Protein–RNA interactions for Protein: Q9BZL6

PRKD2, Serine/threonine-protein kinase D2, humanhuman

Predictions only

Length 878 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRKD2Q9BZL6 SIKE1-203ENST00000369528 5506 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRKD2Q9BZL6 ARHGAP9-203ENST00000424809 2569 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRKD2Q9BZL6 PAFAH1B1-202ENST00000397195 5497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRKD2Q9BZL6 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRKD2Q9BZL6 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRKD2Q9BZL6 MBP-202ENST00000355994 2772 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRKD2Q9BZL6 AL109910.1-201ENST00000452071 1330 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRKD2Q9BZL6 ATP2A3-205ENST00000397041 4675 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRKD2Q9BZL6 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRKD2Q9BZL6 SLC6A2-204ENST00000561820 2268 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRKD2Q9BZL6 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRKD2Q9BZL6 STK39-201ENST00000355999 3820 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRKD2Q9BZL6 HIST2H2AA3-201ENST00000369159 549 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRKD2Q9BZL6 ATP6V0CP2-201ENST00000469409 207 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PRKD2Q9BZL6 IFITM3-202ENST00000526811 543 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRKD2Q9BZL6 RERG-205ENST00000537647 935 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRKD2Q9BZL6 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRKD2Q9BZL6 AC011603.1-201ENST00000553174 717 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRKD2Q9BZL6 SAMD11P1-201ENST00000571429 661 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PRKD2Q9BZL6 NDUFV2P1-201ENST00000596415 907 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PRKD2Q9BZL6 KLK11-210ENST00000600362 759 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRKD2Q9BZL6 OR10B1P-201ENST00000601666 907 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PRKD2Q9BZL6 HIST2H2AA4-201ENST00000607355 564 ntAPPRIS P1 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRKD2Q9BZL6 TMEM14B-220ENST00000612333 888 ntTSL 3 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRKD2Q9BZL6 TUBB3-215ENST00000625617 570 ntTSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRKD2Q9BZL6 RETN-203ENST00000629642 400 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRKD2Q9BZL6 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRKD2Q9BZL6 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRKD2Q9BZL6 GNS-201ENST00000258145 5122 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRKD2Q9BZL6 ZP3-201ENST00000336517 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRKD2Q9BZL6 ZSWIM8-AS1-201ENST00000456638 1460 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRKD2Q9BZL6 MAPKAP1-206ENST00000373511 3252 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRKD2Q9BZL6 TIGD2-202ENST00000603357 3217 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRKD2Q9BZL6 NRXN1-229ENST00000628515 3243 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRKD2Q9BZL6 FES-204ENST00000414248 2327 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRKD2Q9BZL6 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRKD2Q9BZL6 FAM83A-201ENST00000276699 1858 ntTSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRKD2Q9BZL6 DOK3-203ENST00000377112 1884 ntTSL 2 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRKD2Q9BZL6 NEFL-203ENST00000619417 1879 ntTSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRKD2Q9BZL6 TMPRSS4-201ENST00000437212 2074 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRKD2Q9BZL6 AC105250.1-201ENST00000509378 2057 ntBASIC16.01■□□□□ 0.15
PRKD2Q9BZL6 OTUD7A-201ENST00000307050 10770 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRKD2Q9BZL6 RBM12-201ENST00000359646 5332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRKD2Q9BZL6 ORAOV1-201ENST00000279147 2478 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRKD2Q9BZL6 RXRA-202ENST00000481739 1846 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRKD2Q9BZL6 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRKD2Q9BZL6 SHISA2-201ENST00000319420 2860 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRKD2Q9BZL6 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRKD2Q9BZL6 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.01■□□□□ 0.15
PRKD2Q9BZL6 SH2B1-201ENST00000322610 3095 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PRKD2Q9BZL6 AKT1-214ENST00000555528 3066 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRKD2Q9BZL6 UBE2D1-204ENST00000615793 2621 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PRKD2Q9BZL6 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PRKD2Q9BZL6 CHSY3-201ENST00000305031 3850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRKD2Q9BZL6 FLJ16779-201ENST00000612722 7638 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PRKD2Q9BZL6 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRKD2Q9BZL6 AP1M2-207ENST00000590923 1757 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRKD2Q9BZL6 MGAT4B-202ENST00000337755 3027 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PRKD2Q9BZL6 CTNNBL1-209ENST00000621317 1990 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PRKD2Q9BZL6 MAP4K5-201ENST00000013125 4354 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRKD2Q9BZL6 FBXO44-204ENST00000376762 1734 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRKD2Q9BZL6 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRKD2Q9BZL6 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PRKD2Q9BZL6 RABL2B-204ENST00000395593 2341 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRKD2Q9BZL6 PHTF1-201ENST00000357783 2747 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRKD2Q9BZL6 SLURP2-201ENST00000317543 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRKD2Q9BZL6 IFITM5-201ENST00000382614 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRKD2Q9BZL6 KNCN-202ENST00000396314 608 ntAPPRIS P3 TSL 4 BASIC16■□□□□ 0.15
PRKD2Q9BZL6 AL161719.1-201ENST00000442716 385 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PRKD2Q9BZL6 BANF1-202ENST00000445560 946 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRKD2Q9BZL6 NCK2-206ENST00000522586 490 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PRKD2Q9BZL6 ANO1-AS1-201ENST00000524987 646 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
PRKD2Q9BZL6 FOS-206ENST00000555347 1280 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PRKD2Q9BZL6 AC104758.2-201ENST00000562716 483 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
PRKD2Q9BZL6 RN7SL190P-201ENST00000582519 257 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PRKD2Q9BZL6 AC073413.1-201ENST00000603927 732 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PRKD2Q9BZL6 ZACNP1-201ENST00000612259 710 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PRKD2Q9BZL6 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PRKD2Q9BZL6 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRKD2Q9BZL6 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC16■□□□□ 0.15
PRKD2Q9BZL6 COL4A3BP-204ENST00000405807 2843 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PRKD2Q9BZL6 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRKD2Q9BZL6 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PRKD2Q9BZL6 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRKD2Q9BZL6 TUBA8-202ENST00000330423 2018 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRKD2Q9BZL6 MRPS7-201ENST00000245539 1406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRKD2Q9BZL6 FAM153A-220ENST00000513554 1437 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PRKD2Q9BZL6 AP000704.1-201ENST00000637940 2182 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PRKD2Q9BZL6 ATG10-203ENST00000458350 1795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRKD2Q9BZL6 NLGN4X-203ENST00000381093 5865 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16■□□□□ 0.15
PRKD2Q9BZL6 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRKD2Q9BZL6 MTHFD1L-203ENST00000367321 3604 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRKD2Q9BZL6 KIAA0391-202ENST00000321130 1589 ntTSL 3 BASIC16■□□□□ 0.15
PRKD2Q9BZL6 LCK-206ENST00000373564 2137 ntTSL 5 BASIC16■□□□□ 0.15
PRKD2Q9BZL6 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16■□□□□ 0.15
PRKD2Q9BZL6 GSPT2-201ENST00000340438 2802 ntAPPRIS P1 BASIC16■□□□□ 0.15
PRKD2Q9BZL6 SSFA2-205ENST00000431877 5150 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRKD2Q9BZL6 ADGRA1-203ENST00000607359 6004 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRKD2Q9BZL6 MYB-209ENST00000442647 3304 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.99■□□□□ 0.15
PRKD2Q9BZL6 CNBP-208ENST00000504813 1549 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.99■□□□□ 0.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.7 ms