Protein–RNA interactions for Protein: Q96DX4

RSPRY1, RING finger and SPRY domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 576 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RSPRY1Q96DX4 PRODH2-201ENST00000301175 1677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RSPRY1Q96DX4 PLPPR5-201ENST00000263177 3288 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RSPRY1Q96DX4 MINK1-202ENST00000355280 4961 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RSPRY1Q96DX4 KIFC2-201ENST00000301332 3646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RSPRY1Q96DX4 WDR83-201ENST00000418543 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RSPRY1Q96DX4 PPP1CB-202ENST00000358506 4771 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RSPRY1Q96DX4 STRN-202ENST00000379213 2254 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RSPRY1Q96DX4 KTN1-AS1-202ENST00000412224 2185 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RSPRY1Q96DX4 CRYBA4-201ENST00000354760 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RSPRY1Q96DX4 HNRNPA1P41-201ENST00000397777 928 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
RSPRY1Q96DX4 AC073316.1-202ENST00000402115 988 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RSPRY1Q96DX4 ISCA2P1-201ENST00000425548 448 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
RSPRY1Q96DX4 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RSPRY1Q96DX4 IGHV4-4-201ENST00000455737 417 ntAPPRIS P1 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RSPRY1Q96DX4 AC009403.1-204ENST00000469539 597 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RSPRY1Q96DX4 AL132642.1-201ENST00000557646 553 ntTSL 4 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RSPRY1Q96DX4 CDIP1-202ENST00000562334 1205 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RSPRY1Q96DX4 LINC01229-204ENST00000568751 720 ntTSL 3 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RSPRY1Q96DX4 AC020922.3-201ENST00000595064 547 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
RSPRY1Q96DX4 AC024941.2-201ENST00000625763 493 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RSPRY1Q96DX4 TUBB4B-201ENST00000340384 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RSPRY1Q96DX4 C2orf50-201ENST00000381585 2684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RSPRY1Q96DX4 SEMA5B-202ENST00000357599 4792 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RSPRY1Q96DX4 BMP3-201ENST00000282701 5734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RSPRY1Q96DX4 DNAJA3-202ENST00000355296 2591 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RSPRY1Q96DX4 HDHD2-201ENST00000300605 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RSPRY1Q96DX4 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
RSPRY1Q96DX4 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RSPRY1Q96DX4 CTDP1-201ENST00000075430 3538 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RSPRY1Q96DX4 TBL2-201ENST00000305632 3161 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RSPRY1Q96DX4 SLC4A3-204ENST00000373760 4134 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RSPRY1Q96DX4 CALCR-203ENST00000394441 1774 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RSPRY1Q96DX4 PDK2-201ENST00000007708 2384 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RSPRY1Q96DX4 SALL3-206ENST00000616649 2958 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RSPRY1Q96DX4 EPN1-203ENST00000411543 2621 ntTSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RSPRY1Q96DX4 RUFY2-205ENST00000454950 2613 ntTSL 2 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RSPRY1Q96DX4 AC006058.4-201ENST00000624016 1670 ntBASIC15.41■□□□□ 0.06
RSPRY1Q96DX4 NAP1L4-201ENST00000380542 2511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RSPRY1Q96DX4 ANXA11-203ENST00000422982 2534 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RSPRY1Q96DX4 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RSPRY1Q96DX4 AMT-239ENST00000636865 1914 ntTSL 5 BASIC15.41■□□□□ 0.06
RSPRY1Q96DX4 TJP1-201ENST00000346128 7950 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RSPRY1Q96DX4 YIPF3-202ENST00000372422 1576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RSPRY1Q96DX4 CDC42EP4-201ENST00000335793 3272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.41■□□□□ 0.06
RSPRY1Q96DX4 TSSK2-201ENST00000399635 1816 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RSPRY1Q96DX4 GRIN2C-202ENST00000347612 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RSPRY1Q96DX4 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RSPRY1Q96DX4 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
