Protein–RNA interactions for Protein: Q9NSD4

ZNF275, Zinc finger protein 275, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 429 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF275Q9NSD4 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ZNF275Q9NSD4 SHANK2-204ENST00000409530 2123 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ZNF275Q9NSD4 COX6B2-201ENST00000326529 1663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ZNF275Q9NSD4 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ZNF275Q9NSD4 GTF3C4-201ENST00000372146 9043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ZNF275Q9NSD4 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ZNF275Q9NSD4 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ZNF275Q9NSD4 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ZNF275Q9NSD4 NDUFS8-201ENST00000313468 791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ZNF275Q9NSD4 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ZNF275Q9NSD4 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ZNF275Q9NSD4 AL096814.1-202ENST00000372963 647 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ZNF275Q9NSD4 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ZNF275Q9NSD4 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ZNF275Q9NSD4 DNAJB6-209ENST00000443280 1159 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ZNF275Q9NSD4 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
ZNF275Q9NSD4 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ZNF275Q9NSD4 NAALADL1-207ENST00000526799 959 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ZNF275Q9NSD4 AC084125.2-203ENST00000532766 821 ntTSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ZNF275Q9NSD4 TUBB3-203ENST00000553967 736 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ZNF275Q9NSD4 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
ZNF275Q9NSD4 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ZNF275Q9NSD4 ZNF226-211ENST00000588742 447 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ZNF275Q9NSD4 RNA5-8SN1-201ENST00000610460 153 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
ZNF275Q9NSD4 RNA5-8SN5-202ENST00000612463 153 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
ZNF275Q9NSD4 RNA5-8SN4-201ENST00000613359 153 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
ZNF275Q9NSD4 RNA5-8SN5-201ENST00000619471 153 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
ZNF275Q9NSD4 MIR6069-201ENST00000620069 79 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
ZNF275Q9NSD4 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ZNF275Q9NSD4 APBB3-201ENST00000354402 1810 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ZNF275Q9NSD4 ARHGEF7-204ENST00000375736 5032 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ZNF275Q9NSD4 GREB1-205ENST00000389825 1315 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ZNF275Q9NSD4 ATP6AP2-233ENST00000638153 1303 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ZNF275Q9NSD4 LIMS1-202ENST00000338045 1876 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ZNF275Q9NSD4 KIAA0513-207ENST00000567328 1873 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ZNF275Q9NSD4 PDZD3-212ENST00000531114 2996 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ZNF275Q9NSD4 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ZNF275Q9NSD4 RGS12-202ENST00000338806 3010 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ZNF275Q9NSD4 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ZNF275Q9NSD4 OTUB1-206ENST00000535715 1391 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ZNF275Q9NSD4 MCRS1-211ENST00000550165 1936 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ZNF275Q9NSD4 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ZNF275Q9NSD4 PPIL2-202ENST00000398831 2574 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ZNF275Q9NSD4 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ZNF275Q9NSD4 BTBD7P1-201ENST00000447253 1453 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
ZNF275Q9NSD4 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ZNF275Q9NSD4 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ZNF275Q9NSD4 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ZNF275Q9NSD4 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ZNF275Q9NSD4 AC138894.1-201ENST00000635887 2824 ntTSL 5 BASIC13.54□□□□□ -0.24
ZNF275Q9NSD4 RASSF5-201ENST00000577571 3496 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ZNF275Q9NSD4 AC007686.3-201ENST00000619017 3487 ntBASIC13.54□□□□□ -0.24
ZNF275Q9NSD4 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC13.54□□□□□ -0.24
ZNF275Q9NSD4 CEP170B-202ENST00000414716 6705 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ZNF275Q9NSD4 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ZNF275Q9NSD4 GLUL-202ENST00000331872 4364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ZNF275Q9NSD4 KIF6-203ENST00000394362 2394 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ZNF275Q9NSD4 AKTIP-202ENST00000394657 2426 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ZNF275Q9NSD4 ANXA6-215ENST00000523714 2451 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ZNF275Q9NSD4 ZSWIM8-201ENST00000398706 6062 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ZNF275Q9NSD4 IRGQ-201ENST00000422989 9685 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ZNF275Q9NSD4 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ZNF275Q9NSD4 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ZNF275Q9NSD4 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ZNF275Q9NSD4 SLC13A5-203ENST00000433363 3435 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ZNF275Q9NSD4 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ZNF275Q9NSD4 DIS3-202ENST00000377780 5232 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ZNF275Q9NSD4 C22orf34-201ENST00000343999 2816 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ZNF275Q9NSD4 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ZNF275Q9NSD4 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ZNF275Q9NSD4 NMU-201ENST00000264218 816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ZNF275Q9NSD4 ASB12-201ENST00000362002 1289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ZNF275Q9NSD4 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ZNF275Q9NSD4 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ZNF275Q9NSD4 PNKD-204ENST00000436005 978 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ZNF275Q9NSD4 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ZNF275Q9NSD4 TARDBPP1-201ENST00000442013 1203 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
ZNF275Q9NSD4 TMEM101-204ENST00000587529 965 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ZNF275Q9NSD4 AC010326.2-201ENST00000602124 1020 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ZNF275Q9NSD4 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ZNF275Q9NSD4 CREB3L2-208ENST00000620715 1053 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ZNF275Q9NSD4 HOTAIRM1_1.1-201ENST00000622675 125 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
ZNF275Q9NSD4 AKR7L-202ENST00000429712 1313 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ZNF275Q9NSD4 AL583722.1-201ENST00000540171 1307 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ZNF275Q9NSD4 NPBWR2-201ENST00000369768 1352 ntAPPRIS P1 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ZNF275Q9NSD4 B4GALNT3-201ENST00000266383 5068 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ZNF275Q9NSD4 RIPK1-201ENST00000259808 4160 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ZNF275Q9NSD4 SMARCA4-207ENST00000541122 5139 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ZNF275Q9NSD4 GAL3ST4-202ENST00000411994 1404 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ZNF275Q9NSD4 PUS7-202ENST00000469408 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ZNF275Q9NSD4 ZNF76-202ENST00000339411 2447 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ZNF275Q9NSD4 AL928921.2-201ENST00000641325 2442 ntBASIC13.53□□□□□ -0.24
ZNF275Q9NSD4 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ZNF275Q9NSD4 AC009961.1-203ENST00000607836 2520 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ZNF275Q9NSD4 LTA-214ENST00000454783 1507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ZNF275Q9NSD4 PLIN3-202ENST00000585479 1535 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ZNF275Q9NSD4 COMMD5-203ENST00000450361 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ZNF275Q9NSD4 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC13.53□□□□□ -0.24
ZNF275Q9NSD4 AMPD3-203ENST00000396554 3806 ntTSL 1 (best) BASIC13.53□□□□□ -0.24
ZNF275Q9NSD4 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC13.53□□□□□ -0.24
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