Protein–RNA interactions for Protein: Q99985

SEMA3C, Semaphorin-3C, humanhuman

Predictions only

Length 751 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SEMA3CQ99985 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEMA3CQ99985 C10orf62-201ENST00000370640 1208 ntAPPRIS P1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEMA3CQ99985 AGTRAP-202ENST00000376627 1055 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEMA3CQ99985 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEMA3CQ99985 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SEMA3CQ99985 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SEMA3CQ99985 AC022137.2-201ENST00000503482 481 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SEMA3CQ99985 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SEMA3CQ99985 PTP4A1P2-201ENST00000546033 454 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SEMA3CQ99985 AC106886.1-201ENST00000568660 600 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SEMA3CQ99985 PIGL-212ENST00000581006 554 ntTSL 4 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEMA3CQ99985 AC011489.1-202ENST00000586556 618 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEMA3CQ99985 RPS15-205ENST00000586686 562 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEMA3CQ99985 RPS15-208ENST00000591804 711 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEMA3CQ99985 RPS15-209ENST00000592588 510 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEMA3CQ99985 IGHV3-72-202ENST00000621503 303 ntBASIC15.44■□□□□ 0.06
SEMA3CQ99985 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEMA3CQ99985 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEMA3CQ99985 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEMA3CQ99985 TDRKH-204ENST00000368825 2651 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEMA3CQ99985 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEMA3CQ99985 GRID2IP-202ENST00000452113 3428 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEMA3CQ99985 CADPS2-205ENST00000449022 4073 ntTSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEMA3CQ99985 DHODH-201ENST00000219240 2426 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEMA3CQ99985 PPM1F-202ENST00000397495 1778 ntTSL 2 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEMA3CQ99985 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEMA3CQ99985 CYTH2-214ENST00000641098 2721 ntAPPRIS ALT1 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEMA3CQ99985 POM121-203ENST00000434423 3750 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.44■□□□□ 0.06
SEMA3CQ99985 RPTOR-203ENST00000570891 2286 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEMA3CQ99985 PDP1-201ENST00000297598 4272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEMA3CQ99985 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEMA3CQ99985 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEMA3CQ99985 PCDHA4-203ENST00000530339 5251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEMA3CQ99985 HDHD3-201ENST00000238379 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEMA3CQ99985 PLXNB1-202ENST00000358536 7308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEMA3CQ99985 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEMA3CQ99985 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEMA3CQ99985 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEMA3CQ99985 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEMA3CQ99985 RPL39L-201ENST00000296277 756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEMA3CQ99985 KRTAP19-3-201ENST00000334063 522 ntAPPRIS P1 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEMA3CQ99985 TNNI1-203ENST00000367312 1100 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEMA3CQ99985 ZFAND4-203ENST00000374366 3821 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEMA3CQ99985 NDUFC1-203ENST00000394228 761 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEMA3CQ99985 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEMA3CQ99985 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SEMA3CQ99985 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEMA3CQ99985 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SEMA3CQ99985 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SEMA3CQ99985 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEMA3CQ99985 TMEM14B-212ENST00000475942 992 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEMA3CQ99985 ZFPL1-207ENST00000526791 384 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEMA3CQ99985 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEMA3CQ99985 CSF1R-209ENST00000543093 921 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEMA3CQ99985 MRPL52-211ENST00000555536 451 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEMA3CQ99985 GCHFR-206ENST00000561160 572 ntTSL 3 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEMA3CQ99985 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEMA3CQ99985 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEMA3CQ99985 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEMA3CQ99985 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEMA3CQ99985 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEMA3CQ99985 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEMA3CQ99985 TXNDC2-206ENST00000611534 2066 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEMA3CQ99985 USH1C-207ENST00000527720 2278 ntTSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEMA3CQ99985 AJ011931.1-201ENST00000618749 2492 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SEMA3CQ99985 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEMA3CQ99985 AC011270.2-201ENST00000624293 2550 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SEMA3CQ99985 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEMA3CQ99985 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEMA3CQ99985 DHCR7-202ENST00000407721 2601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEMA3CQ99985 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEMA3CQ99985 REC8-209ENST00000611366 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEMA3CQ99985 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEMA3CQ99985 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEMA3CQ99985 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEMA3CQ99985 SLC6A11-201ENST00000254488 4296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEMA3CQ99985 SLC25A36-201ENST00000324194 1301 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.43■□□□□ 0.06
SEMA3CQ99985 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC15.43■□□□□ 0.06
SEMA3CQ99985 BDP1-202ENST00000380675 2861 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEMA3CQ99985 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEMA3CQ99985 UBE2D3-207ENST00000394801 2368 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEMA3CQ99985 KDM3A-201ENST00000312912 4886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEMA3CQ99985 TBC1D3G-201ENST00000569055 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEMA3CQ99985 TBC1D3H-201ENST00000610350 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEMA3CQ99985 TBC1D3L-202ENST00000617678 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEMA3CQ99985 NR2E3-203ENST00000621098 2064 ntTSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEMA3CQ99985 ADCYAP1R1-204ENST00000409489 1761 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEMA3CQ99985 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEMA3CQ99985 SPON1-201ENST00000576479 4837 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEMA3CQ99985 ANKRD50-202ENST00000515641 4212 ntTSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEMA3CQ99985 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEMA3CQ99985 ENOSF1-209ENST00000580982 1397 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEMA3CQ99985 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEMA3CQ99985 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEMA3CQ99985 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEMA3CQ99985 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEMA3CQ99985 LSM5-207ENST00000410044 687 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEMA3CQ99985 AC105940.2-201ENST00000421055 380 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEMA3CQ99985 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
SEMA3CQ99985 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC15.42■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 63.3 ms