Protein–RNA interactions for Protein: Q96RV3

PCNX1, Pecanex-like protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 2,341 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCNX1Q96RV3 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PCNX1Q96RV3 PSMB5-202ENST00000361611 1294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PCNX1Q96RV3 AC090735.1-201ENST00000523881 488 ntTSL 4 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PCNX1Q96RV3 AL136309.4-201ENST00000527831 640 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PCNX1Q96RV3 AL160314.3-201ENST00000556041 767 ntBASIC13.36□□□□□ -0.27
PCNX1Q96RV3 AL135838.1-202ENST00000556411 441 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PCNX1Q96RV3 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PCNX1Q96RV3 ZNF800-201ENST00000265827 4203 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PCNX1Q96RV3 LHCGR-202ENST00000401907 1477 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PCNX1Q96RV3 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PCNX1Q96RV3 CD300A-205ENST00000577511 1459 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PCNX1Q96RV3 GAL3ST4-201ENST00000360039 2537 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PCNX1Q96RV3 LSP1-204ENST00000406638 2640 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PCNX1Q96RV3 BTC-201ENST00000395743 2816 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PCNX1Q96RV3 SHISA6-203ENST00000432116 7518 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PCNX1Q96RV3 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PCNX1Q96RV3 NETO2-202ENST00000562435 7481 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PCNX1Q96RV3 CD27-201ENST00000266557 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PCNX1Q96RV3 AC104667.2-202ENST00000452801 1301 ntTSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PCNX1Q96RV3 SUMO1-203ENST00000392246 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PCNX1Q96RV3 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PCNX1Q96RV3 TNIP1-202ENST00000389378 2935 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.36□□□□□ -0.27
PCNX1Q96RV3 GDF6-201ENST00000287020 3701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.36□□□□□ -0.27
PCNX1Q96RV3 SLC17A5-201ENST00000355773 3455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PCNX1Q96RV3 H6PD-201ENST00000377403 9146 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PCNX1Q96RV3 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PCNX1Q96RV3 SEMA5B-211ENST00000616742 4933 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PCNX1Q96RV3 SLC51A-201ENST00000296327 1463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PCNX1Q96RV3 CSNK2B-201ENST00000375865 908 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PCNX1Q96RV3 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
PCNX1Q96RV3 PEX13-203ENST00000414712 1014 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PCNX1Q96RV3 FKBP11-212ENST00000552878 1052 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PCNX1Q96RV3 AC007342.4-201ENST00000566383 584 ntTSL 4 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PCNX1Q96RV3 LINC00621-201ENST00000577004 1177 ntTSL 4 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PCNX1Q96RV3 AC008763.1-201ENST00000601797 843 ntTSL 3 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PCNX1Q96RV3 AC090164.2-201ENST00000611487 516 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
PCNX1Q96RV3 NDUFB5-216ENST00000611971 951 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PCNX1Q96RV3 PRRC2B-210ENST00000638390 1084 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PCNX1Q96RV3 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PCNX1Q96RV3 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PCNX1Q96RV3 C3orf62-201ENST00000343010 4235 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PCNX1Q96RV3 FAM156B-202ENST00000509613 1701 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PCNX1Q96RV3 TNIP1-217ENST00000523200 1743 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PCNX1Q96RV3 ADAMTS16-201ENST00000274181 4979 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PCNX1Q96RV3 TK1-201ENST00000301634 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PCNX1Q96RV3 ILF3-203ENST00000449870 6119 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PCNX1Q96RV3 TAOK2-202ENST00000308893 5169 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PCNX1Q96RV3 CEACAM19-202ENST00000403660 1982 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PCNX1Q96RV3 ARHGEF25-202ENST00000333972 2246 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PCNX1Q96RV3 AC008770.3-201ENST00000590798 1562 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PCNX1Q96RV3 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PCNX1Q96RV3 GPBAR1-203ENST00000521462 1465 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PCNX1Q96RV3 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PCNX1Q96RV3 KLHDC8A-201ENST00000367155 2928 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PCNX1Q96RV3 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PCNX1Q96RV3 AC007952.2-201ENST00000399091 1176 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PCNX1Q96RV3 GSTK1-202ENST00000409500 888 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PCNX1Q96RV3 ACTG1P2-201ENST00000415776 1125 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
PCNX1Q96RV3 AC007274.2-201ENST00000421675 662 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
PCNX1Q96RV3 ACTG1P11-201ENST00000425411 1125 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
PCNX1Q96RV3 IGHV4-4-201ENST00000455737 417 ntAPPRIS P1 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PCNX1Q96RV3 AL161670.2-201ENST00000557650 1227 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
PCNX1Q96RV3 AP000346.4-201ENST00000614827 381 ntBASIC13.35□□□□□ -0.27
PCNX1Q96RV3 PAX3-206ENST00000392070 2258 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PCNX1Q96RV3 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PCNX1Q96RV3 FAM104A-202ENST00000405159 2865 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PCNX1Q96RV3 DYNC1I1-212ENST00000630942 2249 ntTSL 2 BASIC13.35□□□□□ -0.27
PCNX1Q96RV3 CCNE1-203ENST00000444983 1680 ntTSL 1 (best) BASIC13.35□□□□□ -0.27
PCNX1Q96RV3 SERPINF2-201ENST00000324015 2284 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PCNX1Q96RV3 LUC7L3-202ENST00000393227 2284 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PCNX1Q96RV3 WARS-232ENST00000556645 2508 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PCNX1Q96RV3 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PCNX1Q96RV3 NELFA-203ENST00000411638 2199 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PCNX1Q96RV3 GSR-201ENST00000221130 3119 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PCNX1Q96RV3 ZCCHC17-207ENST00000616859 1458 ntTSL 4 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PCNX1Q96RV3 ZCCHC17-208ENST00000618216 1489 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PCNX1Q96RV3 BTBD3-201ENST00000254977 4686 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PCNX1Q96RV3 EPHA2-201ENST00000358432 3964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PCNX1Q96RV3 CARMIL3-201ENST00000342740 4597 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PCNX1Q96RV3 PPIL3-201ENST00000286175 1370 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PCNX1Q96RV3 MPV17L-201ENST00000287594 5820 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PCNX1Q96RV3 LINGO1-201ENST00000355300 3055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PCNX1Q96RV3 TCL1B-201ENST00000340722 1166 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PCNX1Q96RV3 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PCNX1Q96RV3 NIF3L1-205ENST00000409588 1269 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PCNX1Q96RV3 AL021707.5-201ENST00000420118 461 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PCNX1Q96RV3 AL590617.2-201ENST00000432673 917 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PCNX1Q96RV3 AL157935.2-201ENST00000476274 1071 ntTSL 5 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PCNX1Q96RV3 AC091390.4-201ENST00000484974 491 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PCNX1Q96RV3 GATD1-205ENST00000524550 995 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PCNX1Q96RV3 TP53AIP1-204ENST00000530777 363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PCNX1Q96RV3 AC061992.1-201ENST00000592569 777 ntTSL 3 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PCNX1Q96RV3 AL133499.1-201ENST00000596207 608 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
PCNX1Q96RV3 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
PCNX1Q96RV3 AC138894.2-201ENST00000602838 371 ntBASIC13.34□□□□□ -0.27
PCNX1Q96RV3 LOH12CR2-201ENST00000381800 1540 ntTSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PCNX1Q96RV3 ELK1-203ENST00000376983 2258 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PCNX1Q96RV3 ATP6V0E2-207ENST00000479613 1666 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
PCNX1Q96RV3 SCPEP1-201ENST00000262288 1942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.34□□□□□ -0.27
PCNX1Q96RV3 ENDOV-213ENST00000520367 2680 ntTSL 2 BASIC13.34□□□□□ -0.27
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