RSPRY1Q96DX4 KIAA1147-202ENST00000536163 7296 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RSPRY1Q96DX4 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RSPRY1Q96DX4 UBR3-201ENST00000272793 8005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RSPRY1Q96DX4 NSMCE3-201ENST00000332303 4838 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RSPRY1Q96DX4 SCRIB-202ENST00000356994 5218 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RSPRY1Q96DX4 NBPF11-205ENST00000615281 5494 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RSPRY1Q96DX4 NRBF2-201ENST00000277746 1853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RSPRY1Q96DX4 PTGDR2-201ENST00000332539 2895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RSPRY1Q96DX4 FAM83G-202ENST00000388995 5266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RSPRY1Q96DX4 DOC2GP-204ENST00000639052 2548 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
RSPRY1Q96DX4 RNPS1-220ENST00000566458 2037 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RSPRY1Q96DX4 CRLF2-201ENST00000381566 1545 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RSPRY1Q96DX4 ZFP28-201ENST00000301318 4096 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RSPRY1Q96DX4 CNKSR1-214ENST00000531191 2673 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RSPRY1Q96DX4 ALG1L-201ENST00000340333 805 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RSPRY1Q96DX4 NUDT1-203ENST00000356714 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RSPRY1Q96DX4 RBM38-204ENST00000371219 760 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RSPRY1Q96DX4 NRM-202ENST00000376420 1228 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RSPRY1Q96DX4 NRSN2-201ENST00000382285 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RSPRY1Q96DX4 IGHV3-21-201ENST00000390607 430 ntAPPRIS P1 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RSPRY1Q96DX4 NUDT1-204ENST00000397046 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RSPRY1Q96DX4 TPT1-AS1-203ENST00000412946 744 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RSPRY1Q96DX4 AL391832.2-201ENST00000418557 889 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RSPRY1Q96DX4 PDIA3P2-201ENST00000428073 158 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
RSPRY1Q96DX4 LINC01088-201ENST00000437737 973 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RSPRY1Q96DX4 AL139246.4-201ENST00000442305 514 ntTSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RSPRY1Q96DX4 PRSS30P-205ENST00000506153 699 ntTSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RSPRY1Q96DX4 AC116345.2-201ENST00000512837 523 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
RSPRY1Q96DX4 SCARNA21-201ENST00000517026 139 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
RSPRY1Q96DX4 TP53AIP1-204ENST00000530777 363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RSPRY1Q96DX4 AC009779.1-201ENST00000551138 283 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
RSPRY1Q96DX4 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RSPRY1Q96DX4 SLIRP-210ENST00000557431 725 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RSPRY1Q96DX4 CROCCP3-204ENST00000590118 574 ntTSL 4 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RSPRY1Q96DX4 AC008805.1-201ENST00000590892 364 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
RSPRY1Q96DX4 AC011498.6-201ENST00000592034 510 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RSPRY1Q96DX4 AL132994.2-201ENST00000603120 687 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
RSPRY1Q96DX4 U62317.3-201ENST00000608319 855 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
RSPRY1Q96DX4 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RSPRY1Q96DX4 ALG1L-202ENST00000611639 701 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RSPRY1Q96DX4 Metazoa_SRP.69-201ENST00000615730 281 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
RSPRY1Q96DX4 Z98259.2-201ENST00000641583 609 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
RSPRY1Q96DX4 STAR-201ENST00000276449 1929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RSPRY1Q96DX4 CACNA1A-202ENST00000573710 7569 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RSPRY1Q96DX4 MTHFD1L-211ENST00000611279 3475 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RSPRY1Q96DX4 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
RSPRY1Q96DX4 CPA5-201ENST00000393213 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RSPRY1Q96DX4 GCNT7-201ENST00000243913 2064 ntTSL 2 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RSPRY1Q96DX4 REXO1L2P-201ENST00000425429 2069 ntBASIC15.4■□□□□ 0.06
RSPRY1Q96DX4 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
RSPRY1Q96DX4 SPHK2-202ENST00000340932 2492 ntTSL 5 BASIC15.4■□□□□ 0.06
RSPRY1Q96DX4 LAPTM5-201ENST00000294507 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.4■□□□□ 0.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.5 ms