Protein–RNA interactions for Protein: Q53RE8

ANKRD39, Ankyrin repeat domain-containing protein 39, humanhuman

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Length 183 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ANKRD39Q53RE8 ATG3-201ENST00000283290 1570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
ANKRD39Q53RE8 CAMK2B-208ENST00000395747 1557 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
ANKRD39Q53RE8 CDRT4-204ENST00000619038 2498 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
ANKRD39Q53RE8 FAM214B-205ENST00000488109 2999 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
ANKRD39Q53RE8 BTNL8-202ENST00000340184 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
ANKRD39Q53RE8 DOCK4-206ENST00000437633 6212 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
ANKRD39Q53RE8 POTEI-203ENST00000631234 2072 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
ANKRD39Q53RE8 IRS4-201ENST00000372129 3928 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
ANKRD39Q53RE8 CA9-201ENST00000378357 1618 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
ANKRD39Q53RE8 PARN-203ENST00000437198 3078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
ANKRD39Q53RE8 ST7L-202ENST00000358039 4528 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
ANKRD39Q53RE8 IFT122-204ENST00000349441 3569 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
ANKRD39Q53RE8 ERCC1-204ENST00000423698 3119 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
ANKRD39Q53RE8 RIN3-212ENST00000620541 3617 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
ANKRD39Q53RE8 NUB1-201ENST00000413040 3180 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
ANKRD39Q53RE8 INCENP-201ENST00000278849 3698 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
ANKRD39Q53RE8 RAB28-202ENST00000330852 1715 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
ANKRD39Q53RE8 FGFR2-212ENST00000369060 3244 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
ANKRD39Q53RE8 HES2-201ENST00000377834 4262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
ANKRD39Q53RE8 HEY1-201ENST00000337919 2296 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
ANKRD39Q53RE8 ASNS-203ENST00000394309 2289 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
ANKRD39Q53RE8 LRRC34-208ENST00000522830 1781 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
ANKRD39Q53RE8 RET-205ENST00000615310 4337 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
ANKRD39Q53RE8 RABAC1-201ENST00000222008 821 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
ANKRD39Q53RE8 COX5A-201ENST00000322347 1268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
ANKRD39Q53RE8 NAPB-202ENST00000398425 3824 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
ANKRD39Q53RE8 NAA60-204ENST00000421765 1045 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
ANKRD39Q53RE8 AL390955.1-201ENST00000428694 934 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
ANKRD39Q53RE8 CR769775.1-204ENST00000439760 747 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
ANKRD39Q53RE8 MHENCR-202ENST00000449500 801 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
ANKRD39Q53RE8 AC002467.1-201ENST00000457510 657 ntTSL 3 BASIC10.99□□□□□ -0.65
ANKRD39Q53RE8 TMEM9-209ENST00000485839 938 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
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ANKRD39Q53RE8 CNTD2-203ENST00000513948 787 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
ANKRD39Q53RE8 RPPH1-201ENST00000516869 333 ntBASIC10.99□□□□□ -0.65
ANKRD39Q53RE8 TNFRSF1B-204ENST00000536782 557 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
ANKRD39Q53RE8 CD320-202ENST00000537716 1119 ntTSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
ANKRD39Q53RE8 GSTO1-207ENST00000539281 1052 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
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ANKRD39Q53RE8 AC025580.1-201ENST00000559553 729 ntTSL 5 BASIC10.99□□□□□ -0.65
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ANKRD39Q53RE8 AC009477.2-201ENST00000635976 171 ntAPPRIS P1 BASIC10.99□□□□□ -0.65
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ANKRD39Q53RE8 STRIP2-202ENST00000435494 2866 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
ANKRD39Q53RE8 GLT8D2-201ENST00000360814 1880 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
ANKRD39Q53RE8 CBX3-202ENST00000396386 1857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
ANKRD39Q53RE8 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
ANKRD39Q53RE8 CGREF1-205ENST00000404694 1376 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC10.99□□□□□ -0.65
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ANKRD39Q53RE8 LINC01019-201ENST00000505443 3199 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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ANKRD39Q53RE8 CES1-201ENST00000360526 2006 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
ANKRD39Q53RE8 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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ANKRD39Q53RE8 ARMCX2-203ENST00000356824 2674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.99□□□□□ -0.65
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ANKRD39Q53RE8 DUOXA1-205ENST00000558422 1678 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
ANKRD39Q53RE8 C2orf68-202ENST00000409734 1722 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
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ANKRD39Q53RE8 JAM3-201ENST00000299106 3912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
ANKRD39Q53RE8 RNF43-205ENST00000581868 2610 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
ANKRD39Q53RE8 MAP7-201ENST00000354570 4152 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
ANKRD39Q53RE8 MYLK-208ENST00000475616 5745 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
ANKRD39Q53RE8 SELENON-201ENST00000354177 4227 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
ANKRD39Q53RE8 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
ANKRD39Q53RE8 ATG9B-203ENST00000469530 3489 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC10.98□□□□□ -0.65
ANKRD39Q53RE8 SPOCK3-226ENST00000541354 2797 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
ANKRD39Q53RE8 TRAPPC8-201ENST00000283351 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
ANKRD39Q53RE8 TSPY14P-201ENST00000303979 915 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
ANKRD39Q53RE8 PRSS3-201ENST00000342836 1144 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
ANKRD39Q53RE8 RNU6-673P-201ENST00000365084 104 ntBASIC10.98□□□□□ -0.65
ANKRD39Q53RE8 C1QC-201ENST00000374637 1089 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
ANKRD39Q53RE8 AGTRAP-205ENST00000400895 786 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
ANKRD39Q53RE8 AL731557.1-201ENST00000425264 744 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
ANKRD39Q53RE8 AL162431.1-201ENST00000434447 543 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
ANKRD39Q53RE8 RTBDN-203ENST00000458671 1066 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
ANKRD39Q53RE8 AC092910.3-202ENST00000469070 982 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
ANKRD39Q53RE8 FNDC5-205ENST00000496770 837 ntTSL 1 (best) BASIC10.98□□□□□ -0.65
ANKRD39Q53RE8 S100A2-206ENST00000497140 697 ntTSL 2 BASIC10.98□□□□□ -0.65
ANKRD39Q53RE8 AC079848.1-202ENST00000507924 444 ntTSL 3 BASIC10.98□□□□□ -0.65
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