Protein–RNA interactions for Protein: Q969F1

GTF3C6, General transcription factor 3C polypeptide 6, humanhuman

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Length 213 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GTF3C6Q969F1 MVB12B-201ENST00000361171 4819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GTF3C6Q969F1 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GTF3C6Q969F1 ABCB8-201ENST00000297504 2487 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GTF3C6Q969F1 SPOCK2-202ENST00000373109 5445 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GTF3C6Q969F1 KLK6-203ENST00000391808 1478 ntTSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GTF3C6Q969F1 PLEKHG3-202ENST00000394691 4397 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GTF3C6Q969F1 STIP1-207ENST00000538945 1900 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GTF3C6Q969F1 PPP2CA-203ENST00000481195 4649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
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GTF3C6Q969F1 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
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GTF3C6Q969F1 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GTF3C6Q969F1 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GTF3C6Q969F1 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GTF3C6Q969F1 SPDYE22P-201ENST00000582158 798 ntBASIC17.77■□□□□ 0.44
GTF3C6Q969F1 INO80C-206ENST00000586489 594 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
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GTF3C6Q969F1 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC17.77■□□□□ 0.44
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GTF3C6Q969F1 ERN2-202ENST00000457008 3169 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
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GTF3C6Q969F1 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.44
GTF3C6Q969F1 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.44
GTF3C6Q969F1 AKAP7-204ENST00000431975 2954 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.44
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GTF3C6Q969F1 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC17.77■□□□□ 0.43
GTF3C6Q969F1 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
GTF3C6Q969F1 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC17.77■□□□□ 0.43
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GTF3C6Q969F1 PDE4C-207ENST00000594617 4655 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.77■□□□□ 0.43
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GTF3C6Q969F1 ZNF683-201ENST00000349618 1610 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.76■□□□□ 0.43
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GTF3C6Q969F1 PPM1E-201ENST00000308249 6542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GTF3C6Q969F1 ERCC1-201ENST00000013807 1278 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GTF3C6Q969F1 CGB5-201ENST00000301408 841 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GTF3C6Q969F1 SYCE1-202ENST00000343131 1113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GTF3C6Q969F1 CTRB1-201ENST00000361017 858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GTF3C6Q969F1 MIR770-201ENST00000390219 98 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
GTF3C6Q969F1 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GTF3C6Q969F1 LENEP-202ENST00000392487 555 ntAPPRIS P1 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GTF3C6Q969F1 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
GTF3C6Q969F1 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
GTF3C6Q969F1 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GTF3C6Q969F1 LINC01812-201ENST00000457448 725 ntTSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GTF3C6Q969F1 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC17.75■□□□□ 0.43
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GTF3C6Q969F1 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
GTF3C6Q969F1 AC124287.1-201ENST00000582249 838 ntTSL 3 BASIC17.75■□□□□ 0.43
GTF3C6Q969F1 AJ011932.1-201ENST00000621707 465 ntBASIC17.75■□□□□ 0.43
GTF3C6Q969F1 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GTF3C6Q969F1 IGSF1-204ENST00000370903 4594 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
GTF3C6Q969F1 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.75■□□□□ 0.43
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