Protein–RNA interactions for Protein: Q969G3

SMARCE1, SWI/SNF-related matrix-associated actin-dependent regulator of chromatin subfamily E member 1, humanhuman

Predictions only

Length 411 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SMARCE1Q969G3 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SMARCE1Q969G3 SFT2D2-204ENST00000630869 1073 ntTSL 4 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SMARCE1Q969G3 PHLDB2-203ENST00000412622 5996 ntTSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SMARCE1Q969G3 PTPRU-204ENST00000428026 5550 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SMARCE1Q969G3 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SMARCE1Q969G3 WRAP53-210ENST00000534050 1736 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SMARCE1Q969G3 GLUL-203ENST00000339526 3942 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.35
SMARCE1Q969G3 NXF1-213ENST00000532297 2795 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SMARCE1Q969G3 AC010327.3-201ENST00000591665 1643 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SMARCE1Q969G3 LPO-210ENST00000582328 2680 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.21■□□□□ 0.35
SMARCE1Q969G3 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
SMARCE1Q969G3 NUP50-201ENST00000347635 5233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
SMARCE1Q969G3 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
SMARCE1Q969G3 PDE1B-207ENST00000550620 2150 ntTSL 1 (best) BASIC17.21■□□□□ 0.34
SMARCE1Q969G3 CD8A-203ENST00000409511 3048 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC17.21■□□□□ 0.34
SMARCE1Q969G3 VARS2-211ENST00000541562 3566 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SMARCE1Q969G3 ZNF365-207ENST00000410046 3379 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SMARCE1Q969G3 FLI1-205ENST00000527786 4127 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SMARCE1Q969G3 OR2V1-205ENST00000642036 2609 ntAPPRIS P1 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SMARCE1Q969G3 SPRED1-201ENST00000299084 7780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SMARCE1Q969G3 SLC52A3-202ENST00000381944 3060 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SMARCE1Q969G3 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SMARCE1Q969G3 ST3GAL3-208ENST00000361392 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SMARCE1Q969G3 SLC9A7P1-202ENST00000556476 2239 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SMARCE1Q969G3 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SMARCE1Q969G3 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SMARCE1Q969G3 SAFB2-201ENST00000252542 3371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SMARCE1Q969G3 SRSF5-203ENST00000553521 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SMARCE1Q969G3 ZNF524-201ENST00000301073 1102 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SMARCE1Q969G3 CYB561D1-202ENST00000369868 1085 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SMARCE1Q969G3 WRB-204ENST00000398753 699 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SMARCE1Q969G3 LINC01534-201ENST00000425254 815 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SMARCE1Q969G3 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SMARCE1Q969G3 KLF2P3-201ENST00000451977 1087 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SMARCE1Q969G3 OST4-203ENST00000456793 561 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SMARCE1Q969G3 NSUN5P1-208ENST00000473960 500 ntTSL 3 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SMARCE1Q969G3 AC092910.3-201ENST00000484076 969 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SMARCE1Q969G3 AC044860.1-202ENST00000559481 777 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SMARCE1Q969G3 TRAPPC2L-206ENST00000564365 1060 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SMARCE1Q969G3 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SMARCE1Q969G3 RAB34-223ENST00000636154 730 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SMARCE1Q969G3 ATP2B3-202ENST00000349466 4280 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SMARCE1Q969G3 APC2-201ENST00000233607 10151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SMARCE1Q969G3 SEPT8-206ENST00000378706 4168 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SMARCE1Q969G3 ASAP1-202ENST00000518721 5507 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SMARCE1Q969G3 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SMARCE1Q969G3 CAMKK2-202ENST00000337174 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SMARCE1Q969G3 SF1-209ENST00000433274 2317 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SMARCE1Q969G3 KCNT1-207ENST00000487664 3845 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SMARCE1Q969G3 SLC38A5-212ENST00000619100 2100 ntTSL 2 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SMARCE1Q969G3 SLC38A5-214ENST00000622196 2100 ntTSL 5 BASIC17.2■□□□□ 0.34
SMARCE1Q969G3 URAHP-202ENST00000409873 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.2■□□□□ 0.34
SMARCE1Q969G3 AC087499.5-201ENST00000452760 1342 ntBASIC17.2■□□□□ 0.34
SMARCE1Q969G3 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SMARCE1Q969G3 TUBBP5-201ENST00000290377 1563 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SMARCE1Q969G3 GPANK1-203ENST00000375896 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SMARCE1Q969G3 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SMARCE1Q969G3 GFY-202ENST00000610896 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SMARCE1Q969G3 ANKLE2-210ENST00000542657 2446 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SMARCE1Q969G3 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SMARCE1Q969G3 SYNPO2L-202ENST00000394810 4921 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SMARCE1Q969G3 JADE2-203ENST00000395003 6465 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SMARCE1Q969G3 FGF7P3-202ENST00000640245 1707 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SMARCE1Q969G3 TCOF1-201ENST00000323668 4832 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SMARCE1Q969G3 ADAM15-203ENST00000356955 2949 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SMARCE1Q969G3 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SMARCE1Q969G3 ZNF398-205ENST00000491174 2232 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SMARCE1Q969G3 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SMARCE1Q969G3 TOR2A-202ENST00000373281 2477 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SMARCE1Q969G3 GCK-204ENST00000403799 2729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SMARCE1Q969G3 RSPRY1-202ENST00000537866 3586 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SMARCE1Q969G3 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SMARCE1Q969G3 TFF2-201ENST00000291526 737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SMARCE1Q969G3 CA4-201ENST00000300900 1154 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SMARCE1Q969G3 BAD-202ENST00000394531 631 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SMARCE1Q969G3 AC025183.1-201ENST00000506335 425 ntTSL 4 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SMARCE1Q969G3 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SMARCE1Q969G3 AC137894.1-201ENST00000526431 547 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SMARCE1Q969G3 AC091053.1-201ENST00000529883 744 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SMARCE1Q969G3 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SMARCE1Q969G3 BAD-207ENST00000544785 525 ntTSL 3 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SMARCE1Q969G3 UBE2Q2L-201ENST00000558195 498 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SMARCE1Q969G3 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SMARCE1Q969G3 AC004449.1-201ENST00000564240 433 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SMARCE1Q969G3 AC000095.1-201ENST00000603208 874 ntBASIC17.19■□□□□ 0.34
SMARCE1Q969G3 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SMARCE1Q969G3 STUM-202ENST00000366789 4093 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SMARCE1Q969G3 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SMARCE1Q969G3 C15orf52-206ENST00000559313 3022 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SMARCE1Q969G3 FLNA-207ENST00000422373 8486 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SMARCE1Q969G3 ANXA4-202ENST00000409920 1414 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SMARCE1Q969G3 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SMARCE1Q969G3 NAALADL1-204ENST00000358658 2699 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SMARCE1Q969G3 SERP1-201ENST00000239944 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SMARCE1Q969G3 ABR-205ENST00000544583 5595 ntTSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SMARCE1Q969G3 KIF17-201ENST00000247986 3969 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SMARCE1Q969G3 RAD51C-215ENST00000583539 1319 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SMARCE1Q969G3 WDR33-201ENST00000322313 9471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
SMARCE1Q969G3 AC011455.3-201ENST00000599996 1967 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.19■□□□□ 0.34
SMARCE1Q969G3 WDR1-203ENST00000382452 3142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.19■□□□□ 0.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.1 ms