Protein–RNA interactions for Protein: Q53S48

ALF, STON1-GTF2A1L readthrough, humanhuman

Predictions only

Length 1,182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ALFQ53S48 DUX4L47-201ENST00000566374 394 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ALFQ53S48 EGLN2-209ENST00000594140 991 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ALFQ53S48 FP565260.6-205ENST00000624120 898 ntTSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ALFQ53S48 IL32-201ENST00000008180 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ALFQ53S48 UPF3B-202ENST00000345865 2335 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ALFQ53S48 MPC2-202ENST00000367846 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ALFQ53S48 LINC00528-201ENST00000600723 2160 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ALFQ53S48 RASGEF1A-204ENST00000395810 3235 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ALFQ53S48 ANKRD44-203ENST00000409153 2724 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ALFQ53S48 CCDC140-201ENST00000295226 1699 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ALFQ53S48 MYCN-202ENST00000638417 1693 ntTSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ALFQ53S48 ARHGAP39-201ENST00000276826 4697 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ALFQ53S48 KCNS1-201ENST00000306117 4538 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ALFQ53S48 TCAF2P1-201ENST00000291129 2421 ntBASIC15.63■□□□□ 0.09
ALFQ53S48 IQCA1L-203ENST00000615129 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ALFQ53S48 KCTD1-203ENST00000417602 1705 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.63■□□□□ 0.09
ALFQ53S48 ALG12-201ENST00000330817 5350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.63■□□□□ 0.09
ALFQ53S48 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ALFQ53S48 PSMC5-209ENST00000580864 1552 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ALFQ53S48 UHMK1-202ENST00000489294 8478 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ALFQ53S48 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ALFQ53S48 LATS2-201ENST00000382592 5511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ALFQ53S48 MROH1-201ENST00000326134 5183 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ALFQ53S48 CIAPIN1-201ENST00000394391 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ALFQ53S48 BANP-201ENST00000286122 2368 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ALFQ53S48 FOS-202ENST00000535987 1402 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ALFQ53S48 PIP5K1C-202ENST00000537021 3326 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ALFQ53S48 PER2-201ENST00000254657 6385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ALFQ53S48 TRMO-203ENST00000375119 1647 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ALFQ53S48 POMT1-205ENST00000404875 2821 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ALFQ53S48 ASH2L-212ENST00000545394 2808 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ALFQ53S48 PSD4-201ENST00000245796 5188 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ALFQ53S48 NAGK-201ENST00000244204 1154 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ALFQ53S48 ATP6V1F-201ENST00000249289 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ALFQ53S48 GABARAPL2-201ENST00000037243 1002 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ALFQ53S48 C2orf15-202ENST00000409684 1058 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ALFQ53S48 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ALFQ53S48 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ALFQ53S48 LIMS3-201ENST00000437679 1220 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ALFQ53S48 AC234783.1-201ENST00000441761 496 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ALFQ53S48 AP000345.1-201ENST00000454863 569 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ALFQ53S48 AL121845.2-201ENST00000467211 252 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ALFQ53S48 IGHV3-71-201ENST00000523324 359 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ALFQ53S48 OMP-201ENST00000529803 492 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ALFQ53S48 TPD52L1-214ENST00000534199 811 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ALFQ53S48 APRT-204ENST00000563655 709 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ALFQ53S48 HIRIP3-204ENST00000564026 988 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ALFQ53S48 GADD45B-204ENST00000587345 765 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ALFQ53S48 UBE2E3-205ENST00000602475 602 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ALFQ53S48 SPATA21-206ENST00000612240 603 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ALFQ53S48 HIST1H3I-201ENST00000616365 411 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ALFQ53S48 MIR6775-201ENST00000617557 69 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ALFQ53S48 RAB34-222ENST00000625712 994 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ALFQ53S48 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ALFQ53S48 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ALFQ53S48 MAGEA8-205ENST00000542674 2084 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ALFQ53S48 SNX5-202ENST00000377768 2288 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ALFQ53S48 ICA1L-201ENST00000358299 3457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ALFQ53S48 OSBP2-209ENST00000438716 2747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ALFQ53S48 RAB3IL1-201ENST00000301773 2125 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ALFQ53S48 GJB6-202ENST00000356192 2131 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ALFQ53S48 KIF21A-202ENST00000361961 6601 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ALFQ53S48 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ALFQ53S48 AURKC-203ENST00000448930 1318 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ALFQ53S48 RNASEH2B-202ENST00000422660 4830 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ALFQ53S48 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ALFQ53S48 AL365209.1-201ENST00000624418 6473 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ALFQ53S48 SIDT1-202ENST00000393830 2572 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ALFQ53S48 DIXDC1-201ENST00000440460 5897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ALFQ53S48 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
ALFQ53S48 FBXO46-201ENST00000317683 3001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
ALFQ53S48 DCAF17-202ENST00000375255 5828 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ALFQ53S48 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
ALFQ53S48 PHF19-203ENST00000419155 3525 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ALFQ53S48 NKPD1-201ENST00000317951 4233 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ALFQ53S48 TOPAZ1-201ENST00000309765 5334 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ALFQ53S48 KCNK4-TEX40-201ENST00000539086 2733 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ALFQ53S48 TCF7-218ENST00000520958 1408 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ALFQ53S48 CHI3L2-212ENST00000524472 1435 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ALFQ53S48 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ALFQ53S48 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ALFQ53S48 IGFBP5-201ENST00000233813 6215 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ALFQ53S48 ZBED1P1-201ENST00000502364 1930 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ALFQ53S48 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ALFQ53S48 MBD1-211ENST00000585595 2179 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ALFQ53S48 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ALFQ53S48 SELPLG-201ENST00000228463 1704 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ALFQ53S48 MAP3K11-201ENST00000309100 3566 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ALFQ53S48 SLC39A1-201ENST00000310483 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ALFQ53S48 CMA1-202ENST00000250378 937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ALFQ53S48 CYTL1-201ENST00000307746 1003 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ALFQ53S48 C1QB-201ENST00000314933 1044 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ALFQ53S48 SUMF2-205ENST00000413756 1171 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ALFQ53S48 KIF9-205ENST00000432493 633 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ALFQ53S48 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ALFQ53S48 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
ALFQ53S48 CLRN2-201ENST00000511148 823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
ALFQ53S48 AC018653.3-202ENST00000538062 735 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ALFQ53S48 NOP2-220ENST00000545915 630 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
ALFQ53S48 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 164.9 ms