Protein–RNA interactions for Protein: Q93008

USP9X, Probable ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase FAF-X, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 2,570 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP9XQ93008 SLC22A6-203ENST00000421062 1560 ntTSL 1 (best) BASIC13□□□□□ -0.33
USP9XQ93008 F10-201ENST00000375551 1509 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
USP9XQ93008 ERCC1-208ENST00000589165 1453 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
USP9XQ93008 MLPH-203ENST00000409373 2031 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
USP9XQ93008 TRPC4AP-202ENST00000451813 3138 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
USP9XQ93008 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
USP9XQ93008 GTPBP3-222ENST00000600625 2493 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
USP9XQ93008 THAP12-201ENST00000260045 3300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
USP9XQ93008 CRYGC-201ENST00000282141 629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
USP9XQ93008 XPNPEP2-201ENST00000371105 912 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
USP9XQ93008 MIR566-201ENST00000385187 94 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
USP9XQ93008 AZGP1P1-202ENST00000425474 1181 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
USP9XQ93008 AL353150.1-201ENST00000456944 583 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
USP9XQ93008 AP005264.6-204ENST00000588436 719 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
USP9XQ93008 FXYD6-FXYD2-202ENST00000614497 634 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
USP9XQ93008 DNM1P34-201ENST00000567292 2276 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
USP9XQ93008 PLAGL1-211ENST00000625622 3216 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
USP9XQ93008 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
USP9XQ93008 SCOC-208ENST00000510586 2193 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
USP9XQ93008 BBS5-202ENST00000392663 3107 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
USP9XQ93008 BTBD10-208ENST00000528120 1662 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
USP9XQ93008 SIPA1-209ENST00000534313 3521 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
USP9XQ93008 JMJD4-201ENST00000366758 2595 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
USP9XQ93008 AFAP1L2-202ENST00000369271 3964 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
USP9XQ93008 NUP62-211ENST00000597029 2053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
USP9XQ93008 AC005498.3-201ENST00000596587 2045 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
USP9XQ93008 ZDHHC13-202ENST00000446113 2445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
USP9XQ93008 EFR3B-203ENST00000402191 3685 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
USP9XQ93008 GDF5-201ENST00000374369 2383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
USP9XQ93008 PTTG1IP-201ENST00000330938 2760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
USP9XQ93008 NOX5-209ENST00000530406 2289 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
USP9XQ93008 ADAM6-201ENST00000606026 1843 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
USP9XQ93008 SERPINE2-202ENST00000409304 2161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
USP9XQ93008 TSGA13-201ENST00000356588 1372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
USP9XQ93008 C16orf58-211ENST00000570164 2783 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
USP9XQ93008 SEMA7A-201ENST00000261918 3885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
USP9XQ93008 AC092127.1-201ENST00000567093 3455 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
USP9XQ93008 MIR648-201ENST00000385046 94 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
USP9XQ93008 PPM1N-201ENST00000396735 895 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
USP9XQ93008 KLHL7-204ENST00000410047 1233 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
USP9XQ93008 AL929302.1-201ENST00000426556 871 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
USP9XQ93008 AC254562.2-201ENST00000428786 667 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
USP9XQ93008 PPM1N-208ENST00000456399 618 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
USP9XQ93008 CD164-210ENST00000512821 964 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
USP9XQ93008 POLR2J3-217ENST00000513438 546 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
USP9XQ93008 TMEM223-202ENST00000525631 736 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
USP9XQ93008 AC108471.2-201ENST00000533736 1061 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
USP9XQ93008 SRRM2-205ENST00000570971 1132 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
