Protein–RNA interactions for Protein: Q9BQD1

PMCHL2, Putative pro-MCH-like protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 86 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PMCHL2Q9BQD1 CLN6-221ENST00000637494 765 ntTSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
PMCHL2Q9BQD1 MAGED4B-211ENST00000497164 2482 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
PMCHL2Q9BQD1 ARPC5-201ENST00000294742 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
PMCHL2Q9BQD1 ZNF251-201ENST00000292562 2807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
PMCHL2Q9BQD1 L3MBTL1-206ENST00000427442 3157 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.04□□□□□ -0.64
PMCHL2Q9BQD1 ZFAND3-201ENST00000287218 3366 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
PMCHL2Q9BQD1 MPZ-204ENST00000491222 1824 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
PMCHL2Q9BQD1 ITSN1-208ENST00000399349 5191 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
PMCHL2Q9BQD1 BEX4-202ENST00000372695 1328 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
PMCHL2Q9BQD1 PLCB3-201ENST00000279230 4197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
PMCHL2Q9BQD1 UNC13D-201ENST00000207549 4393 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
PMCHL2Q9BQD1 SGCE-202ENST00000415788 1871 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
PMCHL2Q9BQD1 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
PMCHL2Q9BQD1 SLC35F2-203ENST00000525071 3331 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
PMCHL2Q9BQD1 BRSK2-207ENST00000528710 3528 ntTSL 2 BASIC11.04□□□□□ -0.64
PMCHL2Q9BQD1 GAPVD1-205ENST00000394084 3190 ntTSL 1 (best) BASIC11.04□□□□□ -0.64
PMCHL2Q9BQD1 INTS4P1-201ENST00000438455 1935 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
PMCHL2Q9BQD1 GOLGA3-201ENST00000204726 9252 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
PMCHL2Q9BQD1 DNAJA4-203ENST00000394855 3245 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
PMCHL2Q9BQD1 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
PMCHL2Q9BQD1 ATXN2L-205ENST00000395547 3981 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
PMCHL2Q9BQD1 TRH-202ENST00000507066 1580 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
PMCHL2Q9BQD1 SLC6A2-201ENST00000219833 2858 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
PMCHL2Q9BQD1 NINL-203ENST00000422516 3801 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
PMCHL2Q9BQD1 JMJD6-203ENST00000445478 5303 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
PMCHL2Q9BQD1 SH3TC1-201ENST00000245105 4226 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
PMCHL2Q9BQD1 ACIN1-204ENST00000397341 2738 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
PMCHL2Q9BQD1 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
PMCHL2Q9BQD1 FAM215B-201ENST00000458392 2183 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
PMCHL2Q9BQD1 S100PBP-203ENST00000373476 3320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
PMCHL2Q9BQD1 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
PMCHL2Q9BQD1 TP73-213ENST00000604479 1623 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
PMCHL2Q9BQD1 RNF183-201ENST00000297894 1830 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
PMCHL2Q9BQD1 PIK3R5-220ENST00000623421 4318 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
PMCHL2Q9BQD1 ALCAM-201ENST00000306107 4701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
PMCHL2Q9BQD1 SCAF4-201ENST00000286835 4193 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
PMCHL2Q9BQD1 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
PMCHL2Q9BQD1 INSIG1-202ENST00000342407 1127 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
PMCHL2Q9BQD1 HCG4-201ENST00000418983 998 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
PMCHL2Q9BQD1 LINC00620-201ENST00000419618 996 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
PMCHL2Q9BQD1 HMGB3P22-201ENST00000442010 597 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
PMCHL2Q9BQD1 DHRS12-203ENST00000444610 1162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
PMCHL2Q9BQD1 MUC1-212ENST00000457295 1161 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
PMCHL2Q9BQD1 NDUFA6-202ENST00000498737 1256 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
PMCHL2Q9BQD1 AC136601.1-201ENST00000521803 666 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
PMCHL2Q9BQD1 AC107918.2-201ENST00000530817 355 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
PMCHL2Q9BQD1 L2HGDH-205ENST00000555423 841 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
PMCHL2Q9BQD1 L2HGDH-206ENST00000555610 804 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
PMCHL2Q9BQD1 EIF3J-AS1-205ENST00000560750 1093 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
PMCHL2Q9BQD1 AC007220.1-201ENST00000572466 1055 ntTSL 3 BASIC11.03□□□□□ -0.64
