Protein–RNA interactions for Protein: Q6AI12

ANKRD40, Ankyrin repeat domain-containing protein 40, humanhuman

Predictions only

Length 368 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD40Q6AI12 XPO6-201ENST00000304658 4422 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.71■□□□□ 0.26
ANKRD40Q6AI12 AC015656.1-201ENST00000624209 3578 ntBASIC16.71■□□□□ 0.26
ANKRD40Q6AI12 GRAPL-201ENST00000344415 1308 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ANKRD40Q6AI12 RB1CC1-202ENST00000435644 6614 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ANKRD40Q6AI12 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ANKRD40Q6AI12 GABARAP-201ENST00000302386 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ANKRD40Q6AI12 BX640514.1-201ENST00000583223 1918 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
ANKRD40Q6AI12 INTS4P2-202ENST00000614726 2019 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
ANKRD40Q6AI12 RIOX2-202ENST00000360258 2232 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ANKRD40Q6AI12 GREM1-202ENST00000560830 2648 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ANKRD40Q6AI12 DNAJC14-201ENST00000317269 3330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ANKRD40Q6AI12 IRF2BP2-202ENST00000366610 4615 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ANKRD40Q6AI12 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ANKRD40Q6AI12 USP45-201ENST00000327681 6255 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ANKRD40Q6AI12 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ANKRD40Q6AI12 NEIL2-201ENST00000284503 2671 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ANKRD40Q6AI12 TNFAIP8L3-201ENST00000327536 2262 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ANKRD40Q6AI12 MFRP-201ENST00000360167 1663 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ANKRD40Q6AI12 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ANKRD40Q6AI12 IDH3B-202ENST00000380851 1230 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ANKRD40Q6AI12 TRIM74-202ENST00000395244 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ANKRD40Q6AI12 ANKRD54-202ENST00000406423 954 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ANKRD40Q6AI12 AP1S3-204ENST00000409375 552 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ANKRD40Q6AI12 TMEM147-AS1-201ENST00000444728 487 ntTSL 3 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ANKRD40Q6AI12 TRIM73-204ENST00000447409 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ANKRD40Q6AI12 SERBP1P5-201ENST00000510079 1181 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
ANKRD40Q6AI12 AC055876.2-201ENST00000531834 546 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
ANKRD40Q6AI12 YEATS4-202ENST00000548020 1100 ntTSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ANKRD40Q6AI12 AC067852.1-201ENST00000585572 594 ntTSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ANKRD40Q6AI12 DUSP13-214ENST00000607131 1019 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ANKRD40Q6AI12 BARD1-209ENST00000613192 703 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ANKRD40Q6AI12 AGAP1-213ENST00000619456 1057 ntTSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ANKRD40Q6AI12 BX539320.1-201ENST00000623759 877 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
ANKRD40Q6AI12 ABCB7-202ENST00000339447 2234 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ANKRD40Q6AI12 JPH4-205ENST00000622501 3489 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ANKRD40Q6AI12 TMPRSS6-204ENST00000406856 3178 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ANKRD40Q6AI12 RHOBTB2-206ENST00000522948 4959 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ANKRD40Q6AI12 RHD-206ENST00000423810 1637 ntTSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ANKRD40Q6AI12 UCKL1-AS1-201ENST00000623569 3602 ntBASIC16.7■□□□□ 0.26
ANKRD40Q6AI12 POMK-203ENST00000614426 1527 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ANKRD40Q6AI12 FAM208A-201ENST00000355628 5239 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ANKRD40Q6AI12 FKBP6-204ENST00000431982 1446 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.7■□□□□ 0.26
ANKRD40Q6AI12 KIF26A-201ENST00000315264 6714 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.7■□□□□ 0.26
