Protein–RNA interactions for Protein: Q8IXW0

LMNTD2, Lamin tail domain-containing protein 2, humanhuman

Predictions only

Length 634 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LMNTD2Q8IXW0 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LMNTD2Q8IXW0 NDC1-201ENST00000371429 5134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LMNTD2Q8IXW0 CARHSP1-220ENST00000619881 2849 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LMNTD2Q8IXW0 RPL37AP1-201ENST00000412502 279 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
LMNTD2Q8IXW0 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
LMNTD2Q8IXW0 PRRT3-AS1-201ENST00000431558 614 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LMNTD2Q8IXW0 AL365226.1-201ENST00000448363 349 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LMNTD2Q8IXW0 AL391845.1-202ENST00000449154 437 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LMNTD2Q8IXW0 PPP6R2P1-201ENST00000450880 1275 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
LMNTD2Q8IXW0 AC063976.1-201ENST00000457890 381 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LMNTD2Q8IXW0 NDUFAF5-203ENST00000463598 991 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LMNTD2Q8IXW0 AC025678.2-201ENST00000562061 970 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
LMNTD2Q8IXW0 AC015910.1-201ENST00000579400 975 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
LMNTD2Q8IXW0 AL645728.2-202ENST00000641679 227 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
LMNTD2Q8IXW0 PAPPA-201ENST00000328252 10959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LMNTD2Q8IXW0 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LMNTD2Q8IXW0 FBXO41-201ENST00000295133 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LMNTD2Q8IXW0 ARHGAP27P1-BPTFP1-KPNA2P3-201ENST00000578492 2732 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LMNTD2Q8IXW0 NAALADL1-203ENST00000356632 2118 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LMNTD2Q8IXW0 FAM122A-201ENST00000394264 4575 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LMNTD2Q8IXW0 FBLIM1-206ENST00000441801 1543 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LMNTD2Q8IXW0 TIMM50-220ENST00000607714 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LMNTD2Q8IXW0 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LMNTD2Q8IXW0 MLPH-204ENST00000410032 2171 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LMNTD2Q8IXW0 CHEK2-204ENST00000382580 1971 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LMNTD2Q8IXW0 KBTBD12-202ENST00000405109 5727 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LMNTD2Q8IXW0 HMOX2-205ENST00000458134 1797 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LMNTD2Q8IXW0 BCL11B-201ENST00000345514 7603 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LMNTD2Q8IXW0 DGAT2L6-201ENST00000333026 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
LMNTD2Q8IXW0 ABCA2-203ENST00000371605 8151 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
LMNTD2Q8IXW0 TMEM169-204ENST00000437356 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LMNTD2Q8IXW0 AC002310.1-201ENST00000457283 1445 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LMNTD2Q8IXW0 NAA60-229ENST00000575076 2531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LMNTD2Q8IXW0 ITGB8-201ENST00000222573 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LMNTD2Q8IXW0 RAPSN-201ENST00000298854 1671 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LMNTD2Q8IXW0 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LMNTD2Q8IXW0 CTIF-202ENST00000382998 4407 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LMNTD2Q8IXW0 TRPC6-203ENST00000360497 2631 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LMNTD2Q8IXW0 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LMNTD2Q8IXW0 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LMNTD2Q8IXW0 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LMNTD2Q8IXW0 SRP19-201ENST00000282999 937 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LMNTD2Q8IXW0 FAM24B-201ENST00000368896 704 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LMNTD2Q8IXW0 HNRNPFP1-201ENST00000391730 1133 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
LMNTD2Q8IXW0 HFE-208ENST00000397022 1280 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LMNTD2Q8IXW0 AC015922.1-201ENST00000421102 1152 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
