Protein–RNA interactions for Protein: Q70EL4

USP43, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 43, humanhuman

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Length 1,123 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP43Q70EL4 RSBN1-204ENST00000612242 6592 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
USP43Q70EL4 ELF4-201ENST00000308167 4165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
USP43Q70EL4 MSH5-201ENST00000375703 2708 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
USP43Q70EL4 AL031728.1-201ENST00000449034 2479 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
USP43Q70EL4 CBX6-201ENST00000216083 3191 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
USP43Q70EL4 ZNF619-201ENST00000314686 2233 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
USP43Q70EL4 B3GNT4-202ENST00000535274 2938 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
USP43Q70EL4 ZC3HAV1-203ENST00000464606 4776 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
USP43Q70EL4 RWDD3-201ENST00000263893 1078 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
USP43Q70EL4 ATP23-201ENST00000300145 1245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
USP43Q70EL4 MRGPRD-201ENST00000309106 966 ntAPPRIS P1 BASIC13.97□□□□□ -0.17
USP43Q70EL4 CLTA-203ENST00000396603 1090 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
USP43Q70EL4 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
USP43Q70EL4 SGO2-202ENST00000409203 1041 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
USP43Q70EL4 TSEN15P1-201ENST00000423257 515 ntBASIC13.97□□□□□ -0.17
USP43Q70EL4 RNASE10-202ENST00000430083 1172 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
USP43Q70EL4 TWIST2-201ENST00000448943 1176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
USP43Q70EL4 SEC24B-AS1-201ENST00000499359 957 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
USP43Q70EL4 SEC24B-AS1-204ENST00000510971 554 ntTSL 4 BASIC13.97□□□□□ -0.17
USP43Q70EL4 MMP17-203ENST00000535004 719 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
USP43Q70EL4 NDUFS7-216ENST00000546283 1060 ntTSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
USP43Q70EL4 AC023355.1-201ENST00000560323 752 ntTSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
USP43Q70EL4 LAT-209ENST00000564277 921 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
USP43Q70EL4 AC002398.2-201ENST00000587767 660 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
USP43Q70EL4 ZEB1-AS1-206ENST00000606250 573 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
USP43Q70EL4 ATP6AP2-220ENST00000636970 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
USP43Q70EL4 NEK10-206ENST00000429845 4250 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
USP43Q70EL4 APBB1-201ENST00000299402 2636 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
USP43Q70EL4 PPP1CB-203ENST00000395366 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
USP43Q70EL4 SERAC1-201ENST00000367101 1907 ntTSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
USP43Q70EL4 ITPRIPL1-205ENST00000536814 1947 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.97□□□□□ -0.17
USP43Q70EL4 BCL9L-201ENST00000334801 10005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
USP43Q70EL4 KIAA0319-204ENST00000537886 6622 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
USP43Q70EL4 NR3C1-209ENST00000503201 2594 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
USP43Q70EL4 TCP11-206ENST00000412155 1690 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.97□□□□□ -0.17
USP43Q70EL4 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
USP43Q70EL4 CHD1-212ENST00000614616 8095 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
USP43Q70EL4 ANO9-201ENST00000332826 2542 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
USP43Q70EL4 AKAP12-204ENST00000402676 8432 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC13.97□□□□□ -0.17
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USP43Q70EL4 GLB1L3-201ENST00000389887 3566 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
USP43Q70EL4 PLEKHA8P1-201ENST00000256692 1839 ntTSL 1 (best) BASIC13.97□□□□□ -0.17
USP43Q70EL4 BCAR1-208ENST00000542031 2846 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
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USP43Q70EL4 AC092535.1-201ENST00000417557 2165 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
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USP43Q70EL4 RPS6KC1-202ENST00000366960 5490 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
USP43Q70EL4 DNAJC27-207ENST00000534855 4831 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
USP43Q70EL4 WDR5-201ENST00000358625 3151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
USP43Q70EL4 FAM84B-201ENST00000304916 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
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USP43Q70EL4 TSPAN4-208ENST00000409531 1339 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
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USP43Q70EL4 SEMA4F-202ENST00000357877 4312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
USP43Q70EL4 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
USP43Q70EL4 CTCFL-205ENST00000423479 2478 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
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USP43Q70EL4 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
USP43Q70EL4 INPPL1-213ENST00000541756 4649 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
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USP43Q70EL4 STOM-202ENST00000347359 870 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
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USP43Q70EL4 AL109613.1-202ENST00000427243 639 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
USP43Q70EL4 FAM58CP-201ENST00000435741 640 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
USP43Q70EL4 AL807752.3-201ENST00000456356 748 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
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USP43Q70EL4 AC020659.2-201ENST00000510176 585 ntTSL 4 BASIC13.96□□□□□ -0.17
USP43Q70EL4 STT3A-AS1-201ENST00000530526 429 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
USP43Q70EL4 POLD4-207ENST00000531239 584 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
USP43Q70EL4 NR2C2AP-204ENST00000538165 891 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
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USP43Q70EL4 LINC00596-201ENST00000559615 937 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
USP43Q70EL4 FXYD1-208ENST00000589209 428 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
USP43Q70EL4 AC027612.4-201ENST00000605371 583 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
USP43Q70EL4 SWI5-206ENST00000608796 906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
USP43Q70EL4 FXYD1-211ENST00000612146 690 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
USP43Q70EL4 PCDHGC4-204ENST00000618371 812 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
USP43Q70EL4 ADGRG2-207ENST00000379869 4768 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
USP43Q70EL4 CICP11-201ENST00000434745 2827 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
USP43Q70EL4 MKNK1-203ENST00000371945 2618 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
USP43Q70EL4 ANO10-203ENST00000396091 2419 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
USP43Q70EL4 HIPK3-201ENST00000303296 7408 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
USP43Q70EL4 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
USP43Q70EL4 FCHSD2-204ENST00000409418 3154 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
USP43Q70EL4 GCFC2-211ENST00000541687 4318 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
USP43Q70EL4 INTS4P1-202ENST00000587624 2985 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
USP43Q70EL4 E2F7-202ENST00000416496 5297 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
USP43Q70EL4 SLC38A11-202ENST00000409058 1647 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
USP43Q70EL4 COLGALT1-201ENST00000252599 3704 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
USP43Q70EL4 ZKSCAN2-201ENST00000328086 7523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
USP43Q70EL4 ATP6V1E1-201ENST00000253413 1402 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
USP43Q70EL4 E2F6-201ENST00000307236 3317 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
USP43Q70EL4 WASHC2A-203ENST00000351071 4642 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
USP43Q70EL4 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
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