Protein–RNA interactions for Protein: Q9NRS4

TMPRSS4, Transmembrane protease serine 4, humanhuman

Predictions only

Length 437 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMPRSS4Q9NRS4 SULT2B1-202ENST00000323090 1447 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMPRSS4Q9NRS4 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMPRSS4Q9NRS4 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
TMPRSS4Q9NRS4 SUMO3-203ENST00000397898 1779 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMPRSS4Q9NRS4 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMPRSS4Q9NRS4 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMPRSS4Q9NRS4 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMPRSS4Q9NRS4 ZBTB10-202ENST00000426744 9878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMPRSS4Q9NRS4 EFNB1-201ENST00000204961 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMPRSS4Q9NRS4 RSPH6A-202ENST00000597055 2306 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMPRSS4Q9NRS4 KRT8P35-201ENST00000483942 1338 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
TMPRSS4Q9NRS4 CSGALNACT1-211ENST00000522854 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMPRSS4Q9NRS4 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMPRSS4Q9NRS4 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMPRSS4Q9NRS4 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMPRSS4Q9NRS4 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMPRSS4Q9NRS4 CYB5R3-203ENST00000402438 1050 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMPRSS4Q9NRS4 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMPRSS4Q9NRS4 ITPR1-AS1-201ENST00000412804 858 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMPRSS4Q9NRS4 AL133456.1-201ENST00000415655 577 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMPRSS4Q9NRS4 KRT17P7-201ENST00000451704 1104 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
TMPRSS4Q9NRS4 CROCCP4-201ENST00000457096 498 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
TMPRSS4Q9NRS4 GS1-24F4.2-201ENST00000500823 1110 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMPRSS4Q9NRS4 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMPRSS4Q9NRS4 AC136475.3-203ENST00000525217 617 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMPRSS4Q9NRS4 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMPRSS4Q9NRS4 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
TMPRSS4Q9NRS4 AC125603.2-201ENST00000546835 876 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMPRSS4Q9NRS4 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMPRSS4Q9NRS4 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMPRSS4Q9NRS4 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
TMPRSS4Q9NRS4 AC010641.1-201ENST00000591757 529 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMPRSS4Q9NRS4 ZSCAN30-208ENST00000592278 731 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMPRSS4Q9NRS4 CCL4L2-214ENST00000617416 1258 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMPRSS4Q9NRS4 LMBRD1-202ENST00000370577 2209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMPRSS4Q9NRS4 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
TMPRSS4Q9NRS4 CCDC51-204ENST00000442740 1554 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TMPRSS4Q9NRS4 FAM110C-201ENST00000327669 3760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TMPRSS4Q9NRS4 HSPB7-202ENST00000375718 2415 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TMPRSS4Q9NRS4 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TMPRSS4Q9NRS4 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TMPRSS4Q9NRS4 HMBOX1-212ENST00000558662 1765 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TMPRSS4Q9NRS4 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TMPRSS4Q9NRS4 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TMPRSS4Q9NRS4 TRAK1-208ENST00000484786 2008 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TMPRSS4Q9NRS4 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TMPRSS4Q9NRS4 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
TMPRSS4Q9NRS4 LINC00668-205ENST00000581571 1748 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TMPRSS4Q9NRS4 AGT-201ENST00000366667 2291 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
TMPRSS4Q9NRS4 NTRK2-205ENST00000376208 8178 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMPRSS4Q9NRS4 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMPRSS4Q9NRS4 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMPRSS4Q9NRS4 VWA2-202ENST00000392982 2794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMPRSS4Q9NRS4 FAM160B1-202ENST00000369248 5810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMPRSS4Q9NRS4 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMPRSS4Q9NRS4 DZANK1-202ENST00000329494 1389 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMPRSS4Q9NRS4 ZNF644-201ENST00000337393 5763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMPRSS4Q9NRS4 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMPRSS4Q9NRS4 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMPRSS4Q9NRS4 MED16-203ENST00000325464 2922 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMPRSS4Q9NRS4 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMPRSS4Q9NRS4 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMPRSS4Q9NRS4 MIIP-201ENST00000235332 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMPRSS4Q9NRS4 TOM1L2-205ENST00000478943 2098 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMPRSS4Q9NRS4 RASGEF1C-206ENST00000522500 2055 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMPRSS4Q9NRS4 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMPRSS4Q9NRS4 PVR-203ENST00000403059 3078 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMPRSS4Q9NRS4 RHCE-205ENST00000349438 1235 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMPRSS4Q9NRS4 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
TMPRSS4Q9NRS4 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMPRSS4Q9NRS4 AC114812.1-204ENST00000449669 728 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
TMPRSS4Q9NRS4 AC093879.1-201ENST00000508959 1176 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMPRSS4Q9NRS4 GNRHR2-203ENST00000581100 1187 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
TMPRSS4Q9NRS4 SLC25A39-207ENST00000586016 1156 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMPRSS4Q9NRS4 AC145423.3-201ENST00000615987 467 ntBASIC15.76■□□□□ 0.11
TMPRSS4Q9NRS4 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMPRSS4Q9NRS4 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMPRSS4Q9NRS4 MICALL1-201ENST00000215957 4710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMPRSS4Q9NRS4 LRRC6-205ENST00000519595 1736 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMPRSS4Q9NRS4 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMPRSS4Q9NRS4 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMPRSS4Q9NRS4 MTCL1-203ENST00000400050 6042 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
TMPRSS4Q9NRS4 TGFB1-201ENST00000221930 2769 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMPRSS4Q9NRS4 KIFC3-205ENST00000540079 2781 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMPRSS4Q9NRS4 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMPRSS4Q9NRS4 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMPRSS4Q9NRS4 E2F6-202ENST00000381525 3218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMPRSS4Q9NRS4 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TMPRSS4Q9NRS4 PLIN1-201ENST00000300055 2953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMPRSS4Q9NRS4 ZNF286A-218ENST00000583566 1806 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMPRSS4Q9NRS4 MAP4K1-210ENST00000591517 2700 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMPRSS4Q9NRS4 ZNF367-201ENST00000375256 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMPRSS4Q9NRS4 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMPRSS4Q9NRS4 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMPRSS4Q9NRS4 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC15.75■□□□□ 0.11
TMPRSS4Q9NRS4 STRN3-201ENST00000355683 3970 ntTSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMPRSS4Q9NRS4 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMPRSS4Q9NRS4 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMPRSS4Q9NRS4 TAP2-205ENST00000620123 5676 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.75■□□□□ 0.11
TMPRSS4Q9NRS4 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.75■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.9 ms