Protein–RNA interactions for Protein: Q96S38

RPS6KC1, Ribosomal protein S6 kinase delta-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,066 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RPS6KC1Q96S38 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RPS6KC1Q96S38 SLC2A13-201ENST00000280871 7003 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RPS6KC1Q96S38 CPEB1-211ENST00000615198 2112 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RPS6KC1Q96S38 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RPS6KC1Q96S38 GRSF1-208ENST00000545193 2682 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RPS6KC1Q96S38 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RPS6KC1Q96S38 HNF4A-202ENST00000316673 1470 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RPS6KC1Q96S38 SLC26A1-202ENST00000398516 3109 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RPS6KC1Q96S38 ALDOA-225ENST00000569545 1359 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RPS6KC1Q96S38 LHB-201ENST00000221421 514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RPS6KC1Q96S38 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RPS6KC1Q96S38 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RPS6KC1Q96S38 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RPS6KC1Q96S38 OR10H1-201ENST00000334920 1124 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RPS6KC1Q96S38 TSPAN32-204ENST00000381121 999 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RPS6KC1Q96S38 NGDN-202ENST00000408901 1143 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RPS6KC1Q96S38 MORN2-204ENST00000409665 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RPS6KC1Q96S38 TMEM107-204ENST00000437139 747 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RPS6KC1Q96S38 AL356489.1-201ENST00000449144 1144 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RPS6KC1Q96S38 KLC4-205ENST00000458460 1251 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RPS6KC1Q96S38 TMEM14B-204ENST00000461342 559 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RPS6KC1Q96S38 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
RPS6KC1Q96S38 GSTZ1-219ENST00000557639 873 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RPS6KC1Q96S38 CX3CL1-203ENST00000564948 563 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RPS6KC1Q96S38 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RPS6KC1Q96S38 ANAPC11-215ENST00000578550 599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RPS6KC1Q96S38 INO80C-210ENST00000590757 595 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RPS6KC1Q96S38 AC244669.2-201ENST00000612320 853 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
RPS6KC1Q96S38 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RPS6KC1Q96S38 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RPS6KC1Q96S38 TNIP1-219ENST00000524280 1716 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RPS6KC1Q96S38 CHD4-210ENST00000544040 6514 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RPS6KC1Q96S38 CYP4F22-201ENST00000269703 2641 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RPS6KC1Q96S38 KRAS-202ENST00000311936 5765 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RPS6KC1Q96S38 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RPS6KC1Q96S38 PI16-203ENST00000611814 2083 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RPS6KC1Q96S38 HSP90B1-201ENST00000299767 2858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RPS6KC1Q96S38 UBE3B-201ENST00000340074 1448 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RPS6KC1Q96S38 EHHADH-203ENST00000456310 2577 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
RPS6KC1Q96S38 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RPS6KC1Q96S38 TUBB1P2-201ENST00000422712 1306 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
RPS6KC1Q96S38 TUBB1P1-201ENST00000503144 1300 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
RPS6KC1Q96S38 ZNF212-201ENST00000335870 2810 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RPS6KC1Q96S38 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
RPS6KC1Q96S38 CALR-201ENST00000316448 1903 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RPS6KC1Q96S38 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RPS6KC1Q96S38 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RPS6KC1Q96S38 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RPS6KC1Q96S38 SH3BP2-207ENST00000503393 9158 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RPS6KC1Q96S38 ITGB7-201ENST00000267082 2867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RPS6KC1Q96S38 PAK4-208ENST00000599386 5735 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RPS6KC1Q96S38 NLRX1-202ENST00000409109 4092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RPS6KC1Q96S38 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RPS6KC1Q96S38 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RPS6KC1Q96S38 ZG16B-201ENST00000382280 831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RPS6KC1Q96S38 PACSIN2-204ENST00000403744 2110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RPS6KC1Q96S38 MIR1908-201ENST00000410394 80 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
RPS6KC1Q96S38 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
RPS6KC1Q96S38 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RPS6KC1Q96S38 GEMIN4-202ENST00000437269 1182 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RPS6KC1Q96S38 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
RPS6KC1Q96S38 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RPS6KC1Q96S38 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
RPS6KC1Q96S38 CD63-208ENST00000549117 1233 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RPS6KC1Q96S38 SDR39U1-212ENST00000555365 976 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RPS6KC1Q96S38 AL133153.2-201ENST00000557524 303 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RPS6KC1Q96S38 AC024619.2-201ENST00000581964 517 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RPS6KC1Q96S38 LARP4-220ENST00000615080 856 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RPS6KC1Q96S38 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RPS6KC1Q96S38 ITPRIPL2-201ENST00000381440 7247 ntAPPRIS P1 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RPS6KC1Q96S38 CYP2E1-201ENST00000252945 1667 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RPS6KC1Q96S38 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
RPS6KC1Q96S38 FAM156A-206ENST00000612915 2233 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
RPS6KC1Q96S38 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RPS6KC1Q96S38 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RPS6KC1Q96S38 NFATC4-213ENST00000554591 2893 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RPS6KC1Q96S38 CDR2L-201ENST00000337231 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RPS6KC1Q96S38 NF2-210ENST00000413209 4733 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RPS6KC1Q96S38 PIKFYVE-202ENST00000308862 1640 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RPS6KC1Q96S38 AC020659.1-201ENST00000309874 2900 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RPS6KC1Q96S38 HS2ST1-201ENST00000370550 6736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RPS6KC1Q96S38 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RPS6KC1Q96S38 FMR1-203ENST00000370470 1774 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RPS6KC1Q96S38 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RPS6KC1Q96S38 PDGFRL-203ENST00000541323 1905 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RPS6KC1Q96S38 TCP1-201ENST00000321394 2499 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RPS6KC1Q96S38 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RPS6KC1Q96S38 EDN2-201ENST00000372587 1241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RPS6KC1Q96S38 STK40-202ENST00000373129 3846 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RPS6KC1Q96S38 CDKN1A-202ENST00000373711 793 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RPS6KC1Q96S38 PFDN6-202ENST00000374607 598 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RPS6KC1Q96S38 PFDN6-203ENST00000374610 521 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RPS6KC1Q96S38 AL583835.2-202ENST00000421363 1104 ntTSL 1 (best) BASIC16.67■□□□□ 0.26
RPS6KC1Q96S38 FAM21FP-201ENST00000426241 1131 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
RPS6KC1Q96S38 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RPS6KC1Q96S38 AL355994.2-201ENST00000447882 704 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
RPS6KC1Q96S38 AC113608.2-201ENST00000448379 487 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RPS6KC1Q96S38 FAM8A2P-201ENST00000528813 1142 ntBASIC16.67■□□□□ 0.26
RPS6KC1Q96S38 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC16.67■□□□□ 0.26
RPS6KC1Q96S38 AC000032.1-201ENST00000562538 491 ntTSL 2 BASIC16.67■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.3 ms