Protein–RNA interactions for Protein: Q8WUD4

CCDC12, Coiled-coil domain-containing protein 12, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 166 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCDC12Q8WUD4 RNF135-202ENST00000328381 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC12Q8WUD4 ZSCAN10-209ENST00000576985 2739 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC12Q8WUD4 COG3-201ENST00000349995 4498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC12Q8WUD4 ATP2A3-204ENST00000397035 4182 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC12Q8WUD4 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC12Q8WUD4 APAF1-201ENST00000333991 4539 ntTSL 5 BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC12Q8WUD4 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.59■□□□□ 0.41
CCDC12Q8WUD4 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CCDC12Q8WUD4 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CCDC12Q8WUD4 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CCDC12Q8WUD4 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CCDC12Q8WUD4 OGDH-204ENST00000443864 1744 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CCDC12Q8WUD4 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CCDC12Q8WUD4 FLI1-207ENST00000534087 3859 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CCDC12Q8WUD4 AC004805.1-201ENST00000577662 1616 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CCDC12Q8WUD4 GGACT-202ENST00000455100 2678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CCDC12Q8WUD4 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CCDC12Q8WUD4 PSMC3-213ENST00000619920 1580 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CCDC12Q8WUD4 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CCDC12Q8WUD4 KLHDC3-203ENST00000332245 1494 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CCDC12Q8WUD4 UBA6-AS1-201ENST00000498917 1445 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.41
CCDC12Q8WUD4 USP35-203ENST00000529308 4216 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.41
CCDC12Q8WUD4 MIR600HG-201ENST00000449175 5984 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC12Q8WUD4 AHCYL2-202ENST00000446544 5026 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC12Q8WUD4 SLC24A3-201ENST00000328041 3929 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC12Q8WUD4 IL32-202ENST00000325568 1105 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC12Q8WUD4 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC12Q8WUD4 IL32-203ENST00000382213 880 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC12Q8WUD4 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC12Q8WUD4 KLF2P2-201ENST00000416807 1039 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC12Q8WUD4 RPUSD3-204ENST00000424438 1005 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC12Q8WUD4 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC12Q8WUD4 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC12Q8WUD4 TTTY23B-201ENST00000442790 549 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC12Q8WUD4 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC12Q8WUD4 AC124944.1-201ENST00000448113 625 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC12Q8WUD4 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC12Q8WUD4 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC12Q8WUD4 IFT20-209ENST00000579419 787 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC12Q8WUD4 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC12Q8WUD4 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC12Q8WUD4 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC12Q8WUD4 AL603764.1-201ENST00000636452 321 ntBASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC12Q8WUD4 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC12Q8WUD4 CRHBP-201ENST00000274368 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC12Q8WUD4 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC12Q8WUD4 ADHFE1-203ENST00000396623 1990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC12Q8WUD4 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC12Q8WUD4 SLC6A13-203ENST00000445055 1950 ntTSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC12Q8WUD4 CCDC110-209ENST00000510617 2592 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC12Q8WUD4 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC12Q8WUD4 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC12Q8WUD4 AC112484.1-201ENST00000508239 2291 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC12Q8WUD4 ELMOD1-201ENST00000265840 2852 ntTSL 1 (best) BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC12Q8WUD4 FAM149B1-201ENST00000242505 5408 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.58■□□□□ 0.4
CCDC12Q8WUD4 SYNGR2-207ENST00000590201 2239 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC12Q8WUD4 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC12Q8WUD4 UCK1-203ENST00000372211 2114 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC12Q8WUD4 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC12Q8WUD4 RCOR3-203ENST00000419091 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC12Q8WUD4 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC12Q8WUD4 MINK1-201ENST00000347992 4863 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC12Q8WUD4 PGPEP1-201ENST00000252813 1409 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC12Q8WUD4 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC12Q8WUD4 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC12Q8WUD4 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC12Q8WUD4 EIF3K-203ENST00000545173 1327 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC12Q8WUD4 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC12Q8WUD4 C1R-202ENST00000536053 2347 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC12Q8WUD4 AHNAK-201ENST00000257247 1024 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC12Q8WUD4 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC12Q8WUD4 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC12Q8WUD4 AC099754.1-201ENST00000435884 454 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC12Q8WUD4 AC012441.1-201ENST00000446669 685 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC12Q8WUD4 SNHG11-212ENST00000449351 954 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC12Q8WUD4 AC004522.2-201ENST00000456499 680 ntTSL 3 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC12Q8WUD4 AC068587.3-201ENST00000526613 355 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC12Q8WUD4 HIST1H2AB-201ENST00000615868 393 ntAPPRIS P1 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC12Q8WUD4 ALDH3A2-221ENST00000581518 2785 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC12Q8WUD4 KREMEN1-201ENST00000327813 2719 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC12Q8WUD4 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC12Q8WUD4 PTBP1-201ENST00000349038 3155 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC12Q8WUD4 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC12Q8WUD4 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC12Q8WUD4 CASC3-201ENST00000264645 4116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC12Q8WUD4 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC12Q8WUD4 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC12Q8WUD4 CBS-204ENST00000398165 2605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC12Q8WUD4 ABCG4-205ENST00000619701 3852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC12Q8WUD4 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC12Q8WUD4 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC12Q8WUD4 TSC1-202ENST00000403810 1507 ntTSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC12Q8WUD4 CCDC183-AS1-201ENST00000414656 2386 ntTSL 2 BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC12Q8WUD4 GPD1L-201ENST00000282541 4060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.57■□□□□ 0.4
CCDC12Q8WUD4 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC12Q8WUD4 AC004943.2-201ENST00000563328 4842 ntTSL 3 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC12Q8WUD4 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC12Q8WUD4 MAPK7-202ENST00000308406 3149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC12Q8WUD4 SNX18-202ENST00000343017 3140 ntBASIC17.56■□□□□ 0.4
CCDC12Q8WUD4 CASQ1-201ENST00000368078 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.56■□□□□ 0.4
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.8 ms