Protein–RNA interactions for Protein: Q8IV08

PLD3, Phospholipase D3, humanhuman

Predictions only

Length 490 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PLD3Q8IV08 HARS-205ENST00000457527 1896 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PLD3Q8IV08 SYP-207ENST00000479808 1850 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PLD3Q8IV08 AL359258.3-201ENST00000622910 2331 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
PLD3Q8IV08 SPPL3-201ENST00000353487 4148 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PLD3Q8IV08 CNN1-202ENST00000535659 1527 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PLD3Q8IV08 C11orf71-202ENST00000623205 1980 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PLD3Q8IV08 CELP-203ENST00000624767 2414 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PLD3Q8IV08 DESI2-202ENST00000302550 4208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PLD3Q8IV08 TMBIM7P-203ENST00000641617 1718 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
PLD3Q8IV08 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PLD3Q8IV08 H2BFWT-201ENST00000217926 894 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PLD3Q8IV08 NDUFA2-201ENST00000252102 804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PLD3Q8IV08 ZSCAN2-203ENST00000334141 993 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PLD3Q8IV08 CUTA-202ENST00000374496 762 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PLD3Q8IV08 SELENOM-202ENST00000402395 1054 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PLD3Q8IV08 ITIH1-202ENST00000405128 1122 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PLD3Q8IV08 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
PLD3Q8IV08 AL353779.1-201ENST00000434793 351 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
PLD3Q8IV08 AC093459.1-202ENST00000438963 768 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PLD3Q8IV08 AC087294.1-202ENST00000439136 487 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PLD3Q8IV08 RHOA-206ENST00000454011 889 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PLD3Q8IV08 SLC25A30-AS1-201ENST00000506633 701 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PLD3Q8IV08 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PLD3Q8IV08 AP001107.3-201ENST00000534065 544 ntTSL 4 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PLD3Q8IV08 AC009088.3-201ENST00000563605 357 ntTSL 3 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PLD3Q8IV08 AC087294.1-201ENST00000580291 1152 ntTSL 2 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PLD3Q8IV08 OR2T27-203ENST00000641652 1285 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PLD3Q8IV08 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PLD3Q8IV08 ICAM3-201ENST00000160262 1934 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PLD3Q8IV08 NDOR1-202ENST00000371521 2497 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PLD3Q8IV08 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PLD3Q8IV08 GTF3C5-204ENST00000372108 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PLD3Q8IV08 FKBP1C-201ENST00000370659 1579 ntAPPRIS P1 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PLD3Q8IV08 LINC00174-204ENST00000421767 4702 ntTSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PLD3Q8IV08 TMEM132D-AS2-201ENST00000542578 1568 ntTSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PLD3Q8IV08 AC005089.1-201ENST00000619486 2241 ntBASIC14.93□□□□□ -0.02
PLD3Q8IV08 TNIK-204ENST00000436636 6970 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PLD3Q8IV08 VSIG10L-201ENST00000335624 3397 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.93□□□□□ -0.02
PLD3Q8IV08 LRRC6-213ENST00000620350 1878 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.93□□□□□ -0.02
PLD3Q8IV08 GORAB-202ENST00000367763 2189 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PLD3Q8IV08 GAD2-203ENST00000376261 5858 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PLD3Q8IV08 LINC00900-201ENST00000499809 3322 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PLD3Q8IV08 CCP110-203ENST00000396212 5549 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PLD3Q8IV08 COL17A1-201ENST00000353479 5734 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PLD3Q8IV08 PCCB-204ENST00000462637 1715 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PLD3Q8IV08 NPHP3-AS1-201ENST00000489343 2957 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PLD3Q8IV08 AGTPBP1-208ENST00000628899 4222 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PLD3Q8IV08 NDRG2-202ENST00000298687 2122 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PLD3Q8IV08 NDRG2-203ENST00000350792 2127 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PLD3Q8IV08 ABHD14B-201ENST00000315877 2236 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PLD3Q8IV08 BMP1-203ENST00000354870 3989 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PLD3Q8IV08 PLEKHN1-203ENST00000379410 2404 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PLD3Q8IV08 FMO5-201ENST00000254090 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PLD3Q8IV08 CICP24-201ENST00000605464 2705 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
PLD3Q8IV08 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PLD3Q8IV08 MRPL16-201ENST00000300151 1182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PLD3Q8IV08 RABL2A-203ENST00000393166 1052 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PLD3Q8IV08 SNCA-205ENST00000394991 1290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PLD3Q8IV08 AL157935.1-209ENST00000415141 1105 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PLD3Q8IV08 MOGAT3-203ENST00000440203 1219 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PLD3Q8IV08 MYCLP2-201ENST00000449268 967 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
PLD3Q8IV08 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
PLD3Q8IV08 PTPRG-AS1-205ENST00000475371 733 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PLD3Q8IV08 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PLD3Q8IV08 NAALADL1-208ENST00000528884 973 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PLD3Q8IV08 TMEM218-210ENST00000529609 734 ntTSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PLD3Q8IV08 AC008758.5-201ENST00000595562 617 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PLD3Q8IV08 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PLD3Q8IV08 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
PLD3Q8IV08 NDUFS7-218ENST00000618074 688 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PLD3Q8IV08 NDUFS7-219ENST00000620479 754 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PLD3Q8IV08 CD300LG-206ENST00000588884 1459 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PLD3Q8IV08 PRPS1-204ENST00000372435 2073 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PLD3Q8IV08 FBXO41-201ENST00000295133 6928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PLD3Q8IV08 TMEM92-201ENST00000300433 2767 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PLD3Q8IV08 TAF5-201ENST00000369839 3268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PLD3Q8IV08 MIOS-201ENST00000340080 3453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PLD3Q8IV08 FUK-201ENST00000288078 4081 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PLD3Q8IV08 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PLD3Q8IV08 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PLD3Q8IV08 ABTB2-201ENST00000435224 4902 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PLD3Q8IV08 SLC35A2-204ENST00000376521 3047 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PLD3Q8IV08 MBD1-205ENST00000353909 2820 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PLD3Q8IV08 SLC4A9-203ENST00000506545 2838 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PLD3Q8IV08 PNPLA5-201ENST00000216177 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PLD3Q8IV08 POP4-201ENST00000221770 2321 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PLD3Q8IV08 POLL-206ENST00000370172 2308 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PLD3Q8IV08 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PLD3Q8IV08 TSNARE1-201ENST00000307180 1907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PLD3Q8IV08 WRAP53-202ENST00000396463 1905 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PLD3Q8IV08 SGK2-206ENST00000423407 1915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PLD3Q8IV08 APBB1-218ENST00000608655 1920 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PLD3Q8IV08 ADAMTS7P1-201ENST00000613213 4793 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
PLD3Q8IV08 SAMD4A-208ENST00000555192 1337 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
PLD3Q8IV08 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
PLD3Q8IV08 KIF3C-201ENST00000264712 5344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PLD3Q8IV08 MLLT10-201ENST00000307729 5032 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PLD3Q8IV08 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
PLD3Q8IV08 MBD1-203ENST00000339998 2956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
PLD3Q8IV08 GABRG3-208ENST00000615808 10768 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 54.8 ms