Protein–RNA interactions for Protein: Q969F9

HPS3, Hermansky-Pudlak syndrome 3 protein, humanhuman

Predictions only

Length 1,004 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HPS3Q969F9 AJ271736.1-201ENST00000483543 773 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HPS3Q969F9 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HPS3Q969F9 ARL2-204ENST00000529384 830 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HPS3Q969F9 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HPS3Q969F9 GREM1-201ENST00000560677 623 ntTSL 4 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HPS3Q969F9 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
HPS3Q969F9 AC133539.2-201ENST00000604757 467 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
HPS3Q969F9 APOBEC3H-206ENST00000613677 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HPS3Q969F9 RPSAP52-203ENST00000622976 1023 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
HPS3Q969F9 PRSS30P-206ENST00000641773 873 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
HPS3Q969F9 AC018716.2-201ENST00000528390 2597 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HPS3Q969F9 LINC00476-204ENST00000429781 2825 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HPS3Q969F9 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HPS3Q969F9 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HPS3Q969F9 C12orf73-207ENST00000549478 1446 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HPS3Q969F9 VWA7-201ENST00000375688 2881 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HPS3Q969F9 GCFC2-201ENST00000321027 4440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HPS3Q969F9 AGER-206ENST00000375070 1463 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HPS3Q969F9 AGER-208ENST00000438221 1493 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HPS3Q969F9 EIF4G3-212ENST00000602326 6196 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HPS3Q969F9 ITGA9-201ENST00000264741 7889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HPS3Q969F9 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HPS3Q969F9 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HPS3Q969F9 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HPS3Q969F9 TLL1-206ENST00000513213 1829 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HPS3Q969F9 CFAP53-201ENST00000398545 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HPS3Q969F9 ADAD1-201ENST00000296513 1961 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HPS3Q969F9 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HPS3Q969F9 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HPS3Q969F9 OSBP2-201ENST00000332585 4340 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
HPS3Q969F9 MBD1-224ENST00000591416 4905 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
HPS3Q969F9 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
HPS3Q969F9 WDR81-202ENST00000409644 6733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
HPS3Q969F9 RIF1-204ENST00000430328 7992 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
HPS3Q969F9 TRIM24-201ENST00000343526 8410 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
HPS3Q969F9 CNST-203ENST00000366513 5126 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
HPS3Q969F9 CLUH-202ENST00000570628 5244 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.29
HPS3Q969F9 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
HPS3Q969F9 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
HPS3Q969F9 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
HPS3Q969F9 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
HPS3Q969F9 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
HPS3Q969F9 XAF1-201ENST00000346752 1584 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
HPS3Q969F9 TOM1L1-201ENST00000348161 1895 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
HPS3Q969F9 NRG1-202ENST00000356819 5931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
HPS3Q969F9 SLC29A1-204ENST00000371731 2258 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
HPS3Q969F9 CCDC22-201ENST00000376227 2319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
HPS3Q969F9 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
HPS3Q969F9 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
HPS3Q969F9 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
HPS3Q969F9 KRTAP10-1-201ENST00000400375 1215 ntAPPRIS P1 BASIC16.83■□□□□ 0.28
HPS3Q969F9 FYCO1-203ENST00000438446 1072 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
HPS3Q969F9 CR769775.1-201ENST00000443347 931 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
HPS3Q969F9 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
HPS3Q969F9 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
HPS3Q969F9 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
HPS3Q969F9 XXYLT1-AS1-201ENST00000458531 431 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
HPS3Q969F9 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC16.83■□□□□ 0.28
HPS3Q969F9 RBFOX1-212ENST00000550418 4775 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
HPS3Q969F9 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
HPS3Q969F9 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
HPS3Q969F9 LINC00094-204ENST00000599836 1689 ntAPPRIS P5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
HPS3Q969F9 ZNF83-215ENST00000600714 810 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
HPS3Q969F9 LINC02084-201ENST00000606069 1096 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
HPS3Q969F9 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
HPS3Q969F9 SRD5A2-201ENST00000622030 4648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
HPS3Q969F9 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
HPS3Q969F9 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
HPS3Q969F9 SHISA6-202ENST00000409168 7262 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
HPS3Q969F9 ITPK1-207ENST00000555495 3035 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
HPS3Q969F9 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
HPS3Q969F9 EXOC6B-209ENST00000634650 2583 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
HPS3Q969F9 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HPS3Q969F9 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HPS3Q969F9 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HPS3Q969F9 N4BP1-201ENST00000262384 7106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HPS3Q969F9 DLGAP1-213ENST00000534970 2365 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HPS3Q969F9 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HPS3Q969F9 ALDH1A2-201ENST00000249750 4098 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HPS3Q969F9 WHRN-202ENST00000362057 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HPS3Q969F9 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HPS3Q969F9 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HPS3Q969F9 RCAN3-202ENST00000374395 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HPS3Q969F9 TTC13-201ENST00000366661 3253 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HPS3Q969F9 EFHC1-212ENST00000635984 3293 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HPS3Q969F9 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HPS3Q969F9 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HPS3Q969F9 LINC02395-201ENST00000546821 3157 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HPS3Q969F9 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HPS3Q969F9 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HPS3Q969F9 GTF2H2C-210ENST00000510979 2952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HPS3Q969F9 CATSPER2P1-203ENST00000429276 1466 ntTSL 2 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HPS3Q969F9 GIGYF1-201ENST00000275732 6530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HPS3Q969F9 LCN15-201ENST00000316144 762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HPS3Q969F9 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HPS3Q969F9 MPV17-208ENST00000405076 603 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HPS3Q969F9 AL139094.1-201ENST00000405549 1188 ntBASIC16.82■□□□□ 0.28
HPS3Q969F9 FAM221A-202ENST00000409192 888 ntTSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
HPS3Q969F9 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC16.82■□□□□ 0.28
HPS3Q969F9 TIMM8B-201ENST00000504148 819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.82■□□□□ 0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.1 ms