Protein–RNA interactions for Protein: Q9BXY5

CAPS2, Calcyphosin-2, humanhuman

Predictions only

Length 557 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAPS2Q9BXY5 TRIP6-209ENST00000619988 1303 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CAPS2Q9BXY5 CORO7-201ENST00000251166 3540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CAPS2Q9BXY5 SUGP2-214ENST00000600377 4752 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CAPS2Q9BXY5 CNTN1-203ENST00000547702 3033 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CAPS2Q9BXY5 LRRC42-201ENST00000319223 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CAPS2Q9BXY5 FLOT2-210ENST00000585169 2585 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CAPS2Q9BXY5 CGREF1-201ENST00000260595 1177 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CAPS2Q9BXY5 TPM2-201ENST00000329305 1018 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CAPS2Q9BXY5 LMO4-201ENST00000370542 1260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CAPS2Q9BXY5 FABP5-202ENST00000396359 986 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CAPS2Q9BXY5 AC064807.1-202ENST00000423716 936 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CAPS2Q9BXY5 AL451069.2-201ENST00000428814 297 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CAPS2Q9BXY5 AC098859.1-201ENST00000502915 1238 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CAPS2Q9BXY5 POLD2P1-201ENST00000511220 997 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CAPS2Q9BXY5 AP002770.1-201ENST00000540547 428 ntTSL 4 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CAPS2Q9BXY5 AL138781.1-202ENST00000563018 775 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CAPS2Q9BXY5 AC024267.1-201ENST00000582320 895 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
CAPS2Q9BXY5 RAB3IP-202ENST00000362025 2055 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CAPS2Q9BXY5 PRMT7-203ENST00000449359 2091 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CAPS2Q9BXY5 MAPKBP1-215ENST00000514566 5394 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CAPS2Q9BXY5 UNC13A-202ENST00000519716 9838 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CAPS2Q9BXY5 GABPB1-202ENST00000359031 1633 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CAPS2Q9BXY5 ZFP2-201ENST00000361362 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CAPS2Q9BXY5 MARK4-201ENST00000262891 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CAPS2Q9BXY5 MBNL1-205ENST00000355460 5941 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CAPS2Q9BXY5 EPS8L3-202ENST00000361965 1971 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CAPS2Q9BXY5 STIP1-203ENST00000358794 2743 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CAPS2Q9BXY5 ST6GAL2-204ENST00000409382 7275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CAPS2Q9BXY5 RAB38-201ENST00000243662 1465 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CAPS2Q9BXY5 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CAPS2Q9BXY5 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
CAPS2Q9BXY5 CDK2AP1-205ENST00000542174 1812 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
CAPS2Q9BXY5 MED12L-202ENST00000309237 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CAPS2Q9BXY5 LINC01225-202ENST00000562339 2113 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CAPS2Q9BXY5 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CAPS2Q9BXY5 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CAPS2Q9BXY5 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CAPS2Q9BXY5 CCDC43-203ENST00000588210 2067 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CAPS2Q9BXY5 LGMN-211ENST00000555699 1728 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CAPS2Q9BXY5 PPIC-201ENST00000306442 1380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CAPS2Q9BXY5 PRR22-202ENST00000419421 1392 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CAPS2Q9BXY5 LRRC20-204ENST00000373224 3095 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CAPS2Q9BXY5 TSEN2-201ENST00000284995 2381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CAPS2Q9BXY5 PCDH8-201ENST00000338862 3708 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CAPS2Q9BXY5 DNM1-212ENST00000627543 4734 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CAPS2Q9BXY5 CAMKK2-202ENST00000337174 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CAPS2Q9BXY5 SEMA4F-202ENST00000357877 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CAPS2Q9BXY5 PNRC1-202ENST00000354922 1345 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CAPS2Q9BXY5 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CAPS2Q9BXY5 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CAPS2Q9BXY5 ABCA7-203ENST00000435683 6211 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CAPS2Q9BXY5 AP5Z1-201ENST00000348624 2901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CAPS2Q9BXY5 TRIM10-204ENST00000449742 3546 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CAPS2Q9BXY5 WWOX-201ENST00000355860 710 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CAPS2Q9BXY5 EXOSC8-202ENST00000389704 1198 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CAPS2Q9BXY5 CXCL1-201ENST00000395761 1097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CAPS2Q9BXY5 CYB5A-203ENST00000397914 619 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CAPS2Q9BXY5 C2orf49-202ENST00000410049 854 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CAPS2Q9BXY5 LINC00029-202ENST00000414668 1117 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CAPS2Q9BXY5 HRAS-204ENST00000417302 1233 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CAPS2Q9BXY5 AC062015.1-201ENST00000423838 1134 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CAPS2Q9BXY5 AC097532.1-201ENST00000440802 322 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CAPS2Q9BXY5 C11orf74-203ENST00000446510 1062 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CAPS2Q9BXY5 DNAJB3-201ENST00000446806 729 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CAPS2Q9BXY5 HRAS-205ENST00000451590 1151 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CAPS2Q9BXY5 MRPL20-203ENST00000482352 1049 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CAPS2Q9BXY5 GATB-205ENST00000508611 605 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CAPS2Q9BXY5 AP000763.4-201ENST00000544674 752 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CAPS2Q9BXY5 AC013565.3-201ENST00000565547 450 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CAPS2Q9BXY5 IGHV3OR16-6-201ENST00000568775 360 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CAPS2Q9BXY5 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CAPS2Q9BXY5 GPR42-202ENST00000597214 1182 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CAPS2Q9BXY5 CITED2-204ENST00000618718 901 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CAPS2Q9BXY5 AC092902.6-201ENST00000641783 218 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
CAPS2Q9BXY5 KCTD7-201ENST00000275532 4795 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
CAPS2Q9BXY5 GABRG3-208ENST00000615808 10768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CAPS2Q9BXY5 ADAR-202ENST00000368474 6625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
CAPS2Q9BXY5 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CAPS2Q9BXY5 MFSD11-217ENST00000590514 1891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CAPS2Q9BXY5 XPNPEP1-201ENST00000322238 2467 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CAPS2Q9BXY5 NUTM2HP-201ENST00000442076 2498 ntBASIC15.77■□□□□ 0.11
CAPS2Q9BXY5 TMEM189-202ENST00000371652 7714 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CAPS2Q9BXY5 TMPRSS3-203ENST00000398405 2754 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CAPS2Q9BXY5 CFAP65-203ENST00000409865 2769 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CAPS2Q9BXY5 GMPPA-202ENST00000341142 1524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CAPS2Q9BXY5 MRPS22-212ENST00000495075 1547 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CAPS2Q9BXY5 PPP1CB-203ENST00000395366 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CAPS2Q9BXY5 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CAPS2Q9BXY5 ANKRD35-201ENST00000355594 3342 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CAPS2Q9BXY5 TNPO2-202ENST00000425528 5122 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CAPS2Q9BXY5 PLCD1-204ENST00000463876 2963 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CAPS2Q9BXY5 POM121-202ENST00000395270 7011 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CAPS2Q9BXY5 LINC01782-201ENST00000591212 2908 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CAPS2Q9BXY5 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CAPS2Q9BXY5 IL3RA-201ENST00000331035 1706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.11
CAPS2Q9BXY5 GPRASP1-205ENST00000537097 5980 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.11
CAPS2Q9BXY5 TUBGCP6-201ENST00000248846 5612 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
CAPS2Q9BXY5 NARF-206ENST00000457415 1668 ntTSL 5 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CAPS2Q9BXY5 AL512306.2-201ENST00000444037 2219 ntTSL 2 BASIC15.76■□□□□ 0.11
CAPS2Q9BXY5 ADCY3-202ENST00000405392 4397 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.76■□□□□ 0.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.9 ms