Protein–RNA interactions for Protein: Q9C000

NLRP1, NACHT, LRR and PYD domains-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,473 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NLRP1Q9C000 SLC50A1-202ENST00000368401 1166 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NLRP1Q9C000 HIST2H2BF-204ENST00000545683 999 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NLRP1Q9C000 AC007952.4-201ENST00000573866 637 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
NLRP1Q9C000 TMEM205-210ENST00000588560 840 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NLRP1Q9C000 VPS37C-201ENST00000301765 2865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NLRP1Q9C000 ZC3H14-204ENST00000336693 2007 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NLRP1Q9C000 DLEU2-201ENST00000235290 1739 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NLRP1Q9C000 CDC25A-202ENST00000351231 3663 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NLRP1Q9C000 TRIM45-203ENST00000369464 3495 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NLRP1Q9C000 XRCC3-209ENST00000554913 2539 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NLRP1Q9C000 ZNF514-202ENST00000411425 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NLRP1Q9C000 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NLRP1Q9C000 AC026691.1-201ENST00000602502 2017 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
NLRP1Q9C000 CICP6-201ENST00000457191 2729 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
NLRP1Q9C000 VAC14-201ENST00000261776 3099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NLRP1Q9C000 NFE2-203ENST00000540264 1833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NLRP1Q9C000 IL1F10-202ENST00000393197 1366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NLRP1Q9C000 CDK11B-201ENST00000340677 2534 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NLRP1Q9C000 CRYBB3-201ENST00000215855 867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NLRP1Q9C000 MMP7-201ENST00000260227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NLRP1Q9C000 LY86-202ENST00000379953 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NLRP1Q9C000 PPM1N-201ENST00000396735 895 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NLRP1Q9C000 PHACTR2-204ENST00000397980 745 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NLRP1Q9C000 AL365436.2-201ENST00000434112 526 ntTSL 4 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NLRP1Q9C000 SHANK2-210ENST00000449116 939 ntTSL 1 (best) BASIC21.26■□□□□ 0.99
NLRP1Q9C000 PPM1N-208ENST00000456399 618 ntTSL 3 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NLRP1Q9C000 ATP6V1D-206ENST00000554236 888 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NLRP1Q9C000 ATP2A1-AS1-201ENST00000561547 558 ntTSL 2 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NLRP1Q9C000 AC148477.9-201ENST00000623974 539 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
NLRP1Q9C000 CYP1B1-AS1-221ENST00000627172 995 ntTSL 5 BASIC21.26■□□□□ 0.99
NLRP1Q9C000 AC002472.4-201ENST00000641915 272 ntBASIC21.26■□□□□ 0.99
NLRP1Q9C000 MOGAT2-201ENST00000198801 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NLRP1Q9C000 SOBP-201ENST00000317357 5245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NLRP1Q9C000 PCDHB6-202ENST00000622991 2608 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NLRP1Q9C000 FOXP1-218ENST00000498215 2400 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NLRP1Q9C000 SYVN1-202ENST00000307289 2841 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NLRP1Q9C000 CCDC51-206ENST00000447018 1461 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NLRP1Q9C000 POMT1-208ENST00000423007 3320 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NLRP1Q9C000 FAS-202ENST00000352159 1722 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NLRP1Q9C000 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NLRP1Q9C000 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NLRP1Q9C000 COLEC11-203ENST00000382062 1633 ntTSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NLRP1Q9C000 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NLRP1Q9C000 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NLRP1Q9C000 GTF3C6-201ENST00000329970 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NLRP1Q9C000 AL137058.1-201ENST00000418237 673 ntTSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NLRP1Q9C000 AC093909.3-201ENST00000504783 336 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
