Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMZ3

SYNE3, Nesprin-3, humanhuman

Predictions only

Length 975 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SYNE3Q6ZMZ3 CISH-202ENST00000443053 2167 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SYNE3Q6ZMZ3 ARMC6-206ENST00000535612 2488 ntTSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SYNE3Q6ZMZ3 IL25-201ENST00000329715 1315 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SYNE3Q6ZMZ3 NFYC-205ENST00000372654 1455 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SYNE3Q6ZMZ3 MPDU1-201ENST00000250124 1601 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SYNE3Q6ZMZ3 AL158070.2-201ENST00000623713 1621 ntBASIC17.94■□□□□ 0.46
SYNE3Q6ZMZ3 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.94■□□□□ 0.46
SYNE3Q6ZMZ3 SLC26A10-201ENST00000320442 2389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.94■□□□□ 0.46
SYNE3Q6ZMZ3 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SYNE3Q6ZMZ3 ZNF890P-201ENST00000422060 1352 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SYNE3Q6ZMZ3 KCNT1-211ENST00000491806 3678 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SYNE3Q6ZMZ3 PACSIN2-201ENST00000263246 3249 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SYNE3Q6ZMZ3 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SYNE3Q6ZMZ3 ZNF385A-201ENST00000338010 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SYNE3Q6ZMZ3 NAXD-202ENST00000424185 2311 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SYNE3Q6ZMZ3 KCNJ18-201ENST00000567955 2196 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SYNE3Q6ZMZ3 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SYNE3Q6ZMZ3 CCDC40-202ENST00000374876 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SYNE3Q6ZMZ3 PEX11B-201ENST00000369306 1740 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SYNE3Q6ZMZ3 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SYNE3Q6ZMZ3 GAK-201ENST00000314167 4442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SYNE3Q6ZMZ3 ACTL7B-201ENST00000374667 2379 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SYNE3Q6ZMZ3 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SYNE3Q6ZMZ3 AC098614.1-201ENST00000368528 745 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
SYNE3Q6ZMZ3 NGF-201ENST00000369512 1047 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SYNE3Q6ZMZ3 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SYNE3Q6ZMZ3 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SYNE3Q6ZMZ3 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SYNE3Q6ZMZ3 LINC01784-201ENST00000438401 378 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SYNE3Q6ZMZ3 CCDC25-209ENST00000522915 785 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SYNE3Q6ZMZ3 AC006064.3-201ENST00000537921 477 ntTSL 4 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SYNE3Q6ZMZ3 LINC02387-201ENST00000541749 868 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SYNE3Q6ZMZ3 AC007569.1-201ENST00000550306 600 ntTSL 3 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SYNE3Q6ZMZ3 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SYNE3Q6ZMZ3 IL32-235ENST00000613483 1033 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SYNE3Q6ZMZ3 RBP1-207ENST00000619087 516 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SYNE3Q6ZMZ3 TP73-204ENST00000378280 2062 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SYNE3Q6ZMZ3 CACNA2D3-202ENST00000415676 3661 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SYNE3Q6ZMZ3 MYH6-202ENST00000405093 5941 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SYNE3Q6ZMZ3 C14orf180-203ENST00000557649 2551 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SYNE3Q6ZMZ3 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SYNE3Q6ZMZ3 BET1L-201ENST00000325147 2916 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SYNE3Q6ZMZ3 AC099063.4-201ENST00000641099 1602 ntBASIC17.93■□□□□ 0.46
SYNE3Q6ZMZ3 MTA1-203ENST00000406191 2770 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SYNE3Q6ZMZ3 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SYNE3Q6ZMZ3 GPSM3-207ENST00000375043 1456 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SYNE3Q6ZMZ3 C7orf49-201ENST00000393114 1482 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SYNE3Q6ZMZ3 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SYNE3Q6ZMZ3 JAKMIP1-205ENST00000410077 1835 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SYNE3Q6ZMZ3 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SYNE3Q6ZMZ3 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SYNE3Q6ZMZ3 PCDHB14-201ENST00000239449 4828 ntAPPRIS P1 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SYNE3Q6ZMZ3 RTEL1-201ENST00000318100 4676 ntTSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SYNE3Q6ZMZ3 CROT-201ENST00000331536 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SYNE3Q6ZMZ3 NPY5R-203ENST00000515560 3183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SYNE3Q6ZMZ3 FAM86B1-216ENST00000533852 2043 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.93■□□□□ 0.46