USP9XQ93008 LINC02333-201ENST00000603464 852 ntTSL 3 BASIC12.99□□□□□ -0.33
USP9XQ93008 ARL16-215ENST00000622299 1053 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
USP9XQ93008 ADSL-201ENST00000216194 1620 ntTSL 2 BASIC12.99□□□□□ -0.33
USP9XQ93008 KCNT1-206ENST00000486577 3760 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
USP9XQ93008 ARHGAP9-204ENST00000430041 2323 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
USP9XQ93008 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
USP9XQ93008 OSGIN2-202ENST00000451899 4266 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
USP9XQ93008 CD300A-202ENST00000360141 1858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
USP9XQ93008 KIAA1324L-207ENST00000444627 3527 ntTSL 5 BASIC12.99□□□□□ -0.33
USP9XQ93008 AC007292.2-201ENST00000593524 1812 ntBASIC12.99□□□□□ -0.33
USP9XQ93008 LTF-202ENST00000417439 2130 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
USP9XQ93008 OGFR-201ENST00000290291 2410 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
USP9XQ93008 EIF4A1-201ENST00000293831 1756 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
USP9XQ93008 CHAD-203ENST00000508540 1789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
USP9XQ93008 ZNFX1-203ENST00000371754 5235 ntTSL 1 (best) BASIC12.99□□□□□ -0.33
USP9XQ93008 CNNM1-201ENST00000356713 5959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
USP9XQ93008 PDCD7-201ENST00000204549 2851 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
USP9XQ93008 GATAD1-201ENST00000287957 3361 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
USP9XQ93008 WASHC2C-209ENST00000540872 4519 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
USP9XQ93008 CASP2-201ENST00000310447 4225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
USP9XQ93008 KCNH3-201ENST00000257981 3867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
USP9XQ93008 PLAC8L1-201ENST00000311450 638 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
USP9XQ93008 PES1-204ENST00000402284 2144 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
USP9XQ93008 AP000696.1-201ENST00000457669 1133 ntTSL 3 BASIC12.98□□□□□ -0.33
USP9XQ93008 DHDDS-217ENST00000526219 1072 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
USP9XQ93008 AL513165.2-203ENST00000537239 717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
USP9XQ93008 TGFB3-204ENST00000556285 1280 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
USP9XQ93008 AC133540.1-201ENST00000620845 1019 ntBASIC12.98□□□□□ -0.33
USP9XQ93008 HEG1-201ENST00000311127 9156 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
USP9XQ93008 GRB2-202ENST00000316804 3248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
USP9XQ93008 MZF1-201ENST00000215057 2905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
USP9XQ93008 KIAA1586-201ENST00000370733 2933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
USP9XQ93008 BMP1-201ENST00000306349 2626 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
USP9XQ93008 CANX-201ENST00000247461 4260 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
USP9XQ93008 PAK4-201ENST00000321944 2555 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
USP9XQ93008 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
USP9XQ93008 ZNF423-206ENST00000563137 4911 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
USP9XQ93008 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
USP9XQ93008 AL353608.3-201ENST00000603200 2211 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
USP9XQ93008 PARP12-201ENST00000263549 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
USP9XQ93008 WDR90-201ENST00000293879 5488 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
USP9XQ93008 GPAT3-202ENST00000395226 2631 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
USP9XQ93008 FTX-216ENST00000638985 1367 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
USP9XQ93008 CCDC154-202ENST00000409671 2561 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
USP9XQ93008 PHGDH-223ENST00000641597 2585 ntAPPRIS P1 BASIC12.98□□□□□ -0.33
USP9XQ93008 THUMPD3-AS1-212ENST00000520447 1809 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
USP9XQ93008 HNRNPR-212ENST00000606561 1837 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
USP9XQ93008 TSPAN3-205ENST00000558745 1340 ntTSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
USP9XQ93008 CCDC136-212ENST00000487361 2268 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
USP9XQ93008 AL031658.1-201ENST00000449519 2013 ntTSL 2 BASIC12.98□□□□□ -0.33
USP9XQ93008 PNKD-202ENST00000258362 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC12.98□□□□□ -0.33
USP9XQ93008 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC12.98□□□□□ -0.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.9 ms