Protein–RNA interactions for Protein: Q92954

PRG4, Proteoglycan 4, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 1,404 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRG4Q92954 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRG4Q92954 CAMK2B-204ENST00000350811 2292 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRG4Q92954 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRG4Q92954 FBXO33-201ENST00000298097 3853 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRG4Q92954 ZMYM3-202ENST00000373978 1511 ntTSL 5 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRG4Q92954 ESYT2-201ENST00000251527 5960 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRG4Q92954 ACE-203ENST00000413513 2237 ntTSL 2 BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRG4Q92954 CTBP2P8-201ENST00000422584 1330 ntBASIC23.44■■□□□ 1.34
PRG4Q92954 CYMP-AS1-201ENST00000457402 2351 ntTSL 1 (best) BASIC23.44■■□□□ 1.34
PRG4Q92954 COPS7B-224ENST00000620578 2500 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRG4Q92954 PGBD2-201ENST00000329291 2136 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRG4Q92954 HIST1H2BJ-201ENST00000339812 381 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRG4Q92954 Metazoa_SRP.6-201ENST00000366384 298 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PRG4Q92954 PLAC9-203ENST00000372270 534 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRG4Q92954 TRBV4-1-201ENST00000390357 373 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRG4Q92954 TRBV4-2-201ENST00000390392 455 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRG4Q92954 ATP6V1E1-202ENST00000399796 1208 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRG4Q92954 AC073869.2-201ENST00000417338 1026 ntBASIC23.43■■□□□ 1.34
PRG4Q92954 AL158166.1-201ENST00000433110 371 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRG4Q92954 AP003390.1-201ENST00000533253 523 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRG4Q92954 RAP1B-216ENST00000537460 1072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRG4Q92954 SNRPF-204ENST00000552085 815 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRG4Q92954 AF111169.2-201ENST00000553758 721 ntTSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRG4Q92954 FXYD3-204ENST00000603181 758 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRG4Q92954 AQP7-213ENST00000624075 1270 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRG4Q92954 GINS2-201ENST00000253462 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRG4Q92954 MINDY4B-201ENST00000465419 1383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRG4Q92954 EMILIN3-201ENST00000332312 3796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRG4Q92954 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRG4Q92954 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRG4Q92954 NR2C1-203ENST00000393101 1822 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRG4Q92954 CAMK2D-207ENST00000505990 1802 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRG4Q92954 SERINC2-202ENST00000373710 2146 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRG4Q92954 NR2E1-202ENST00000368986 3212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRG4Q92954 AC009237.3-202ENST00000608013 3042 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRG4Q92954 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRG4Q92954 LRCH2-201ENST00000317135 4929 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
PRG4Q92954 PPM1N-205ENST00000401705 771 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRG4Q92954 MNX1-AS2-201ENST00000429228 374 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRG4Q92954 MEG9-201ENST00000429368 2638 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRG4Q92954 BRI3P1-201ENST00000440440 378 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
PRG4Q92954 AP001062.3-202ENST00000444409 619 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRG4Q92954 APCDD1L-AS1-206ENST00000445984 566 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRG4Q92954 AL121845.1-201ENST00000447343 464 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRG4Q92954 APCDD1L-AS1-208ENST00000448374 546 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRG4Q92954 RGS5-216ENST00000449680 788 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRG4Q92954 AC037486.1-201ENST00000523792 790 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRG4Q92954 AC090001.1-201ENST00000553194 467 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRG4Q92954 SRP14-204ENST00000558720 780 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRG4Q92954 NAA38-205ENST00000575771 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRG4Q92954 AP005212.2-201ENST00000584979 510 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
PRG4Q92954 OCEL1-206ENST00000597836 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRG4Q92954 AL137793.2-201ENST00000632635 659 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRG4Q92954 AC106774.7-201ENST00000638408 597 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRG4Q92954 AC106774.6-201ENST00000638483 597 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRG4Q92954 AC233724.20-201ENST00000638842 597 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRG4Q92954 AC233724.19-201ENST00000639969 597 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRG4Q92954 AC106774.5-201ENST00000640558 597 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRG4Q92954 AC233724.18-201ENST00000640803 597 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRG4Q92954 AC233724.21-201ENST00000640846 597 ntAPPRIS P1 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRG4Q92954 CD79B-201ENST00000006750 1269 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRG4Q92954 ALDH1A3-201ENST00000329841 3924 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRG4Q92954 PRR5-203ENST00000403581 2279 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRG4Q92954 PTPRE-201ENST00000254667 5331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRG4Q92954 LAIR1-209ENST00000434277 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRG4Q92954 PPP2R5B-201ENST00000164133 2745 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRG4Q92954 PSMC4-202ENST00000455878 1333 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRG4Q92954 CACNA1B-201ENST00000277549 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRG4Q92954 CACNA1B-202ENST00000277551 7158 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRG4Q92954 ZNF226-201ENST00000300823 817 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRG4Q92954 MBD3L3-201ENST00000333843 775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRG4Q92954 XPNPEP2-201ENST00000371105 912 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRG4Q92954 ADARB2-AS1-201ENST00000381301 625 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRG4Q92954 GSTT2B-202ENST00000404172 819 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRG4Q92954 AL139125.1-201ENST00000420395 557 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRG4Q92954 KRT18P46-201ENST00000435568 1279 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
PRG4Q92954 LINC00173-201ENST00000470091 435 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRG4Q92954 AC026470.1-201ENST00000478038 846 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
PRG4Q92954 RN7SL277P-201ENST00000481521 288 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
PRG4Q92954 GDNF-207ENST00000515058 764 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRG4Q92954 OR5BD1P-201ENST00000532527 817 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
PRG4Q92954 AC226150.1-201ENST00000544259 466 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
PRG4Q92954 DUXAP9-201ENST00000547220 665 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRG4Q92954 AL132801.1-201ENST00000559675 567 ntTSL 4 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRG4Q92954 AC004528.1-201ENST00000588380 641 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
PRG4Q92954 AL118522.1-201ENST00000611368 560 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
PRG4Q92954 UPB1-202ENST00000382760 1928 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRG4Q92954 AC079328.2-201ENST00000561241 3354 ntBASIC23.41■■□□□ 1.34
PRG4Q92954 C16orf58-201ENST00000327237 2793 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRG4Q92954 SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 1479 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRG4Q92954 ABTB1-202ENST00000453791 1961 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRG4Q92954 POLR2A-201ENST00000572844 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRG4Q92954 KCNQ5-201ENST00000342056 6688 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRG4Q92954 HECTD2-204ENST00000446394 4939 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRG4Q92954 PIPOX-201ENST00000323372 2414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRG4Q92954 COBLL1-201ENST00000342193 4898 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRG4Q92954 MYCBPAP-203ENST00000436259 3102 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRG4Q92954 XKR9-203ENST00000520030 1799 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRG4Q92954 BBS2-218ENST00000568104 2623 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
PRG4Q92954 APH1A-202ENST00000360244 2353 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms