Protein–RNA interactions for Protein: Q6DD88

ATL3, Atlastin-3, humanhuman

Predictions only

Length 541 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ATL3Q6DD88 HMBOX1-210ENST00000523613 1730 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
ATL3Q6DD88 FP565260.2-201ENST00000623476 1599 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.37
ATL3Q6DD88 ARHGEF16-203ENST00000378378 3061 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
ATL3Q6DD88 TBC1D2-201ENST00000342112 3046 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.37
ATL3Q6DD88 EIF3J-AS1-201ENST00000313807 2863 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ATL3Q6DD88 SPATS1-201ENST00000288390 1354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ATL3Q6DD88 COL25A1-203ENST00000399132 2724 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ATL3Q6DD88 DYSF-207ENST00000409762 6727 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ATL3Q6DD88 DYSF-211ENST00000429174 6739 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ATL3Q6DD88 B9D2-201ENST00000243578 1027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ATL3Q6DD88 B9D1-201ENST00000261499 908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ATL3Q6DD88 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ATL3Q6DD88 DUPD1-201ENST00000338487 663 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ATL3Q6DD88 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ATL3Q6DD88 B9D1-203ENST00000395615 805 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ATL3Q6DD88 MEP1AP4-201ENST00000423244 1087 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
ATL3Q6DD88 LRRC74B-201ENST00000442047 1179 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ATL3Q6DD88 SLC35B4-204ENST00000470969 1033 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ATL3Q6DD88 MLF1-210ENST00000484955 1247 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ATL3Q6DD88 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ATL3Q6DD88 LSM1-203ENST00000520755 975 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ATL3Q6DD88 HDAC2-AS2-213ENST00000520891 603 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ATL3Q6DD88 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ATL3Q6DD88 TOMM5-205ENST00000544379 635 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ATL3Q6DD88 RIC8B-209ENST00000549643 571 ntTSL 4 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ATL3Q6DD88 BORCS8-206ENST00000585679 801 ntTSL 3 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ATL3Q6DD88 LINC01515-215ENST00000608678 854 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ATL3Q6DD88 AC004840.1-201ENST00000636359 365 ntBASIC17.33■□□□□ 0.36
ATL3Q6DD88 CLN3-255ENST00000637100 1284 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ATL3Q6DD88 PRF1-203ENST00000638674 1080 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ATL3Q6DD88 RUSC1-202ENST00000368347 2503 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ATL3Q6DD88 GLG1-203ENST00000447066 3626 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ATL3Q6DD88 GAS2L3-201ENST00000266754 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ATL3Q6DD88 GSTCD-206ENST00000507281 2091 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ATL3Q6DD88 SERINC2-206ENST00000536859 2072 ntTSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ATL3Q6DD88 MAST1-201ENST00000251472 4833 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ATL3Q6DD88 SLC26A11-202ENST00000411502 2872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ATL3Q6DD88 NMNAT3-202ENST00000339837 1863 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ATL3Q6DD88 CHN2-201ENST00000222792 3530 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ATL3Q6DD88 CCDC47-201ENST00000225726 3466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ATL3Q6DD88 BTBD11-204ENST00000420571 3478 ntTSL 5 BASIC17.33■□□□□ 0.36
ATL3Q6DD88 UBR5-207ENST00000520539 10297 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
ATL3Q6DD88 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATL3Q6DD88 RFC5-204ENST00000454402 1655 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATL3Q6DD88 ZBTB7C-204ENST00000586438 4899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATL3Q6DD88 MGAT1-202ENST00000333055 8863 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATL3Q6DD88 WIZ-207ENST00000599910 4609 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATL3Q6DD88 DDTL-201ENST00000215770 1545 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATL3Q6DD88 SMYD3-214ENST00000490107 1548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATL3Q6DD88 P2RX5-208ENST00000552050 1536 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATL3Q6DD88 NDNF-201ENST00000379692 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATL3Q6DD88 SEC16A-202ENST00000290037 8982 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATL3Q6DD88 PGC-202ENST00000373025 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATL3Q6DD88 TSC22D1-211ENST00000501704 4026 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATL3Q6DD88 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATL3Q6DD88 ZFPM2-206ENST00000520492 3960 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATL3Q6DD88 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATL3Q6DD88 BEND3P1-201ENST00000421591 1944 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
ATL3Q6DD88 MIOX-201ENST00000216075 1130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATL3Q6DD88 MIR1233-2-201ENST00000408138 82 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
ATL3Q6DD88 MIR1233-1-201ENST00000408722 82 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
ATL3Q6DD88 AC004890.2-204ENST00000481968 304 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
ATL3Q6DD88 FAM172A-207ENST00000509739 1031 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATL3Q6DD88 SPDYE18-201ENST00000510091 1050 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
ATL3Q6DD88 AC008738.7-201ENST00000609744 511 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
ATL3Q6DD88 AC093028.1-201ENST00000622998 982 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
ATL3Q6DD88 WDR45-230ENST00000634559 1192 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATL3Q6DD88 SCP2-217ENST00000640998 1101 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATL3Q6DD88 IFNAR1-201ENST00000270139 6139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATL3Q6DD88 AKT1S1-205ENST00000391833 3640 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATL3Q6DD88 FOXP3-203ENST00000376207 2382 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATL3Q6DD88 ZNF772-202ENST00000356584 1799 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATL3Q6DD88 TGFB1I1-214ENST00000567607 1770 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATL3Q6DD88 BTNL8-206ENST00000508408 1717 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATL3Q6DD88 SLC1A7-206ENST00000620347 2873 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATL3Q6DD88 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATL3Q6DD88 CAMK2B-206ENST00000353625 1624 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATL3Q6DD88 UBE4B-201ENST00000253251 4772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATL3Q6DD88 ALDH8A1-204ENST00000367847 1587 ntTSL 2 BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATL3Q6DD88 AC022144.1-201ENST00000602255 1580 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
ATL3Q6DD88 ACSM1-201ENST00000307493 2051 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
ATL3Q6DD88 CD300C-201ENST00000330793 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATL3Q6DD88 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATL3Q6DD88 CGN-201ENST00000271636 5091 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATL3Q6DD88 UBXN11-206ENST00000374222 2043 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATL3Q6DD88 BLCAP-205ENST00000397137 2036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATL3Q6DD88 UBAP1-202ENST00000359544 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATL3Q6DD88 RNF182-208ENST00000544682 3495 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATL3Q6DD88 BCL11A-201ENST00000335712 5942 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATL3Q6DD88 RABL2A-206ENST00000409842 1979 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATL3Q6DD88 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
ATL3Q6DD88 LTBP2-201ENST00000261978 8567 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATL3Q6DD88 KIRREL1-202ENST00000360089 3304 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATL3Q6DD88 KRT8P14-201ENST00000414254 1442 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
ATL3Q6DD88 TACR3-201ENST00000304883 5190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATL3Q6DD88 PHKG2-204ENST00000563588 5539 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATL3Q6DD88 SLCO5A1-201ENST00000260126 9076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATL3Q6DD88 DMTN-203ENST00000381470 2601 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATL3Q6DD88 CHST3-201ENST00000373115 6970 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
ATL3Q6DD88 RPS23-201ENST00000296674 3437 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.1 ms