Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMY3

SPOCD1, SPOC domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,216 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SPOCD1Q6ZMY3 CPSF7-205ENST00000439958 3524 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SPOCD1Q6ZMY3 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SPOCD1Q6ZMY3 GOLGA6L2-201ENST00000312015 1379 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SPOCD1Q6ZMY3 PMS1-221ENST00000624204 3417 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SPOCD1Q6ZMY3 CYB561-219ENST00000584031 3200 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SPOCD1Q6ZMY3 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SPOCD1Q6ZMY3 NPM2-201ENST00000289820 1100 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SPOCD1Q6ZMY3 NPM2-202ENST00000381530 925 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SPOCD1Q6ZMY3 AL645937.2-201ENST00000396808 931 ntBASIC15.79■□□□□ 0.12
SPOCD1Q6ZMY3 LRP5L-201ENST00000402785 1193 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SPOCD1Q6ZMY3 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SPOCD1Q6ZMY3 AL033519.3-201ENST00000450618 595 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SPOCD1Q6ZMY3 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SPOCD1Q6ZMY3 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SPOCD1Q6ZMY3 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SPOCD1Q6ZMY3 AC138304.1-201ENST00000563841 424 ntTSL 3 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SPOCD1Q6ZMY3 PPM1B-205ENST00000409432 3025 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SPOCD1Q6ZMY3 C5orf30-202ENST00000510890 2933 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SPOCD1Q6ZMY3 TMEM209-202ENST00000462753 2322 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SPOCD1Q6ZMY3 TTC28-AS1-219ENST00000454741 5064 ntTSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SPOCD1Q6ZMY3 PTGFRN-201ENST00000393203 6178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SPOCD1Q6ZMY3 ALG3-207ENST00000455059 1697 ntTSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SPOCD1Q6ZMY3 ALOX15-202ENST00000570836 2784 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SPOCD1Q6ZMY3 EEF1A1-202ENST00000316292 4441 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.79■□□□□ 0.12
SPOCD1Q6ZMY3 TTLL13P-202ENST00000438251 2738 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SPOCD1Q6ZMY3 TTC6-206ENST00000553443 5833 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SPOCD1Q6ZMY3 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.79■□□□□ 0.12
SPOCD1Q6ZMY3 C12orf42-201ENST00000378113 1513 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SPOCD1Q6ZMY3 MED29-204ENST00000599213 2490 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SPOCD1Q6ZMY3 COX10-AS1-202ENST00000449363 1944 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SPOCD1Q6ZMY3 MOCS1-205ENST00000373195 2852 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SPOCD1Q6ZMY3 SCGN-202ENST00000377961 1447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SPOCD1Q6ZMY3 BORCS8-MEF2B-203ENST00000514819 1406 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SPOCD1Q6ZMY3 SIGLEC5-201ENST00000534261 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SPOCD1Q6ZMY3 OR2I1P-210ENST00000642037 4691 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SPOCD1Q6ZMY3 ITGB4-206ENST00000579662 5554 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SPOCD1Q6ZMY3 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SPOCD1Q6ZMY3 DNAJB1-201ENST00000254322 2264 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SPOCD1Q6ZMY3 CA12-202ENST00000344366 2744 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SPOCD1Q6ZMY3 SLC6A20-204ENST00000456124 2662 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SPOCD1Q6ZMY3 SP140L-204ENST00000444636 1781 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SPOCD1Q6ZMY3 CPEB3-201ENST00000265997 4851 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SPOCD1Q6ZMY3 HSDL1-201ENST00000219439 3519 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SPOCD1Q6ZMY3 SLC38A10-202ENST00000374759 4300 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SPOCD1Q6ZMY3 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SPOCD1Q6ZMY3 COX6A1-201ENST00000229379 572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SPOCD1Q6ZMY3 PIR-201ENST00000380420 1282 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SPOCD1Q6ZMY3 TMEM26-AS1-201ENST00000389640 863 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SPOCD1Q6ZMY3 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SPOCD1Q6ZMY3 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SPOCD1Q6ZMY3 DHDDS-206ENST00000427245 868 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SPOCD1Q6ZMY3 TMEM176B-202ENST00000429904 1206 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SPOCD1Q6ZMY3 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SPOCD1Q6ZMY3 SHBG-204ENST00000441599 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SPOCD1Q6ZMY3 GNAQP1-201ENST00000444815 1067 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SPOCD1Q6ZMY3 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SPOCD1Q6ZMY3 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SPOCD1Q6ZMY3 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SPOCD1Q6ZMY3 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SPOCD1Q6ZMY3 AL390726.5-201ENST00000562942 871 ntTSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SPOCD1Q6ZMY3 IGHV3OR16-8-201ENST00000565407 349 ntAPPRIS P1 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SPOCD1Q6ZMY3 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SPOCD1Q6ZMY3 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SPOCD1Q6ZMY3 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SPOCD1Q6ZMY3 CA10-201ENST00000285273 2914 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SPOCD1Q6ZMY3 PAF1-201ENST00000221265 2066 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SPOCD1Q6ZMY3 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC15.78■□□□□ 0.12
SPOCD1Q6ZMY3 RCOR1-201ENST00000262241 5754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SPOCD1Q6ZMY3 CYP4F11-202ENST00000326742 2877 ntTSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SPOCD1Q6ZMY3 SLCO6A1-205ENST00000506729 2689 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SPOCD1Q6ZMY3 ECHDC2-203ENST00000371522 1509 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SPOCD1Q6ZMY3 SPATA33-210ENST00000611218 1546 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.78■□□□□ 0.12
SPOCD1Q6ZMY3 ITFG1-201ENST00000320640 3400 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SPOCD1Q6ZMY3 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SPOCD1Q6ZMY3 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.78■□□□□ 0.12
SPOCD1Q6ZMY3 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SPOCD1Q6ZMY3 HSPA1B-201ENST00000375650 2521 ntAPPRIS P1 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SPOCD1Q6ZMY3 ITSN1-204ENST00000381285 6107 ntTSL 5 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SPOCD1Q6ZMY3 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SPOCD1Q6ZMY3 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SPOCD1Q6ZMY3 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SPOCD1Q6ZMY3 TIFA-201ENST00000361717 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SPOCD1Q6ZMY3 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC15.77■□□□□ 0.12
SPOCD1Q6ZMY3 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SPOCD1Q6ZMY3 PSMG3-AS1-201ENST00000437621 5701 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SPOCD1Q6ZMY3 PIANP-202ENST00000534837 2695 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SPOCD1Q6ZMY3 TELO2-201ENST00000262319 3314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SPOCD1Q6ZMY3 ACY3-201ENST00000255082 1300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SPOCD1Q6ZMY3 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SPOCD1Q6ZMY3 HOGA1-203ENST00000370647 1999 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SPOCD1Q6ZMY3 NMUR1-201ENST00000305141 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SPOCD1Q6ZMY3 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SPOCD1Q6ZMY3 ZDHHC12-201ENST00000372663 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SPOCD1Q6ZMY3 ZSCAN2-205ENST00000379358 906 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SPOCD1Q6ZMY3 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SPOCD1Q6ZMY3 LINC00659-201ENST00000412500 540 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
SPOCD1Q6ZMY3 AC019103.1-201ENST00000503095 272 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SPOCD1Q6ZMY3 AC009902.2-201ENST00000518880 620 ntTSL 4 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SPOCD1Q6ZMY3 AC009686.1-201ENST00000522494 364 ntTSL 3 BASIC15.77■□□□□ 0.12
SPOCD1Q6ZMY3 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC15.77■□□□□ 0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 77.2 ms