRD1Q9NUN5 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
LMBRD1Q9NUN5 AL079307.3-201ENST00000556114 283 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
LMBRD1Q9NUN5 KLK15-203ENST00000596931 692 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LMBRD1Q9NUN5 AC007967.4-201ENST00000614700 386 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
LMBRD1Q9NUN5 UBE2C-208ENST00000617055 705 ntTSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
LMBRD1Q9NUN5 AQP12B-206ENST00000621682 1080 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
LMBRD1Q9NUN5 AL662799.1-201ENST00000630418 496 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
LMBRD1Q9NUN5 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LMBRD1Q9NUN5 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LMBRD1Q9NUN5 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
LMBRD1Q9NUN5 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.43■□□□□ 0.38
LMBRD1Q9NUN5 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LMBRD1Q9NUN5 TRAFD1-201ENST00000257604 3178 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
LMBRD1Q9NUN5 PDE8A-203ENST00000394553 3912 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LMBRD1Q9NUN5 FBN2-205ENST00000508989 4987 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
LMBRD1Q9NUN5 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LMBRD1Q9NUN5 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
LMBRD1Q9NUN5 KIFC3-202ENST00000421376 3128 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
LMBRD1Q9NUN5 GRIN1-206ENST00000371559 3577 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
LMBRD1Q9NUN5 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LMBRD1Q9NUN5 MICA-209ENST00000449934 1386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LMBRD1Q9NUN5 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LMBRD1Q9NUN5 PRCP-201ENST00000313010 3090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LMBRD1Q9NUN5 GRM7-203ENST00000389336 2901 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LMBRD1Q9NUN5 CSTB-201ENST00000291568 2164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LMBRD1Q9NUN5 TGM6-202ENST00000381423 2158 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LMBRD1Q9NUN5 PIP5K1B-208ENST00000541509 2664 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LMBRD1Q9NUN5 TC2N-201ENST00000340892 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LMBRD1Q9NUN5 AHSA1-201ENST00000216479 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LMBRD1Q9NUN5 TPGS2-220ENST00000610723 1426 ntTSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LMBRD1Q9NUN5 HNRNPH1-204ENST00000442819 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LMBRD1Q9NUN5 ELOF1-201ENST00000252445 1019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LMBRD1Q9NUN5 SPACA4-201ENST00000321762 972 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LMBRD1Q9NUN5 VCX-201ENST00000341408 677 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LMBRD1Q9NUN5 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LMBRD1Q9NUN5 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LMBRD1Q9NUN5 CALML4-206ENST00000467889 987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LMBRD1Q9NUN5 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LMBRD1Q9NUN5 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
LMBRD1Q9NUN5 TM9SF1-202ENST00000396854 2055 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LMBRD1Q9NUN5 ADAMTS18-201ENST00000282849 5913 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LMBRD1Q9NUN5 PPFIA3-203ENST00000602351 4341 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LMBRD1Q9NUN5 BBS1-202ENST00000393994 1790 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LMBRD1Q9NUN5 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LMBRD1Q9NUN5 MLXIPL-206ENST00000434326 3252 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LMBRD1Q9NUN5 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LMBRD1Q9NUN5 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LMBRD1Q9NUN5 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LMBRD1Q9NUN5 MAGI2-218ENST00000630991 2349 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LMBRD1Q9NUN5 MAP3K12-201ENST00000267079 4319 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LMBRD1Q9NUN5 C22orf34-204ENST00000414287 2197 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LMBRD1Q9NUN5 ZNF143-213ENST00000530463 2022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
LMBRD1Q9NUN5 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
LMBRD1Q9NUN5 AP4B1-201ENST00000256658 2742 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LMBRD1Q9NUN5 TNFRSF11A-206ENST00000617039 3756 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LMBRD1Q9NUN5 SLC4A7-210ENST00000440156 4120 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LMBRD1Q9NUN5 NUTM2E-201ENST00000429984 3292 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
LMBRD1Q9NUN5 CEP295NL-201ENST00000322630 2090 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
LMBRD1Q9NUN5 MEFV-201ENST00000219596 3499 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LMBRD1Q9NUN5 IGF2BP2-202ENST00000382199 3688 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LMBRD1Q9NUN5 ZFP82-201ENST00000392161 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LMBRD1Q9NUN5 CUX1-214ENST00000550008 4350 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
LMBRD1Q9NUN5 PPP1R26-204ENST00000604351 4640 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
LMBRD1Q9NUN5 ZBTB7B-202ENST00000368426 3594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LMBRD1Q9NUN5 TJP2-208ENST00000535702 3984 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
LMBRD1Q9NUN5 LINC01750-202ENST00000438293 3068 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LMBRD1Q9NUN5 FCN2-201ENST00000291744 1057 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LMBRD1Q9NUN5 YBX2P1-201ENST00000394192 760 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
LMBRD1Q9NUN5 MED15P5-201ENST00000423150 992 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
LMBRD1Q9NUN5 AL450487.1-201ENST00000426799 995 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
LMBRD1Q9NUN5 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
LMBRD1Q9NUN5 MTND6P24-201ENST00000440466 518 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
LMBRD1Q9NUN5 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC17.41■□□□□ 0.38
LMBRD1Q9NUN5 TMEM41B-203ENST00000527813 803 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
LMBRD1Q9NUN5 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC17.41■□□□□ 0.38
LMBRD1Q9NUN5 AC027601.4-201ENST00000611259 610 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
LMBRD1Q9NUN5 FAM197Y3-203ENST00000618346 717 ntBASIC17.41■□□□□ 0.38
LMBRD1Q9NUN5 KCNAB2-219ENST00000602612 2396 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
LMBRD1Q9NUN5 MCC-202ENST00000408903 3476 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
LMBRD1Q9NUN5 FAM200B-201ENST00000422728 2962 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LMBRD1Q9NUN5 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LMBRD1Q9NUN5 STK32B-201ENST00000282908 3582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LMBRD1Q9NUN5 AL590132.1-202ENST00000638983 4184 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
LMBRD1Q9NUN5 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
LMBRD1Q9NUN5 HMOX2-216ENST00000613539 1703 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 76.5 ms