ANKRD40Q6AI12 NACC1-201ENST00000292431 4445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ANKRD40Q6AI12 KATNBL1-201ENST00000256544 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ANKRD40Q6AI12 CTTN-202ENST00000346329 3272 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ANKRD40Q6AI12 MAGED4B-202ENST00000360134 2510 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ANKRD40Q6AI12 DMTN-205ENST00000432128 2508 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ANKRD40Q6AI12 POLR2B-205ENST00000441246 3839 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ANKRD40Q6AI12 NMNAT3-201ENST00000296202 1569 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ANKRD40Q6AI12 PWWP2A-201ENST00000307063 3346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ANKRD40Q6AI12 TEAD4-203ENST00000397122 1396 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ANKRD40Q6AI12 YWHAE-208ENST00000571732 1818 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ANKRD40Q6AI12 ETFB-201ENST00000309244 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ANKRD40Q6AI12 TEX30-203ENST00000376022 828 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ANKRD40Q6AI12 UBE2F-202ENST00000409332 1138 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ANKRD40Q6AI12 GABARAPL1-202ENST00000421801 855 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ANKRD40Q6AI12 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ANKRD40Q6AI12 PXN-AS1-201ENST00000535200 1170 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ANKRD40Q6AI12 AP006333.1-201ENST00000543817 575 ntTSL 4 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ANKRD40Q6AI12 AL359711.2-201ENST00000563105 872 ntBASIC16.69■□□□□ 0.26
ANKRD40Q6AI12 ADGRA1-AS1-202ENST00000444433 2646 ntTSL 3 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ANKRD40Q6AI12 TMCO3-202ENST00000434316 3050 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ANKRD40Q6AI12 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ANKRD40Q6AI12 FBXO28-201ENST00000366862 5451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ANKRD40Q6AI12 RAB5B-202ENST00000448789 1530 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ANKRD40Q6AI12 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ANKRD40Q6AI12 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ANKRD40Q6AI12 CAMLG-201ENST00000297156 2221 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ANKRD40Q6AI12 KRT32-201ENST00000225899 1750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ANKRD40Q6AI12 COMP-201ENST00000222271 2461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ANKRD40Q6AI12 SLC35G3-201ENST00000297307 2004 ntAPPRIS P1 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ANKRD40Q6AI12 CDK16-211ENST00000518022 2022 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.69■□□□□ 0.26
ANKRD40Q6AI12 NEDD1-213ENST00000557644 2367 ntTSL 1 (best) BASIC16.69■□□□□ 0.26
ANKRD40Q6AI12 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ANKRD40Q6AI12 ABHD16A-202ENST00000440843 1906 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ANKRD40Q6AI12 ZPBP2-202ENST00000377940 2177 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ANKRD40Q6AI12 VIPAS39-202ENST00000343765 2761 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ANKRD40Q6AI12 BIRC5-203ENST00000374948 2446 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ANKRD40Q6AI12 FYN-202ENST00000354650 3628 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ANKRD40Q6AI12 AC018665.1-201ENST00000622927 1362 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
ANKRD40Q6AI12 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ANKRD40Q6AI12 ZNF7-203ENST00000525266 1874 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ANKRD40Q6AI12 KAT5-216ENST00000534650 1875 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ANKRD40Q6AI12 MRPL2-201ENST00000230413 899 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ANKRD40Q6AI12 PIDD1-201ENST00000347755 2998 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ANKRD40Q6AI12 SPATA16-201ENST00000351008 2106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ANKRD40Q6AI12 MORN4-202ENST00000370635 419 ntTSL 1 (best) BASIC16.68■□□□□ 0.26
ANKRD40Q6AI12 PKIG-202ENST00000372886 1180 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ANKRD40Q6AI12 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ANKRD40Q6AI12 NUS1P3-201ENST00000423502 862 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
ANKRD40Q6AI12 AL121601.1-201ENST00000426367 326 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ANKRD40Q6AI12 LINC01818-201ENST00000437118 368 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ANKRD40Q6AI12 AC104596.2-201ENST00000512793 793 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
ANKRD40Q6AI12 AC092552.1-201ENST00000547243 906 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
ANKRD40Q6AI12 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ANKRD40Q6AI12 AC015712.4-202ENST00000558641 1007 ntTSL 4 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ANKRD40Q6AI12 AC138028.3-201ENST00000561699 213 ntTSL 3 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ANKRD40Q6AI12 NUBP2-208ENST00000565987 1049 ntTSL 5 BASIC16.68■□□□□ 0.26
ANKRD40Q6AI12 AC124283.3-201ENST00000570869 594 ntBASIC16.68■□□□□ 0.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.2 ms