Protein–RNA interactions for Protein: Q6ZMU5

TRIM72, Tripartite motif-containing protein 72, humanhuman

Predictions only

Length 477 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TRIM72Q6ZMU5 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIM72Q6ZMU5 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIM72Q6ZMU5 TAS1R1-201ENST00000333172 2892 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIM72Q6ZMU5 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIM72Q6ZMU5 MBOAT2-201ENST00000305997 7751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIM72Q6ZMU5 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIM72Q6ZMU5 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIM72Q6ZMU5 KRT20-201ENST00000167588 1737 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIM72Q6ZMU5 PLTP-201ENST00000354050 1731 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIM72Q6ZMU5 TPM1-206ENST00000358278 1717 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIM72Q6ZMU5 UCP3-202ENST00000426995 1406 ntTSL 1 (best) BASIC16.11■□□□□ 0.17
TRIM72Q6ZMU5 DNAJC22-201ENST00000395069 2059 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM72Q6ZMU5 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM72Q6ZMU5 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM72Q6ZMU5 TMEM230-201ENST00000202834 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM72Q6ZMU5 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM72Q6ZMU5 FECH-202ENST00000382873 2526 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM72Q6ZMU5 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM72Q6ZMU5 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM72Q6ZMU5 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM72Q6ZMU5 DNAH14-204ENST00000366849 2215 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM72Q6ZMU5 ARHGEF16-201ENST00000378371 2219 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM72Q6ZMU5 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM72Q6ZMU5 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM72Q6ZMU5 STXBP6-201ENST00000323944 4132 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM72Q6ZMU5 ZNF586-202ENST00000396150 1977 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM72Q6ZMU5 SNAP91-213ENST00000521485 4521 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM72Q6ZMU5 FAM104B-202ENST00000358460 1179 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM72Q6ZMU5 C1orf43-205ENST00000368519 1163 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM72Q6ZMU5 GLIPR1L1-202ENST00000378695 885 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM72Q6ZMU5 GALT-202ENST00000450095 1280 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM72Q6ZMU5 AC022616.1-201ENST00000518688 554 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM72Q6ZMU5 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM72Q6ZMU5 API5-211ENST00000534695 560 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM72Q6ZMU5 AC004771.3-201ENST00000574260 551 ntTSL 4 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM72Q6ZMU5 ELOF1-206ENST00000590700 585 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM72Q6ZMU5 CHCHD2P3-201ENST00000603038 451 ntBASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM72Q6ZMU5 KIF22-208ENST00000569382 2020 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM72Q6ZMU5 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM72Q6ZMU5 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM72Q6ZMU5 AIFM1-209ENST00000535724 2468 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM72Q6ZMU5 POLD3-208ENST00000532497 1700 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM72Q6ZMU5 POM121C-206ENST00000607367 3690 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM72Q6ZMU5 PTPRH-201ENST00000263434 3343 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM72Q6ZMU5 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM72Q6ZMU5 AP001627.1-201ENST00000437426 1754 ntTSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM72Q6ZMU5 AC058822.1-201ENST00000507166 2550 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM72Q6ZMU5 IER5-201ENST00000367577 4188 ntAPPRIS P1 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM72Q6ZMU5 SRPX-206ENST00000544439 1842 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM72Q6ZMU5 ST14-201ENST00000278742 3539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM72Q6ZMU5 RASA4-201ENST00000262940 5605 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM72Q6ZMU5 DUOXA1-216ENST00000613425 1867 ntTSL 5 BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM72Q6ZMU5 GRAMD2B-201ENST00000285689 3175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.1■□□□□ 0.17
TRIM72Q6ZMU5 ZNF563-201ENST00000293725 2754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM72Q6ZMU5 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM72Q6ZMU5 DMPK-202ENST00000343373 3227 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM72Q6ZMU5 TEN1-CDK3-202ENST00000569284 3287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM72Q6ZMU5 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM72Q6ZMU5 PTPN20-206ENST00000395722 1995 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM72Q6ZMU5 AC012313.3-202ENST00000599109 3322 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM72Q6ZMU5 TMEM230-202ENST00000342308 1562 ntTSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM72Q6ZMU5 LIMS2-205ENST00000409455 2500 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM72Q6ZMU5 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM72Q6ZMU5 SPAAR-202ENST00000443779 1612 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM72Q6ZMU5 FP565260.6-204ENST00000620528 1640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM72Q6ZMU5 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM72Q6ZMU5 AAAS-217ENST00000550286 1652 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM72Q6ZMU5 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM72Q6ZMU5 ADAM15-201ENST00000271836 2799 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM72Q6ZMU5 HEY1-202ENST00000354724 2293 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM72Q6ZMU5 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM72Q6ZMU5 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM72Q6ZMU5 RNU1-114P-201ENST00000365297 166 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM72Q6ZMU5 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM72Q6ZMU5 BRF1-202ENST00000379932 884 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM72Q6ZMU5 KRTAP6-3-201ENST00000391624 636 ntAPPRIS P1 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM72Q6ZMU5 CRYAA-203ENST00000398133 600 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM72Q6ZMU5 THPO-202ENST00000421442 1132 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM72Q6ZMU5 SPATA3-204ENST00000433428 856 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM72Q6ZMU5 FXYD1-202ENST00000455515 594 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM72Q6ZMU5 AC026774.1-201ENST00000503652 691 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM72Q6ZMU5 HNRNPA1P13-201ENST00000510646 963 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM72Q6ZMU5 AC136475.2-201ENST00000526612 392 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM72Q6ZMU5 IL32-234ENST00000552936 713 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM72Q6ZMU5 RPL36-203ENST00000577222 874 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM72Q6ZMU5 RN7SL204P-201ENST00000582831 262 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM72Q6ZMU5 AC011497.1-201ENST00000596781 561 ntTSL 4 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM72Q6ZMU5 AP005019.2-201ENST00000615104 511 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM72Q6ZMU5 FP236240.1-202ENST00000624019 601 ntTSL 3 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM72Q6ZMU5 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM72Q6ZMU5 IDH3G-212ENST00000619865 1339 ntTSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM72Q6ZMU5 QRICH1-202ENST00000395443 3549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM72Q6ZMU5 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM72Q6ZMU5 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM72Q6ZMU5 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM72Q6ZMU5 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM72Q6ZMU5 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM72Q6ZMU5 DAB2IP-201ENST00000259371 5469 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM72Q6ZMU5 C16orf52-202ENST00000542527 4360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.09■□□□□ 0.17
TRIM72Q6ZMU5 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.09■□□□□ 0.17
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31 ms