Protein–RNA interactions for Protein: Q9BSI4

TINF2, TERF1-interacting nuclear factor 2, humanhuman

Predictions only

Length 451 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TINF2Q9BSI4 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TINF2Q9BSI4 TCF3-204ENST00000453954 3585 ntTSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TINF2Q9BSI4 SUPT20H-201ENST00000350612 2739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TINF2Q9BSI4 PHB-201ENST00000300408 1832 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TINF2Q9BSI4 KIAA1614-AS1-201ENST00000415647 1440 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TINF2Q9BSI4 MARK2-209ENST00000509502 2862 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TINF2Q9BSI4 SURF4-207ENST00000545297 2863 ntTSL 2 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TINF2Q9BSI4 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TINF2Q9BSI4 GCH1-204ENST00000491895 2943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TINF2Q9BSI4 DUSP6-202ENST00000308385 1959 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TINF2Q9BSI4 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC16.86■□□□□ 0.29
TINF2Q9BSI4 ATP2C1-218ENST00000510168 5067 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.86■□□□□ 0.29
TINF2Q9BSI4 L2HGDH-202ENST00000267436 6414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TINF2Q9BSI4 VARS-215ENST00000375663 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TINF2Q9BSI4 XKR7-201ENST00000562532 7844 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TINF2Q9BSI4 PIGQ-201ENST00000026218 2846 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TINF2Q9BSI4 ARNT-212ENST00000515192 2892 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TINF2Q9BSI4 H1F0-201ENST00000340857 2344 ntAPPRIS P1 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TINF2Q9BSI4 CHRNB2-201ENST00000368476 5867 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TINF2Q9BSI4 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TINF2Q9BSI4 PCDHB19P-201ENST00000570871 2371 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
TINF2Q9BSI4 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TINF2Q9BSI4 EVA1A-202ENST00000393913 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TINF2Q9BSI4 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TINF2Q9BSI4 KIF5C-201ENST00000435030 6931 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TINF2Q9BSI4 FCRLB-201ENST00000336830 1193 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TINF2Q9BSI4 COX8C-201ENST00000342144 533 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TINF2Q9BSI4 TOMM7-201ENST00000358435 778 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TINF2Q9BSI4 FCRLB-202ENST00000367944 1172 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TINF2Q9BSI4 FCRLB-203ENST00000367945 1131 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TINF2Q9BSI4 DYDC1-201ENST00000372202 612 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TINF2Q9BSI4 TMEM14B-202ENST00000379542 975 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TINF2Q9BSI4 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TINF2Q9BSI4 AC093151.3-202ENST00000445073 709 ntTSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TINF2Q9BSI4 AC012507.1-201ENST00000454890 600 ntTSL 4 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TINF2Q9BSI4 SAP25-201ENST00000538735 837 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TINF2Q9BSI4 CCDC86-203ENST00000545580 697 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TINF2Q9BSI4 AC008736.2-201ENST00000587554 516 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TINF2Q9BSI4 FAM236A-201ENST00000593662 453 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TINF2Q9BSI4 FAM236B-201ENST00000596535 465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TINF2Q9BSI4 AC011466.3-201ENST00000596563 852 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TINF2Q9BSI4 COX10-AS1-206ENST00000602743 576 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TINF2Q9BSI4 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TINF2Q9BSI4 EIF3J-201ENST00000261868 2569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TINF2Q9BSI4 THOC6-207ENST00000574549 1300 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TINF2Q9BSI4 AP2A2-201ENST00000332231 4656 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TINF2Q9BSI4 APP-204ENST00000357903 3543 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TINF2Q9BSI4 DZIP1L-204ENST00000469243 2107 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TINF2Q9BSI4 CACNA1A-258ENST00000638029 7814 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TINF2Q9BSI4 AC136759.1-203ENST00000527477 2196 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TINF2Q9BSI4 AC136759.1-202ENST00000530858 2194 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
TINF2Q9BSI4 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TINF2Q9BSI4 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TINF2Q9BSI4 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
TINF2Q9BSI4 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TINF2Q9BSI4 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TINF2Q9BSI4 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TINF2Q9BSI4 SLC44A1-203ENST00000374724 3088 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TINF2Q9BSI4 FXYD5-201ENST00000342879 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TINF2Q9BSI4 CREB3L2-204ENST00000456390 2360 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TINF2Q9BSI4 MAGEB2-201ENST00000378988 1610 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TINF2Q9BSI4 HNF1A-216ENST00000617366 2473 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
TINF2Q9BSI4 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
TINF2Q9BSI4 MARCKS-201ENST00000612661 4275 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TINF2Q9BSI4 AL022326.1-201ENST00000434516 1778 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TINF2Q9BSI4 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TINF2Q9BSI4 POLR1D-212ENST00000630983 1931 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TINF2Q9BSI4 HAGH-202ENST00000397356 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TINF2Q9BSI4 SH2B1-203ENST00000359285 3033 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TINF2Q9BSI4 PTPN5-201ENST00000358540 3135 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TINF2Q9BSI4 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TINF2Q9BSI4 DUSP8-201ENST00000331588 4455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TINF2Q9BSI4 RPS16-202ENST00000339471 643 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TINF2Q9BSI4 NUDT1-201ENST00000339737 698 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TINF2Q9BSI4 ALKBH2-201ENST00000343075 1030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TINF2Q9BSI4 NUDT1-202ENST00000343985 771 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TINF2Q9BSI4 FAM3B-203ENST00000398647 864 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TINF2Q9BSI4 FAM3B-204ENST00000398652 1125 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TINF2Q9BSI4 AC026316.1-201ENST00000398900 414 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
TINF2Q9BSI4 TEX33-202ENST00000402860 986 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TINF2Q9BSI4 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
TINF2Q9BSI4 SKA2-202ENST00000437036 625 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TINF2Q9BSI4 ALG3P1-201ENST00000508806 1114 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
TINF2Q9BSI4 POU5F1P2-201ENST00000521750 823 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
TINF2Q9BSI4 CCNC-217ENST00000523985 958 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TINF2Q9BSI4 IQSEC3P1-201ENST00000538799 536 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
TINF2Q9BSI4 C14orf132-204ENST00000556728 774 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TINF2Q9BSI4 MAP3K14-AS1-210ENST00000592422 831 ntTSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TINF2Q9BSI4 DYRK1B-208ENST00000601972 772 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TINF2Q9BSI4 MIR6720-201ENST00000611664 98 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
TINF2Q9BSI4 AC103691.2-201ENST00000618824 433 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
TINF2Q9BSI4 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TINF2Q9BSI4 BNIP1-201ENST00000231668 1339 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TINF2Q9BSI4 SHOX-202ENST00000381575 1351 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TINF2Q9BSI4 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
TINF2Q9BSI4 CLIP4-201ENST00000320081 4293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
TINF2Q9BSI4 CUX1-213ENST00000549414 4452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TINF2Q9BSI4 TRIM9-202ENST00000338969 3312 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TINF2Q9BSI4 C4orf50-202ENST00000531445 6860 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
TINF2Q9BSI4 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.4 ms