NLRP1Q9C000 ROPN1B-203ENST00000505382 713 ntTSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NLRP1Q9C000 CD59-210ENST00000528700 652 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NLRP1Q9C000 AC020636.2-201ENST00000569170 1189 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC21.25■□□□□ 0.99
NLRP1Q9C000 MIR2392-201ENST00000584881 84 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
NLRP1Q9C000 AP000322.3-201ENST00000608665 388 ntBASIC21.25■□□□□ 0.99
NLRP1Q9C000 HNRNPA3-201ENST00000392524 2067 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.25■□□□□ 0.99
NLRP1Q9C000 GJB1-203ENST00000374029 1587 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NLRP1Q9C000 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NLRP1Q9C000 ELOVL1-201ENST00000372458 1477 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NLRP1Q9C000 SUPT20HL2-201ENST00000486479 2409 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
NLRP1Q9C000 SYNC-202ENST00000409190 3398 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NLRP1Q9C000 DPP9-210ENST00000597849 2025 ntTSL 5 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NLRP1Q9C000 TRIM39-201ENST00000376656 3338 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NLRP1Q9C000 TMEM198B-203ENST00000482378 2230 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NLRP1Q9C000 TMEM258-207ENST00000543510 1692 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NLRP1Q9C000 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NLRP1Q9C000 DRG2-201ENST00000225729 1964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NLRP1Q9C000 FMC1-201ENST00000297534 1210 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NLRP1Q9C000 C7orf61-201ENST00000332375 1004 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NLRP1Q9C000 NME2-201ENST00000393183 568 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NLRP1Q9C000 RNA5SP417-201ENST00000516459 108 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
NLRP1Q9C000 HTR4-213ENST00000631296 1224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NLRP1Q9C000 AL451007.2-201ENST00000632004 563 ntBASIC21.24■□□□□ 0.99
NLRP1Q9C000 KRT33A-201ENST00000007735 1287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NLRP1Q9C000 ALG11-203ENST00000523764 1404 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NLRP1Q9C000 LETMD1-235ENST00000552739 1713 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NLRP1Q9C000 HAUS2-208ENST00000568876 1702 ntTSL 4 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NLRP1Q9C000 CISH-201ENST00000348721 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NLRP1Q9C000 JADE2-202ENST00000361895 3212 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NLRP1Q9C000 ADSL-201ENST00000216194 1620 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NLRP1Q9C000 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NLRP1Q9C000 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC21.24■□□□□ 0.99
NLRP1Q9C000 C11orf49-204ENST00000395460 1916 ntTSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NLRP1Q9C000 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.24■□□□□ 0.99
NLRP1Q9C000 EPM2A-201ENST00000367519 3465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NLRP1Q9C000 PCIF1-201ENST00000372409 2747 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NLRP1Q9C000 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NLRP1Q9C000 SPO11-203ENST00000371263 1834 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NLRP1Q9C000 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NLRP1Q9C000 CCDC62-201ENST00000253079 3546 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NLRP1Q9C000 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NLRP1Q9C000 SLC25A23-202ENST00000301454 3425 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NLRP1Q9C000 RMND1-202ENST00000367303 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NLRP1Q9C000 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NLRP1Q9C000 AL590440.2-201ENST00000641973 1595 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
NLRP1Q9C000 AL139125.1-201ENST00000420395 557 ntTSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NLRP1Q9C000 TAC3-208ENST00000441881 731 ntTSL 1 (best) BASIC21.23■□□□□ 0.99
NLRP1Q9C000 DUX4L50-201ENST00000455245 715 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
NLRP1Q9C000 ANAPC15-217ENST00000545944 704 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NLRP1Q9C000 TTC28-AS1_3.1-201ENST00000615579 181 ntBASIC21.23■□□□□ 0.99
NLRP1Q9C000 TAC3-211ENST00000615887 1120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NLRP1Q9C000 TREX1-206ENST00000629913 945 ntAPPRIS P1 BASIC21.23■□□□□ 0.99
NLRP1Q9C000 TMPRSS4-211ENST00000522307 1634 ntTSL 2 BASIC21.23■□□□□ 0.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 53.6 ms