Protein–RNA interactions for Protein: Q8NDW4

ZNF248, Zinc finger protein 248, humanhuman

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Length 579 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF248Q8NDW4 DKFZp779M0652-201ENST00000378779 649 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ZNF248Q8NDW4 SEPT12-202ENST00000396693 1156 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ZNF248Q8NDW4 SMARCE1-204ENST00000400122 1263 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ZNF248Q8NDW4 CYP46A4P-201ENST00000414953 267 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
ZNF248Q8NDW4 DLGAP4-AS1-202ENST00000433238 593 ntTSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ZNF248Q8NDW4 HELZ2-204ENST00000467148 8064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ZNF248Q8NDW4 EIF3M-203ENST00000524896 1207 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ZNF248Q8NDW4 SMARCE1-213ENST00000578044 1184 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ZNF248Q8NDW4 SMARCE1-216ENST00000580419 1228 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ZNF248Q8NDW4 AC007663.3-201ENST00000609632 465 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
ZNF248Q8NDW4 EBAG9-209ENST00000614147 1179 ntTSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ZNF248Q8NDW4 AC244157.2-201ENST00000616239 1006 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
ZNF248Q8NDW4 LINC01668-201ENST00000635001 513 ntTSL 4 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ZNF248Q8NDW4 HPSE-206ENST00000512196 1571 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ZNF248Q8NDW4 JADE2-201ENST00000282605 2748 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ZNF248Q8NDW4 KIFC1-211ENST00000428849 2706 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ZNF248Q8NDW4 ELP1-201ENST00000374647 5905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ZNF248Q8NDW4 SKOR1-201ENST00000341418 3332 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ZNF248Q8NDW4 KLHL36-204ENST00000564996 2173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ZNF248Q8NDW4 AFDN-203ENST00000366806 5962 ntTSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ZNF248Q8NDW4 GPAT4-201ENST00000396987 6298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ZNF248Q8NDW4 AC010491.1-201ENST00000563101 2797 ntBASIC14.58□□□□□ -0.08
ZNF248Q8NDW4 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
ZNF248Q8NDW4 PSEN2-203ENST00000422240 1947 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ZNF248Q8NDW4 DCP1B-202ENST00000535873 2231 ntTSL 2 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ZNF248Q8NDW4 DENND4C-209ENST00000602925 6831 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ZNF248Q8NDW4 CAMSAP1-203ENST00000409386 5730 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.58□□□□□ -0.08
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ZNF248Q8NDW4 FAM210A-202ENST00000402563 4240 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.58□□□□□ -0.08
ZNF248Q8NDW4 NFATC4-211ENST00000554344 2955 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.58□□□□□ -0.08
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ZNF248Q8NDW4 MBD1-204ENST00000347968 3091 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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ZNF248Q8NDW4 DMAC2-204ENST00000438807 1454 ntTSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ZNF248Q8NDW4 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.57□□□□□ -0.08
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ZNF248Q8NDW4 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.57□□□□□ -0.08
ZNF248Q8NDW4 PMS1-213ENST00000441310 3225 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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ZNF248Q8NDW4 OCLN-202ENST00000396442 1748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
ZNF248Q8NDW4 STT3B-201ENST00000295770 4248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.57□□□□□ -0.08
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ZNF248Q8NDW4 C3-201ENST00000245907 5263 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ZNF248Q8NDW4 C12orf65-201ENST00000253233 2073 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ZNF248Q8NDW4 EFEMP1-202ENST00000394555 3024 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ZNF248Q8NDW4 CCDC85A-201ENST00000407595 3982 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ZNF248Q8NDW4 BATF2-201ENST00000301887 2142 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ZNF248Q8NDW4 CLCNKB-201ENST00000375667 2129 ntTSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
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ZNF248Q8NDW4 RASSF1-205ENST00000395126 1657 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ZNF248Q8NDW4 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ZNF248Q8NDW4 SPDYE2B-203ENST00000507450 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
ZNF248Q8NDW4 SPDYE2-203ENST00000507918 1742 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.56□□□□□ -0.08
ZNF248Q8NDW4 AC069224.1-201ENST00000566372 1715 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
ZNF248Q8NDW4 MEX3C-204ENST00000616921 3269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ZNF248Q8NDW4 ZMYND12-201ENST00000372565 1775 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ZNF248Q8NDW4 PSME1-201ENST00000206451 1006 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ZNF248Q8NDW4 NOL4L-202ENST00000326071 701 ntTSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ZNF248Q8NDW4 CSAG1-202ENST00000370287 875 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.56□□□□□ -0.08
ZNF248Q8NDW4 MIR33B-201ENST00000385104 96 ntBASIC14.56□□□□□ -0.08
ZNF248Q8NDW4 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.56□□□□□ -0.08
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