PMCHL2Q9BQD1 METTL23-202ENST00000586200 465 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
PMCHL2Q9BQD1 METTL23-204ENST00000586752 904 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
PMCHL2Q9BQD1 METTL23-212ENST00000590964 1006 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
PMCHL2Q9BQD1 NDUFA6-203ENST00000602404 1080 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
PMCHL2Q9BQD1 HNF1B-206ENST00000620125 1103 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
PMCHL2Q9BQD1 AC090164.4-201ENST00000632451 313 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
PMCHL2Q9BQD1 ZBTB7B-203ENST00000417934 4017 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
PMCHL2Q9BQD1 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
PMCHL2Q9BQD1 PCGF2-206ENST00000618941 1499 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
PMCHL2Q9BQD1 RGS20-201ENST00000276500 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
PMCHL2Q9BQD1 CDK11A-201ENST00000356200 2653 ntTSL 5 BASIC11.03□□□□□ -0.64
PMCHL2Q9BQD1 IFT88-202ENST00000351808 2856 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
PMCHL2Q9BQD1 TTK-201ENST00000230510 3477 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
PMCHL2Q9BQD1 BAIAP3-203ENST00000421665 3875 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
PMCHL2Q9BQD1 COBLL1-225ENST00000629362 3868 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
PMCHL2Q9BQD1 RIOK3-203ENST00000577501 1904 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
PMCHL2Q9BQD1 DNMT3L-201ENST00000270172 1706 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
PMCHL2Q9BQD1 PI4KAP1-204ENST00000612579 1703 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
PMCHL2Q9BQD1 LINC01978-202ENST00000574526 1540 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
PMCHL2Q9BQD1 ITPRIP-201ENST00000278071 6807 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
PMCHL2Q9BQD1 ETV2-205ENST00000479824 1342 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
PMCHL2Q9BQD1 CACNG5-202ENST00000533854 1311 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
PMCHL2Q9BQD1 SLCO2B1-217ENST00000532236 2593 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
PMCHL2Q9BQD1 HS1BP3-201ENST00000304031 2370 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
PMCHL2Q9BQD1 SCML4-203ENST00000369022 2377 ntTSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
PMCHL2Q9BQD1 MYADM-201ENST00000336967 3047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.03□□□□□ -0.64
PMCHL2Q9BQD1 AP003555.1-202ENST00000511013 1755 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
PMCHL2Q9BQD1 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC11.03□□□□□ -0.64
PMCHL2Q9BQD1 CLDN19-202ENST00000372539 1586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
PMCHL2Q9BQD1 CCDC90B-202ENST00000455220 1550 ntTSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
PMCHL2Q9BQD1 SLC45A1-201ENST00000289877 2401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
PMCHL2Q9BQD1 MECR-201ENST00000263702 1353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
PMCHL2Q9BQD1 FUT6-205ENST00000527106 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.03□□□□□ -0.64
PMCHL2Q9BQD1 AOC1-204ENST00000467291 2857 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
PMCHL2Q9BQD1 MAP2K3-203ENST00000361818 2034 ntTSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
PMCHL2Q9BQD1 ZNF846-201ENST00000397902 2016 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
PMCHL2Q9BQD1 BDH1-203ENST00000392379 3546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.64
PMCHL2Q9BQD1 ADD2-202ENST00000355733 2654 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
PMCHL2Q9BQD1 CRACR2A-203ENST00000440314 2697 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.02□□□□□ -0.64
PMCHL2Q9BQD1 KCNJ14-202ENST00000391884 3990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
PMCHL2Q9BQD1 EIF3C-201ENST00000331666 3145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
PMCHL2Q9BQD1 LINC01725-203ENST00000417975 3177 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
PMCHL2Q9BQD1 NFKBIL1-201ENST00000376145 1401 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
PMCHL2Q9BQD1 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
PMCHL2Q9BQD1 SEZ6L-201ENST00000248933 3248 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
PMCHL2Q9BQD1 SEZ6L-210ENST00000629590 3215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.64
PMCHL2Q9BQD1 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC11.02□□□□□ -0.64
PMCHL2Q9BQD1 BDH1-202ENST00000392378 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
PMCHL2Q9BQD1 AGAP5-201ENST00000374094 2394 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.02□□□□□ -0.65
PMCHL2Q9BQD1 ADCY7-202ENST00000394697 6213 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.02□□□□□ -0.65
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 65.5 ms