SYNE3Q6ZMZ3 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SYNE3Q6ZMZ3 ARL15-201ENST00000502271 3248 ntTSL 1 (best) BASIC17.93■□□□□ 0.46
SYNE3Q6ZMZ3 TMEM200C-202ENST00000581347 10638 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SYNE3Q6ZMZ3 CAMKK2-202ENST00000337174 5304 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SYNE3Q6ZMZ3 RBFOX3-211ENST00000583458 2934 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SYNE3Q6ZMZ3 AP000550.1-201ENST00000420508 4833 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SYNE3Q6ZMZ3 MAGEA2B-202ENST00000370293 1714 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SYNE3Q6ZMZ3 SALL3-201ENST00000536229 3997 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SYNE3Q6ZMZ3 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SYNE3Q6ZMZ3 LEMD3-201ENST00000308330 4764 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SYNE3Q6ZMZ3 KCNQ4-201ENST00000347132 4099 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SYNE3Q6ZMZ3 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SYNE3Q6ZMZ3 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SYNE3Q6ZMZ3 KATNA1-203ENST00000367411 1984 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SYNE3Q6ZMZ3 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
SYNE3Q6ZMZ3 THBS2-206ENST00000617924 5280 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SYNE3Q6ZMZ3 BANF1-201ENST00000312175 1155 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SYNE3Q6ZMZ3 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SYNE3Q6ZMZ3 FANK1-204ENST00000368695 1296 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SYNE3Q6ZMZ3 MAGEA12-203ENST00000393900 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SYNE3Q6ZMZ3 DSCR3-204ENST00000399001 821 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SYNE3Q6ZMZ3 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SYNE3Q6ZMZ3 AC140481.1-201ENST00000448777 706 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SYNE3Q6ZMZ3 LHX6-205ENST00000464484 666 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SYNE3Q6ZMZ3 ZSCAN2-213ENST00000541040 965 ntTSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SYNE3Q6ZMZ3 AC005342.2-201ENST00000544163 315 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SYNE3Q6ZMZ3 PAM16-204ENST00000571941 674 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SYNE3Q6ZMZ3 AC015819.2-201ENST00000618730 555 ntTSL 3 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SYNE3Q6ZMZ3 ZNF655-225ENST00000626122 705 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SYNE3Q6ZMZ3 AL031056.2-201ENST00000637957 1217 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SYNE3Q6ZMZ3 LANCL2-201ENST00000254770 4353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SYNE3Q6ZMZ3 NFKB2-203ENST00000369966 3101 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SYNE3Q6ZMZ3 MARS-233ENST00000628866 2583 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SYNE3Q6ZMZ3 PNPLA5-202ENST00000381198 2000 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SYNE3Q6ZMZ3 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SYNE3Q6ZMZ3 ELAC1-201ENST00000269466 2235 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SYNE3Q6ZMZ3 KRT85-201ENST00000257901 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SYNE3Q6ZMZ3 AKNA-206ENST00000374088 5464 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SYNE3Q6ZMZ3 MTMR6-201ENST00000381801 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SYNE3Q6ZMZ3 AL360270.3-201ENST00000609118 1348 ntBASIC17.92■□□□□ 0.46
SYNE3Q6ZMZ3 APBB1-217ENST00000608645 1925 ntTSL 5 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SYNE3Q6ZMZ3 FKBP9-201ENST00000242209 3462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.92■□□□□ 0.46
SYNE3Q6ZMZ3 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC17.92■□□□□ 0.46
SYNE3Q6ZMZ3 TRIM50-202ENST00000453152 1599 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.91■□□□□ 0.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 38.1 ms