Protein–RNA interactions for Protein: Q92576

PHF3, PHD finger protein 3, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 2,039 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PHF3Q92576 SLC7A4-201ENST00000382932 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PHF3Q92576 PPFIA3-201ENST00000334186 4733 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PHF3Q92576 C20orf202-201ENST00000400633 1604 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PHF3Q92576 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PHF3Q92576 RNF145-212ENST00000611185 3624 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PHF3Q92576 MDGA2-202ENST00000399232 5075 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PHF3Q92576 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PHF3Q92576 ETV3-201ENST00000326786 1539 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PHF3Q92576 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PHF3Q92576 BEX2-202ENST00000372677 899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PHF3Q92576 STMN1-203ENST00000399728 1712 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PHF3Q92576 ZNF564-202ENST00000416136 255 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PHF3Q92576 AC092614.1-201ENST00000419640 909 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PHF3Q92576 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PHF3Q92576 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PHF3Q92576 FDPS-203ENST00000447866 1256 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PHF3Q92576 AC004066.1-201ENST00000502488 802 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
PHF3Q92576 FAM86HP-204ENST00000513466 959 ntBASIC13.7□□□□□ -0.22
PHF3Q92576 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PHF3Q92576 THAP4-206ENST00000612200 969 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PHF3Q92576 LINC01002-220ENST00000632790 449 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PHF3Q92576 AC004834.1-204ENST00000640670 1055 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PHF3Q92576 PRDM6-201ENST00000407847 9267 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PHF3Q92576 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PHF3Q92576 AKAP1-201ENST00000314126 2380 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PHF3Q92576 KITLG-202ENST00000347404 1948 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PHF3Q92576 PM20D2-201ENST00000275072 4708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PHF3Q92576 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PHF3Q92576 NUP93-201ENST00000308159 2741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PHF3Q92576 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PHF3Q92576 SPIN2A-201ENST00000374906 1319 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PHF3Q92576 CDH6-205ENST00000514738 2569 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PHF3Q92576 AC138517.2-201ENST00000637503 2594 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PHF3Q92576 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PHF3Q92576 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PHF3Q92576 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PHF3Q92576 SIGLEC11-202ENST00000426971 2479 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PHF3Q92576 MROH6-201ENST00000398882 3469 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PHF3Q92576 MVB12B-206ENST00000489637 2666 ntTSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PHF3Q92576 LARP4B-211ENST00000612396 8546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PHF3Q92576 BCL11B-202ENST00000357195 7559 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PHF3Q92576 DCAF17-211ENST00000539783 5623 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PHF3Q92576 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PHF3Q92576 PCNX2-201ENST00000258229 7518 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PHF3Q92576 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PHF3Q92576 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.7□□□□□ -0.22
PHF3Q92576 FLJ42969-201ENST00000514926 1948 ntTSL 2 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PHF3Q92576 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC13.7□□□□□ -0.22
PHF3Q92576 EMC3-AS1-202ENST00000366264 559 ntTSL 4 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PHF3Q92576 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PHF3Q92576 RPL5P21-201ENST00000404620 815 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
PHF3Q92576 BTBD6P1-201ENST00000412176 1267 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
PHF3Q92576 GPAA1P2-201ENST00000417923 928 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
PHF3Q92576 AC053503.1-201ENST00000429882 519 ntTSL 3 BASIC13.69□□□□□ -0.22
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PHF3Q92576 AC080188.2-201ENST00000508985 552 ntTSL 4 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PHF3Q92576 SLC45A2-204ENST00000509381 1040 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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PHF3Q92576 IRF3-223ENST00000599223 1055 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PHF3Q92576 LINC00592-202ENST00000640420 768 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PHF3Q92576 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PHF3Q92576 RAB11FIP5-205ENST00000486777 6120 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PHF3Q92576 HACE1-201ENST00000262903 4576 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PHF3Q92576 SYNRG-223ENST00000616179 4050 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PHF3Q92576 TEX264-205ENST00000416589 1313 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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PHF3Q92576 ZBTB7C-221ENST00000590800 4947 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PHF3Q92576 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PHF3Q92576 AL513477.1-201ENST00000602865 2407 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
PHF3Q92576 ALDH3B2-201ENST00000349015 2649 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PHF3Q92576 CACNA1A-253ENST00000637927 6847 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PHF3Q92576 PSMC3-209ENST00000530912 1390 ntTSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PHF3Q92576 SCAF8-201ENST00000367178 5057 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PHF3Q92576 MAP1S-201ENST00000324096 3419 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PHF3Q92576 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PHF3Q92576 ZKSCAN7-202ENST00000341840 1757 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PHF3Q92576 KAT7-210ENST00000509773 1774 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PHF3Q92576 SLC22A7-203ENST00000372589 2549 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PHF3Q92576 PPP1R26-202ENST00000401470 4769 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PHF3Q92576 SNAP47-203ENST00000366760 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PHF3Q92576 FOXO3-201ENST00000343882 7308 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PHF3Q92576 TMEM117-201ENST00000266534 2758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PHF3Q92576 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PHF3Q92576 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PHF3Q92576 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PHF3Q92576 USP25-201ENST00000285679 3973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PHF3Q92576 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
PHF3Q92576 POM121L8P-201ENST00000417732 1281 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
PHF3Q92576 POM121L9P-203ENST00000441984 1285 ntBASIC13.69□□□□□ -0.22
PHF3Q92576 CNGA4-202ENST00000533426 936 ntTSL 2 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PHF3Q92576 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PHF3Q92576 PKIG-204ENST00000372889 1489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.69□□□□□ -0.22
PHF3Q92576 ARMC5-203ENST00000457010 4844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PHF3Q92576 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
PHF3Q92576 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.69□□□□□ -0.22
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