Protein–RNA interactions for Protein: Q6VB84

FOXD4L3, Forkhead box protein D4-like 3, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 417 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FOXD4L3Q6VB84 SLED1-202ENST00000512051 380 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
FOXD4L3Q6VB84 RCHY1-208ENST00000512706 1011 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
FOXD4L3Q6VB84 WASHC3-213ENST00000545679 865 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
FOXD4L3Q6VB84 COX14-202ENST00000548985 677 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
FOXD4L3Q6VB84 CD300LG-205ENST00000586233 942 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FOXD4L3Q6VB84 DM1-AS-201ENST00000586251 483 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
FOXD4L3Q6VB84 UBL5-208ENST00000593087 320 ntTSL 3 BASIC17.87■□□□□ 0.45
FOXD4L3Q6VB84 AC107896.1-201ENST00000593212 548 ntTSL 4 BASIC17.87■□□□□ 0.45
FOXD4L3Q6VB84 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FOXD4L3Q6VB84 AC012366.1-201ENST00000615411 473 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
FOXD4L3Q6VB84 AL157832.3-201ENST00000635764 1005 ntTSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
FOXD4L3Q6VB84 MRC2-202ENST00000446119 3201 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
FOXD4L3Q6VB84 TMEM225B-202ENST00000431679 1314 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
FOXD4L3Q6VB84 INF2-203ENST00000392634 4672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
FOXD4L3Q6VB84 TSSK3-201ENST00000373534 1368 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FOXD4L3Q6VB84 KCNJ5-203ENST00000533599 1350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FOXD4L3Q6VB84 ADAM33-201ENST00000350009 3480 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
FOXD4L3Q6VB84 NUP98-201ENST00000324932 6973 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FOXD4L3Q6VB84 DEK-201ENST00000244776 1441 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
FOXD4L3Q6VB84 TRMT1-201ENST00000221504 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FOXD4L3Q6VB84 AC067750.1-201ENST00000608826 6545 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
FOXD4L3Q6VB84 UNQ6494-202ENST00000617436 2163 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
FOXD4L3Q6VB84 HTR3A-206ENST00000506841 2221 ntTSL 2 BASIC17.87■□□□□ 0.45
FOXD4L3Q6VB84 MKS1-202ENST00000393119 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FOXD4L3Q6VB84 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
FOXD4L3Q6VB84 AL928921.2-201ENST00000641325 2442 ntBASIC17.87■□□□□ 0.45
FOXD4L3Q6VB84 ADAM12-201ENST00000368676 3313 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.87■□□□□ 0.45
FOXD4L3Q6VB84 ARHGAP27-203ENST00000428638 4242 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.87■□□□□ 0.45
FOXD4L3Q6VB84 OGFOD3-201ENST00000313056 4287 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FOXD4L3Q6VB84 HNF4G-201ENST00000354370 1728 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FOXD4L3Q6VB84 HNRNPA0-201ENST00000314940 8726 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FOXD4L3Q6VB84 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FOXD4L3Q6VB84 SLC2A4-204ENST00000571308 1768 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FOXD4L3Q6VB84 MAGEA9-201ENST00000243314 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FOXD4L3Q6VB84 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FOXD4L3Q6VB84 KDM1B-201ENST00000297792 3811 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FOXD4L3Q6VB84 FUK-202ENST00000378912 3925 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FOXD4L3Q6VB84 PLCB1-218ENST00000629992 3095 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FOXD4L3Q6VB84 CDK17-201ENST00000261211 4157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FOXD4L3Q6VB84 PRKD1-202ENST00000415220 3189 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FOXD4L3Q6VB84 SLC2A11-223ENST00000611880 3264 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FOXD4L3Q6VB84 ABR-205ENST00000544583 5595 ntTSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FOXD4L3Q6VB84 TMEM184B-202ENST00000361906 3611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FOXD4L3Q6VB84 MINPP1-202ENST00000371996 2415 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FOXD4L3Q6VB84 GLIS2-202ENST00000433375 3705 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FOXD4L3Q6VB84 FBXO42-201ENST00000375592 6202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FOXD4L3Q6VB84 KLHL25-201ENST00000337975 3758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FOXD4L3Q6VB84 CENPM-201ENST00000215980 966 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FOXD4L3Q6VB84 EBI3-201ENST00000221847 1186 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FOXD4L3Q6VB84 TRAPPC1-201ENST00000303731 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FOXD4L3Q6VB84 ITLN1-201ENST00000326245 1183 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FOXD4L3Q6VB84 C1QA-201ENST00000374642 1143 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FOXD4L3Q6VB84 CASC10-201ENST00000377113 3801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FOXD4L3Q6VB84 RAD18-204ENST00000418463 563 ntTSL 4 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FOXD4L3Q6VB84 GRTP1-AS1-201ENST00000419199 867 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FOXD4L3Q6VB84 RAD18-205ENST00000421052 582 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FOXD4L3Q6VB84 GHSR-202ENST00000427970 912 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
