Protein–RNA interactions for Protein: Q9BYV6

TRIM55, Tripartite motif-containing protein 55, humanhuman

Predictions only

Length 548 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM55Q9BYV6 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM55Q9BYV6 KIF3C-201ENST00000264712 5344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM55Q9BYV6 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM55Q9BYV6 MPI-203ENST00000535694 1523 ntTSL 2 BASIC15.48■□□□□ 0.07
TRIM55Q9BYV6 SEPT6-204ENST00000360156 2609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM55Q9BYV6 CIC-207ENST00000575354 5473 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM55Q9BYV6 KDM2B-205ENST00000536437 2762 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM55Q9BYV6 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM55Q9BYV6 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM55Q9BYV6 ZBTB17-202ENST00000375743 2745 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM55Q9BYV6 STAT1-203ENST00000392323 2723 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM55Q9BYV6 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM55Q9BYV6 GPRASP1-205ENST00000537097 5980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM55Q9BYV6 ALMS1P1-202ENST00000450720 1601 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM55Q9BYV6 SLC17A3-202ENST00000360657 1750 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM55Q9BYV6 ACER2-201ENST00000340967 2238 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM55Q9BYV6 RAB3IP-204ENST00000378815 2386 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM55Q9BYV6 CXorf36-201ENST00000377934 2513 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM55Q9BYV6 NDC1-201ENST00000371429 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM55Q9BYV6 RNF123-202ENST00000432042 2670 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM55Q9BYV6 CNOT10-201ENST00000328834 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM55Q9BYV6 FBN3-205ENST00000600128 9362 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM55Q9BYV6 PXYLP1-201ENST00000286353 3281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM55Q9BYV6 PPP4R4-201ENST00000304338 3868 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM55Q9BYV6 TP53I11-201ENST00000308212 3683 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM55Q9BYV6 RNLS-201ENST00000331772 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM55Q9BYV6 AC004987.2-201ENST00000395959 1148 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM55Q9BYV6 AC241585.1-201ENST00000433527 519 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM55Q9BYV6 KYAT1-205ENST00000436267 2487 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM55Q9BYV6 AC022201.2-201ENST00000445084 287 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM55Q9BYV6 ZNF219-203ENST00000451119 2918 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM55Q9BYV6 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM55Q9BYV6 SLC50A1-209ENST00000484157 886 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM55Q9BYV6 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM55Q9BYV6 AP002748.3-201ENST00000527092 828 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM55Q9BYV6 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM55Q9BYV6 COX11-202ENST00000571584 1108 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM55Q9BYV6 KF456478.1-201ENST00000585980 472 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM55Q9BYV6 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM55Q9BYV6 NKG7-205ENST00000600427 520 ntTSL 3 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM55Q9BYV6 CECR7-204ENST00000609932 568 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM55Q9BYV6 DFNA5-201ENST00000342947 2590 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM55Q9BYV6 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM55Q9BYV6 HIPK3-203ENST00000456517 7399 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM55Q9BYV6 TDG-209ENST00000544861 1387 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM55Q9BYV6 YME1L1-202ENST00000375972 2517 ntTSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM55Q9BYV6 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM55Q9BYV6 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM55Q9BYV6 SLC25A18-201ENST00000327451 2244 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM55Q9BYV6 HSPA7-201ENST00000445535 1927 ntBASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM55Q9BYV6 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM55Q9BYV6 PORCN-201ENST00000326194 1755 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.47■□□□□ 0.07
TRIM55Q9BYV6 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM55Q9BYV6 ALG9-201ENST00000398006 2345 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM55Q9BYV6 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM55Q9BYV6 PDPR-202ENST00000398122 2734 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM55Q9BYV6 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM55Q9BYV6 NIPAL3-204ENST00000374399 1711 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM55Q9BYV6 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM55Q9BYV6 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM55Q9BYV6 C21orf58-202ENST00000397679 2900 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM55Q9BYV6 CDCA2-201ENST00000330560 3731 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM55Q9BYV6 ATP6V1B1-202ENST00000412314 1805 ntTSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM55Q9BYV6 NEK11-205ENST00000507910 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM55Q9BYV6 PRMT7-202ENST00000441236 2204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM55Q9BYV6 CAMKK2-202ENST00000337174 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM55Q9BYV6 TCEAL3-202ENST00000372627 1113 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM55Q9BYV6 TMEM239-202ENST00000380585 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM55Q9BYV6 FAM159B-201ENST00000389074 847 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM55Q9BYV6 BLCAP-202ENST00000397131 633 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM55Q9BYV6 BLCAP-203ENST00000397134 566 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM55Q9BYV6 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM55Q9BYV6 MRPS18AP1-201ENST00000414458 589 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM55Q9BYV6 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM55Q9BYV6 AC092691.1-201ENST00000484092 554 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM55Q9BYV6 AHSA2-208ENST00000489653 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM55Q9BYV6 AC122138.1-201ENST00000508799 646 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM55Q9BYV6 CHMP4A-204ENST00000530996 967 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM55Q9BYV6 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM55Q9BYV6 AC020978.5-201ENST00000564147 533 ntTSL 4 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM55Q9BYV6 IER3IP1-202ENST00000639845 832 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM55Q9BYV6 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM55Q9BYV6 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM55Q9BYV6 COL7A1-201ENST00000328333 9276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM55Q9BYV6 UBXN11-205ENST00000374221 1792 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM55Q9BYV6 SUPT20H-212ENST00000475892 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.07
TRIM55Q9BYV6 BAIAP3-202ENST00000397488 4583 ntTSL 1 (best) BASIC15.46■□□□□ 0.06
TRIM55Q9BYV6 ZNF785-202ENST00000470110 2867 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.46■□□□□ 0.06
TRIM55Q9BYV6 HTR3A-206ENST00000506841 2221 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM55Q9BYV6 TNIP1-214ENST00000522226 2238 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM55Q9BYV6 VPS9D1-201ENST00000389386 2748 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM55Q9BYV6 MRC2-202ENST00000446119 3201 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM55Q9BYV6 GLYCTK-207ENST00000477382 1304 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM55Q9BYV6 TRPM2-AS-202ENST00000456880 2056 ntTSL 2 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM55Q9BYV6 PIGS-203ENST00000395346 2815 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM55Q9BYV6 OSBPL7-211ENST00000613735 2836 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM55Q9BYV6 LRIG3-201ENST00000320743 4070 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM55Q9BYV6 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM55Q9BYV6 TKT-201ENST00000296289 1931 ntTSL 5 BASIC15.45■□□□□ 0.06
TRIM55Q9BYV6 KRT8-215ENST00000552150 1687 ntTSL 1 (best) BASIC15.45■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.3 ms