Protein–RNA interactions for Protein: Q4ZIN3

TMEM259, Membralin, humanhuman

Predictions only

Length 620 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TMEM259Q4ZIN3 AP001360.1-202ENST00000526934 479 ntTSL 3 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM259Q4ZIN3 AC008686.1-203ENST00000591826 463 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM259Q4ZIN3 BTNL10-201ENST00000595971 695 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM259Q4ZIN3 AC016727.1-203ENST00000603199 540 ntTSL 4 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM259Q4ZIN3 IFNL3-202ENST00000613087 734 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM259Q4ZIN3 MIR6805-201ENST00000615055 62 ntBASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM259Q4ZIN3 HNRNPDL-208ENST00000621267 4139 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM259Q4ZIN3 TNS2-201ENST00000314250 5010 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM259Q4ZIN3 AC245052.4-201ENST00000452097 4158 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM259Q4ZIN3 MED16-207ENST00000589119 2772 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM259Q4ZIN3 ODF3-201ENST00000325113 1307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM259Q4ZIN3 ZFY-201ENST00000155093 5239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM259Q4ZIN3 ISCA2-204ENST00000556816 2626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM259Q4ZIN3 RPP14-202ENST00000445193 7985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM259Q4ZIN3 ALOX12-AS1-201ENST00000399540 1730 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM259Q4ZIN3 GAS2L2-201ENST00000604063 2661 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM259Q4ZIN3 OSGIN1-201ENST00000343939 2391 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM259Q4ZIN3 CIART-203ENST00000369095 1433 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM259Q4ZIN3 HELZ2-204ENST00000467148 8064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM259Q4ZIN3 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
TMEM259Q4ZIN3 STAT1-202ENST00000392322 2716 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM259Q4ZIN3 EEPD1-205ENST00000534978 2769 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM259Q4ZIN3 LINC02447-202ENST00000501888 2146 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM259Q4ZIN3 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM259Q4ZIN3 EXOC6B-202ENST00000410104 5795 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM259Q4ZIN3 BCAR3-201ENST00000260502 3171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM259Q4ZIN3 PAK6-203ENST00000542403 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM259Q4ZIN3 MARK3-202ENST00000303622 3283 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM259Q4ZIN3 KCNJ14-201ENST00000342291 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM259Q4ZIN3 PRPF38B-202ENST00000370022 1591 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM259Q4ZIN3 CCHCR1-201ENST00000376266 2625 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM259Q4ZIN3 RSBN1-204ENST00000612242 6592 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM259Q4ZIN3 LMF2-201ENST00000216080 2658 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM259Q4ZIN3 SERPINA3-203ENST00000467132 2660 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM259Q4ZIN3 MINDY1-202ENST00000361738 1961 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM259Q4ZIN3 MAPK7-204ENST00000395604 3077 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM259Q4ZIN3 CECR7-202ENST00000441006 2726 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM259Q4ZIN3 APOA1-201ENST00000236850 1227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM259Q4ZIN3 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM259Q4ZIN3 S100A16-201ENST00000368703 946 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM259Q4ZIN3 APOA1-205ENST00000375329 927 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM259Q4ZIN3 EIF1AX-201ENST00000379593 765 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM259Q4ZIN3 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM259Q4ZIN3 GULP1-204ENST00000409637 1242 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM259Q4ZIN3 MIR1909-201ENST00000411312 80 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM259Q4ZIN3 ECSIT-203ENST00000417981 970 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM259Q4ZIN3 HIST1H2BPS3-201ENST00000419683 341 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM259Q4ZIN3 TREX1-201ENST00000433541 1105 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM259Q4ZIN3 AC007274.1-201ENST00000439805 662 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM259Q4ZIN3 AC116337.3-201ENST00000505200 846 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM259Q4ZIN3 LINC01089-209ENST00000542933 1220 ntTSL 3 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM259Q4ZIN3 BX927359.1-201ENST00000556073 543 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM259Q4ZIN3 AC007611.1-201ENST00000568150 826 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM259Q4ZIN3 AC243829.4-204ENST00000616926 1115 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM259Q4ZIN3 AC092723.2-201ENST00000624955 793 ntBASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM259Q4ZIN3 CRHR2-208ENST00000506074 3109 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM259Q4ZIN3 SEMA4C-201ENST00000305476 3545 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM259Q4ZIN3 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM259Q4ZIN3 NUP98-203ENST00000359171 7023 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM259Q4ZIN3 RAB29-201ENST00000235932 1723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM259Q4ZIN3 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM259Q4ZIN3 HOXB4-201ENST00000332503 3757 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM259Q4ZIN3 ZNF365-205ENST00000395254 4173 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM259Q4ZIN3 PHTF1-202ENST00000369598 3000 ntTSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM259Q4ZIN3 ZBTB14-202ENST00000400143 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM259Q4ZIN3 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM259Q4ZIN3 CALCB-202ENST00000523376 2258 ntTSL 2 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM259Q4ZIN3 AC004706.4-201ENST00000634965 3537 ntAPPRIS P1 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM259Q4ZIN3 KANK2-207ENST00000589894 2703 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM259Q4ZIN3 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM259Q4ZIN3 DOK5-202ENST00000395939 1453 ntTSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM259Q4ZIN3 ZFAND6-207ENST00000558494 1472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM259Q4ZIN3 SLC35F2-204ENST00000525815 3170 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.59■□□□□ 0.09
TMEM259Q4ZIN3 AKNA-206ENST00000374088 5464 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
TMEM259Q4ZIN3 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.09
TMEM259Q4ZIN3 FAM186B-201ENST00000257894 2944 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TMEM259Q4ZIN3 SAPCD2-201ENST00000409687 3848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TMEM259Q4ZIN3 COLEC11-209ENST00000418971 1595 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.09
TMEM259Q4ZIN3 TRIM13-201ENST00000356017 1637 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.09
TMEM259Q4ZIN3 PCCB-218ENST00000490504 1613 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.09
TMEM259Q4ZIN3 IGDCC3-201ENST00000327987 4479 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM259Q4ZIN3 CTSD-201ENST00000236671 2123 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM259Q4ZIN3 AC139749.1-202ENST00000617529 3139 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM259Q4ZIN3 RRP1B-201ENST00000340648 5090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM259Q4ZIN3 RUFY2-204ENST00000399200 2685 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM259Q4ZIN3 RHOXF1P3-203ENST00000640298 2668 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM259Q4ZIN3 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM259Q4ZIN3 MUTYH-209ENST00000448481 1706 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM259Q4ZIN3 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM259Q4ZIN3 C1QBPP1-201ENST00000400117 770 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM259Q4ZIN3 C1orf210-201ENST00000423420 629 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM259Q4ZIN3 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM259Q4ZIN3 AC022210.1-201ENST00000449856 793 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM259Q4ZIN3 AC097717.1-202ENST00000457577 740 ntTSL 3 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM259Q4ZIN3 AC026410.3-201ENST00000514280 936 ntBASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM259Q4ZIN3 CCKBR-202ENST00000525014 792 ntTSL 4 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM259Q4ZIN3 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM259Q4ZIN3 ZNF7-206ENST00000528130 1134 ntTSL 5 BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM259Q4ZIN3 LINC01220-201ENST00000558575 715 ntTSL 1 (best) BASIC15.58■□□□□ 0.08
TMEM259Q4ZIN3 SLC38A7-207ENST00000564391 731 ntTSL 2 BASIC15.58■□□□□ 0.08
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 32.1 ms