FOXD4L3Q6VB84 AC112482.1-201ENST00000492080 688 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
FOXD4L3Q6VB84 SSBP1-214ENST00000498107 636 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FOXD4L3Q6VB84 AC091133.3-201ENST00000504865 432 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FOXD4L3Q6VB84 AC024230.1-201ENST00000511431 889 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FOXD4L3Q6VB84 AC103736.1-203ENST00000524565 872 ntTSL 3 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FOXD4L3Q6VB84 CCDC85C-204ENST00000555822 930 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FOXD4L3Q6VB84 RPL27-206ENST00000589913 697 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FOXD4L3Q6VB84 AC025181.2-201ENST00000606994 802 ntBASIC17.86■□□□□ 0.45
FOXD4L3Q6VB84 SDR42E2-201ENST00000602312 2630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FOXD4L3Q6VB84 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FOXD4L3Q6VB84 SPOCK3-201ENST00000357154 2986 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FOXD4L3Q6VB84 AXL-201ENST00000301178 4737 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FOXD4L3Q6VB84 HM13-202ENST00000340852 1606 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FOXD4L3Q6VB84 KLHDC7A-201ENST00000400664 5145 ntAPPRIS P1 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FOXD4L3Q6VB84 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FOXD4L3Q6VB84 TDRD10-201ENST00000368480 1776 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FOXD4L3Q6VB84 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FOXD4L3Q6VB84 ADPRHL1-201ENST00000356501 1877 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FOXD4L3Q6VB84 CMTM6-201ENST00000205636 3863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FOXD4L3Q6VB84 SNX2-201ENST00000379516 2128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FOXD4L3Q6VB84 AC097374.1-201ENST00000568768 6624 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FOXD4L3Q6VB84 RBM47-203ENST00000381795 4473 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC17.86■□□□□ 0.45
FOXD4L3Q6VB84 OPN4-202ENST00000372071 2401 ntTSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FOXD4L3Q6VB84 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.86■□□□□ 0.45
FOXD4L3Q6VB84 ARHGEF7-201ENST00000218789 5233 ntTSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
FOXD4L3Q6VB84 P4HA1-205ENST00000440381 2790 ntTSL 3 BASIC17.85■□□□□ 0.45
FOXD4L3Q6VB84 BRAT1-201ENST00000340611 2915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
FOXD4L3Q6VB84 GLB1L2-205ENST00000535456 3365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
FOXD4L3Q6VB84 RADIL-201ENST00000399583 3689 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.85■□□□□ 0.45
FOXD4L3Q6VB84 MPPED2-202ENST00000448418 5591 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
FOXD4L3Q6VB84 MTMR6-201ENST00000381801 5659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
FOXD4L3Q6VB84 MSTO1-201ENST00000245564 2431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
FOXD4L3Q6VB84 ATXN7-201ENST00000295900 7224 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
FOXD4L3Q6VB84 LSM1-201ENST00000311351 1147 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
FOXD4L3Q6VB84 UVRAG-201ENST00000356136 4123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
FOXD4L3Q6VB84 PXDNL-201ENST00000356297 4805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
FOXD4L3Q6VB84 TBC1D7-202ENST00000356436 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
FOXD4L3Q6VB84 ARFGAP1-202ENST00000370275 3467 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
FOXD4L3Q6VB84 GRIN1-206ENST00000371559 3577 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
FOXD4L3Q6VB84 CAPZB-204ENST00000375144 1568 ntTSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
FOXD4L3Q6VB84 TBC1D7-204ENST00000379300 1276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
FOXD4L3Q6VB84 SCFD2-201ENST00000388940 2221 ntTSL 2 BASIC17.85■□□□□ 0.45
FOXD4L3Q6VB84 HIC2-202ENST00000407598 4734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.85■□□□□ 0.45
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms