Protein–RNA interactions for Protein: Q9BTE3

MCMBP, Mini-chromosome maintenance complex-binding protein, humanhuman

Predictions only

Length 642 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MCMBPQ9BTE3 SLC1A5-201ENST00000412532 1750 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MCMBPQ9BTE3 AC023632.2-201ENST00000523011 1789 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MCMBPQ9BTE3 CYP1A1-210ENST00000617691 2521 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MCMBPQ9BTE3 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MCMBPQ9BTE3 PES1-201ENST00000335214 1988 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MCMBPQ9BTE3 AL354702.1-201ENST00000442006 1960 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
MCMBPQ9BTE3 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MCMBPQ9BTE3 SATB2-205ENST00000443023 6194 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MCMBPQ9BTE3 HTR3A-206ENST00000506841 2221 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MCMBPQ9BTE3 AMZ1-201ENST00000312371 5516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MCMBPQ9BTE3 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MCMBPQ9BTE3 POMT1-204ENST00000402686 3038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MCMBPQ9BTE3 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MCMBPQ9BTE3 FAM197Y5-201ENST00000423213 765 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MCMBPQ9BTE3 RCAN3-204ENST00000425530 997 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MCMBPQ9BTE3 TPT1P11-201ENST00000458482 498 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
MCMBPQ9BTE3 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MCMBPQ9BTE3 RN7SL399P-201ENST00000471648 279 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
MCMBPQ9BTE3 AC106897.1-201ENST00000512874 394 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MCMBPQ9BTE3 SERF1B-208ENST00000515588 792 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MCMBPQ9BTE3 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MCMBPQ9BTE3 AC023310.3-201ENST00000557027 670 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
MCMBPQ9BTE3 AC100756.1-201ENST00000562736 682 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
MCMBPQ9BTE3 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
MCMBPQ9BTE3 AC138749.3-201ENST00000567691 622 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
MCMBPQ9BTE3 BRI3BPP1-201ENST00000594224 787 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
MCMBPQ9BTE3 AC116165.1-201ENST00000611806 668 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
MCMBPQ9BTE3 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MCMBPQ9BTE3 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MCMBPQ9BTE3 RCAN3-211ENST00000630217 658 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MCMBPQ9BTE3 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MCMBPQ9BTE3 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MCMBPQ9BTE3 AC027601.5-201ENST00000624065 2482 ntBASIC15.11■□□□□ 0.01
MCMBPQ9BTE3 ADAM15-204ENST00000359280 2874 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MCMBPQ9BTE3 AP1M1-211ENST00000590756 1705 ntTSL 5 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MCMBPQ9BTE3 LMX1B-204ENST00000561065 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MCMBPQ9BTE3 OSBPL5-202ENST00000348039 2798 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MCMBPQ9BTE3 CYB5R3-205ENST00000407623 2153 ntTSL 3 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MCMBPQ9BTE3 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MCMBPQ9BTE3 FANCG-201ENST00000378643 2631 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MCMBPQ9BTE3 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC15.11■□□□□ 0.01
MCMBPQ9BTE3 SH3PXD2B-203ENST00000519643 1394 ntTSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MCMBPQ9BTE3 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MCMBPQ9BTE3 SYT17-201ENST00000355377 3081 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MCMBPQ9BTE3 KCNC2-208ENST00000549446 5625 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.11■□□□□ 0.01
MCMBPQ9BTE3 FOSL2-201ENST00000264716 6708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MCMBPQ9BTE3 PCDHGB5-202ENST00000621169 2670 ntAPPRIS ALT2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MCMBPQ9BTE3 AL121757.1-201ENST00000430097 1836 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MCMBPQ9BTE3 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MCMBPQ9BTE3 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MCMBPQ9BTE3 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MCMBPQ9BTE3 KDM5C-205ENST00000404049 5677 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MCMBPQ9BTE3 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MCMBPQ9BTE3 EPOP-201ENST00000621654 3719 ntAPPRIS P1 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MCMBPQ9BTE3 ALDH4A1-205ENST00000538309 1940 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MCMBPQ9BTE3 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MCMBPQ9BTE3 LINC00163-201ENST00000434081 2155 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MCMBPQ9BTE3 HCG27-201ENST00000383331 1720 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MCMBPQ9BTE3 TGOLN2-203ENST00000398263 6138 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MCMBPQ9BTE3 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
MCMBPQ9BTE3 TAP2-201ENST00000374897 5684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MCMBPQ9BTE3 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MCMBPQ9BTE3 FCN1-201ENST00000371806 1286 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MCMBPQ9BTE3 NTMT1-201ENST00000372480 852 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MCMBPQ9BTE3 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MCMBPQ9BTE3 LBH-203ENST00000404397 543 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MCMBPQ9BTE3 AC018685.2-201ENST00000414065 547 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MCMBPQ9BTE3 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MCMBPQ9BTE3 IQCF3-204ENST00000446775 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MCMBPQ9BTE3 AL627443.1-201ENST00000456477 1035 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MCMBPQ9BTE3 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MCMBPQ9BTE3 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MCMBPQ9BTE3 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MCMBPQ9BTE3 AC104794.3-201ENST00000566840 1248 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
MCMBPQ9BTE3 AC011499.1-201ENST00000586012 581 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MCMBPQ9BTE3 ZNF667-AS1-202ENST00000586091 678 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MCMBPQ9BTE3 AC012615.6-204ENST00000587741 477 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MCMBPQ9BTE3 ZNF667-AS1-204ENST00000588158 921 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MCMBPQ9BTE3 AL049840.4-201ENST00000602422 811 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
MCMBPQ9BTE3 AL390754.1-201ENST00000619088 582 ntBASIC15.1■□□□□ 0.01
MCMBPQ9BTE3 SELENOH-206ENST00000622257 1291 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MCMBPQ9BTE3 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MCMBPQ9BTE3 ALG1-204ENST00000588623 2671 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MCMBPQ9BTE3 GAS2L2-203ENST00000618498 2655 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MCMBPQ9BTE3 C18orf25-206ENST00000619301 5264 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MCMBPQ9BTE3 NDUFV1-202ENST00000415352 1512 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MCMBPQ9BTE3 NFATC4-221ENST00000555453 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MCMBPQ9BTE3 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MCMBPQ9BTE3 VLDLR-202ENST00000382099 3240 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MCMBPQ9BTE3 CPD-201ENST00000225719 9394 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MCMBPQ9BTE3 XRCC1-201ENST00000262887 2802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MCMBPQ9BTE3 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MCMBPQ9BTE3 CDH24-202ENST00000397359 3552 ntTSL 5 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MCMBPQ9BTE3 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MCMBPQ9BTE3 SLC18A2-201ENST00000298472 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.1■□□□□ 0.01
MCMBPQ9BTE3 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MCMBPQ9BTE3 BDKRB2-201ENST00000539359 1600 ntTSL 2 BASIC15.1■□□□□ 0.01
MCMBPQ9BTE3 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.09■□□□□ 0.01
MCMBPQ9BTE3 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
MCMBPQ9BTE3 USP10-201ENST00000219473 3009 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.09■□□□□ 0.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 50.4 ms