LMNTD2Q8IXW0 AL133481.1-201ENST00000438554 511 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LMNTD2Q8IXW0 HFE-214ENST00000488199 781 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LMNTD2Q8IXW0 APBB2-208ENST00000504305 1274 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LMNTD2Q8IXW0 BEST1-205ENST00000526988 1263 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LMNTD2Q8IXW0 MAPKAPK5-203ENST00000547305 494 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LMNTD2Q8IXW0 VPS29-207ENST00000549970 818 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LMNTD2Q8IXW0 HOPX-214ENST00000556614 1138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LMNTD2Q8IXW0 AC090607.3-202ENST00000558971 383 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LMNTD2Q8IXW0 ARMC7-205ENST00000584947 445 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LMNTD2Q8IXW0 AC110491.3-201ENST00000631985 460 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LMNTD2Q8IXW0 EIF1B-AS1-201ENST00000625390 1958 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LMNTD2Q8IXW0 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LMNTD2Q8IXW0 HNF1B-201ENST00000613727 1546 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LMNTD2Q8IXW0 RAP1GAP2-209ENST00000637138 3175 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LMNTD2Q8IXW0 MAP2K1-201ENST00000307102 3410 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LMNTD2Q8IXW0 SPATA21-201ENST00000335496 2015 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LMNTD2Q8IXW0 ABCG2-201ENST00000237612 4479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LMNTD2Q8IXW0 MROH4P-201ENST00000431302 1578 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
LMNTD2Q8IXW0 AC104407.1-201ENST00000511017 1568 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LMNTD2Q8IXW0 ZNF84-215ENST00000543758 3501 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LMNTD2Q8IXW0 LETMD1-201ENST00000262055 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LMNTD2Q8IXW0 CCNL1-202ENST00000295926 2388 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LMNTD2Q8IXW0 VWA5B2-202ENST00000426955 4120 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
LMNTD2Q8IXW0 KLHDC8A-202ENST00000367156 3177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
LMNTD2Q8IXW0 GCM2-201ENST00000379491 2441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LMNTD2Q8IXW0 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LMNTD2Q8IXW0 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LMNTD2Q8IXW0 DUSP11-201ENST00000272444 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LMNTD2Q8IXW0 TK1-203ENST00000588734 1681 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LMNTD2Q8IXW0 PTPRN-201ENST00000295718 3784 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LMNTD2Q8IXW0 EVL-201ENST00000392920 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LMNTD2Q8IXW0 TMPRSS9-201ENST00000332578 3331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LMNTD2Q8IXW0 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LMNTD2Q8IXW0 NEDD4L-205ENST00000400345 3647 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LMNTD2Q8IXW0 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LMNTD2Q8IXW0 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LMNTD2Q8IXW0 GSTO1-201ENST00000369710 900 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LMNTD2Q8IXW0 IZUMO4-201ENST00000395296 869 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LMNTD2Q8IXW0 AC074338.1-201ENST00000416825 156 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
LMNTD2Q8IXW0 CTDSP1-204ENST00000443891 1109 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LMNTD2Q8IXW0 RN7SL618P-201ENST00000477850 296 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
LMNTD2Q8IXW0 AC067863.1-201ENST00000494933 530 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
LMNTD2Q8IXW0 AC106872.10-201ENST00000503778 747 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LMNTD2Q8IXW0 LY6E-204ENST00000519546 971 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LMNTD2Q8IXW0 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
LMNTD2Q8IXW0 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LMNTD2Q8IXW0 CYB561D1-209ENST00000533024 913 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LMNTD2Q8IXW0 CMTM3-205ENST00000562707 714 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LMNTD2Q8IXW0 CEMP1-201ENST00000565480 519 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LMNTD2Q8IXW0 AC087741.1-202ENST00000573346 801 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LMNTD2Q8IXW0 AC138207.8-201ENST00000579692 739 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
LMNTD2Q8IXW0 AC074044.1-201ENST00000609673 707 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
LMNTD2Q8IXW0 AL596442.2-201ENST00000610240 980 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
LMNTD2Q8IXW0 NEK5-204ENST00000617045 2127 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 42.2 ms