Protein–RNA interactions for Protein: Q70CQ2

USP34, Ubiquitin carboxyl-terminal hydrolase 34, humanhuman

Predictions only

Length 3,546 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
USP34Q70CQ2 CST1-201ENST00000304749 760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
USP34Q70CQ2 PCBP3-201ENST00000400304 1086 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
USP34Q70CQ2 PCBP3-208ENST00000449640 1278 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
USP34Q70CQ2 LINC00173-201ENST00000470091 435 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
USP34Q70CQ2 AP000911.2-201ENST00000534330 502 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
USP34Q70CQ2 AC090099.1-203ENST00000527059 2945 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
USP34Q70CQ2 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
USP34Q70CQ2 MMP2-201ENST00000219070 3741 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
USP34Q70CQ2 LINC01502-201ENST00000445997 2471 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
USP34Q70CQ2 NME7-201ENST00000367811 1642 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
USP34Q70CQ2 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
USP34Q70CQ2 FYN-205ENST00000368682 3234 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
USP34Q70CQ2 SCAMP1-AS1-201ENST00000421004 1479 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
USP34Q70CQ2 MMP7-201ENST00000260227 1125 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
USP34Q70CQ2 NUDT2-201ENST00000346365 960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
USP34Q70CQ2 NUDT2-202ENST00000379155 1002 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
USP34Q70CQ2 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
USP34Q70CQ2 KLHL7-204ENST00000410047 1233 ntTSL 5 BASIC14.92□□□□□ -0.02
USP34Q70CQ2 RPL8P2-201ENST00000430538 502 ntBASIC14.92□□□□□ -0.02
USP34Q70CQ2 CHTF8-204ENST00000518041 567 ntTSL 2 BASIC14.92□□□□□ -0.02
USP34Q70CQ2 NUDT2-204ENST00000618590 825 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.92□□□□□ -0.02
USP34Q70CQ2 NR2E3-202ENST00000617575 1998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
USP34Q70CQ2 CMIP-201ENST00000398040 2825 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
USP34Q70CQ2 HPS1-202ENST00000338546 1580 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
USP34Q70CQ2 MTMR1-208ENST00000445323 4516 ntTSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
USP34Q70CQ2 RALGDS-202ENST00000372050 3634 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.92□□□□□ -0.02
USP34Q70CQ2 OSBPL5-210ENST00000525498 2733 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
USP34Q70CQ2 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
USP34Q70CQ2 PTGES3L-AARSD1-202ENST00000409103 1670 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
USP34Q70CQ2 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
USP34Q70CQ2 AMZ2P1-202ENST00000430983 3425 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
USP34Q70CQ2 ZNF226-201ENST00000300823 817 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
USP34Q70CQ2 TMEM208-201ENST00000304800 793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
USP34Q70CQ2 COX8A-201ENST00000314133 507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
USP34Q70CQ2 KRT17P5-201ENST00000332088 839 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
USP34Q70CQ2 AC099811.3-201ENST00000586351 425 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
USP34Q70CQ2 AC079325.2-202ENST00000641031 462 ntAPPRIS ALT2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
USP34Q70CQ2 AC079325.2-201ENST00000641710 606 ntAPPRIS P5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
USP34Q70CQ2 GNB2-202ENST00000393924 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
USP34Q70CQ2 PGR-210ENST00000619228 3038 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
USP34Q70CQ2 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
USP34Q70CQ2 EEF1AKMT3-201ENST00000300209 2563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
USP34Q70CQ2 ARL14EP-201ENST00000282032 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
USP34Q70CQ2 VSTM2A-204ENST00000407838 3112 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
USP34Q70CQ2 RN7SL846P-201ENST00000467429 292 ntBASIC14.91□□□□□ -0.02
USP34Q70CQ2 RHOH-206ENST00000505618 1225 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC14.91□□□□□ -0.02
USP34Q70CQ2 DBP-202ENST00000593500 712 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
USP34Q70CQ2 SMARCD1-202ENST00000394963 3658 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
USP34Q70CQ2 CBWD5-204ENST00000377392 2863 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
USP34Q70CQ2 USP4-203ENST00000415188 1454 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
USP34Q70CQ2 ADAM9-206ENST00000481513 2387 ntTSL 2 BASIC14.91□□□□□ -0.02
USP34Q70CQ2 RAI2-204ENST00000451717 2224 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
USP34Q70CQ2 TRBV5-7-201ENST00000390378 343 ntAPPRIS P1 BASIC14.91□□□□□ -0.02
USP34Q70CQ2 AL157832.2-206ENST00000428178 601 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
USP34Q70CQ2 AL139241.1-201ENST00000433374 1168 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
USP34Q70CQ2 RBM4-211ENST00000530235 1011 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
USP34Q70CQ2 IFI27L1-212ENST00000557218 413 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
USP34Q70CQ2 PSME2-217ENST00000615264 874 ntTSL 5 BASIC14.91□□□□□ -0.02
USP34Q70CQ2 PSME2-218ENST00000630027 185 ntTSL 3 BASIC14.91□□□□□ -0.02
USP34Q70CQ2 HSD17B6-201ENST00000322165 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
USP34Q70CQ2 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
USP34Q70CQ2 SLC25A32-201ENST00000297578 2891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
USP34Q70CQ2 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.91□□□□□ -0.02
USP34Q70CQ2 NCAPH2-201ENST00000299821 1996 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
USP34Q70CQ2 SHC1P1-201ENST00000425230 1745 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
USP34Q70CQ2 FBXO45-202ENST00000440469 3689 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
USP34Q70CQ2 C16orf89-203ENST00000474471 1829 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
USP34Q70CQ2 AC005726.3-202ENST00000577814 1316 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
USP34Q70CQ2 STEAP3-202ENST00000393107 1871 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
USP34Q70CQ2 BID-213ENST00000615414 2236 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
USP34Q70CQ2 SCNN1D-205ENST00000379116 3044 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
USP34Q70CQ2 RPS9-204ENST00000391753 709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
USP34Q70CQ2 KIR2DL4-207ENST00000396293 715 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
USP34Q70CQ2 AC015712.5-201ENST00000558568 564 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
USP34Q70CQ2 HMGB1P24-201ENST00000611897 328 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
USP34Q70CQ2 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
USP34Q70CQ2 IMPDH1-201ENST00000338791 2881 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
USP34Q70CQ2 IMPDH1-217ENST00000626419 2862 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
USP34Q70CQ2 NFATC4-218ENST00000554966 2506 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
USP34Q70CQ2 NFATC4-225ENST00000556169 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
USP34Q70CQ2 AC091100.1-201ENST00000558424 2354 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
USP34Q70CQ2 C9orf116-205ENST00000429260 678 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
USP34Q70CQ2 AC092800.1-201ENST00000449492 579 ntTSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
USP34Q70CQ2 AC026470.1-201ENST00000478038 846 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
USP34Q70CQ2 KRBOX4-206ENST00000478600 730 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
USP34Q70CQ2 AC084752.1-201ENST00000509766 622 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
USP34Q70CQ2 PIGT-208ENST00000545755 1158 ntTSL 5 BASIC14.9□□□□□ -0.02
USP34Q70CQ2 MIR5001-201ENST00000580185 100 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
USP34Q70CQ2 SNRPD2-206ENST00000588301 702 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
USP34Q70CQ2 LINC02081-203ENST00000591384 867 ntTSL 3 BASIC14.9□□□□□ -0.02
USP34Q70CQ2 OCEL1-206ENST00000597836 1044 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
USP34Q70CQ2 BRF1-211ENST00000547530 3358 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
USP34Q70CQ2 GEMIN7-201ENST00000270257 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
USP34Q70CQ2 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
USP34Q70CQ2 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
USP34Q70CQ2 GCLC-213ENST00000616923 3694 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
USP34Q70CQ2 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
USP34Q70CQ2 ACYP2-203ENST00000406041 1913 ntTSL 1 (best) BASIC14.9□□□□□ -0.02
USP34Q70CQ2 AC090616.6-203ENST00000579186 1945 ntBASIC14.9□□□□□ -0.02
USP34Q70CQ2 TMEM139-205ENST00000410004 2114 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.9□□□□□ -0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 90.4 ms