Protein–RNA interactions for Protein: Q2M238

RRN3P1, Putative RRN3-like protein RRN3P1, humanhuman

Predictions only

Length 152 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
RRN3P1Q2M238 MGLL-201ENST00000265052 4642 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
RRN3P1Q2M238 NDRG2-209ENST00000397853 2079 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
RRN3P1Q2M238 ZNF536-201ENST00000355537 4945 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
RRN3P1Q2M238 SPATA7-203ENST00000393545 2123 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
RRN3P1Q2M238 C22orf34-204ENST00000414287 2197 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
RRN3P1Q2M238 ARIH2-205ENST00000449376 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
RRN3P1Q2M238 EID1-201ENST00000530028 2298 ntAPPRIS P1 BASIC11.48□□□□□ -0.57
RRN3P1Q2M238 CYP4F3-203ENST00000586182 2338 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
RRN3P1Q2M238 THAP10-201ENST00000249861 2399 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
RRN3P1Q2M238 ZDHHC15-201ENST00000373367 5796 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
RRN3P1Q2M238 TEAD3-202ENST00000402886 2729 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
RRN3P1Q2M238 PIGG-202ENST00000383028 2787 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
RRN3P1Q2M238 CEP76-201ENST00000262127 2939 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
RRN3P1Q2M238 GOLGA2-212ENST00000609374 2973 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
RRN3P1Q2M238 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
RRN3P1Q2M238 DSE-201ENST00000331677 7237 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
RRN3P1Q2M238 MTRF1L-201ENST00000367230 3431 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
RRN3P1Q2M238 MRPL55-201ENST00000295008 632 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
RRN3P1Q2M238 LINC00313-201ENST00000332440 579 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
RRN3P1Q2M238 POP5-202ENST00000357500 801 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
RRN3P1Q2M238 POLR3GL-202ENST00000369314 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
RRN3P1Q2M238 PSMB9-207ENST00000374859 782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
RRN3P1Q2M238 PSMB9-208ENST00000395330 792 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
RRN3P1Q2M238 RAC2-202ENST00000401529 569 ntTSL 4 BASIC11.48□□□□□ -0.57
RRN3P1Q2M238 AC092580.3-201ENST00000430932 139 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
RRN3P1Q2M238 AC008278.1-201ENST00000431117 568 ntTSL 4 BASIC11.48□□□□□ -0.57
RRN3P1Q2M238 LEKR1-211ENST00000498839 616 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
RRN3P1Q2M238 AC114956.2-201ENST00000512498 572 ntTSL 4 BASIC11.48□□□□□ -0.57
RRN3P1Q2M238 SDHAP3-202ENST00000515467 728 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
RRN3P1Q2M238 LINC01605-204ENST00000522718 1093 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
RRN3P1Q2M238 NRK-203ENST00000536164 908 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
RRN3P1Q2M238 RAB26-202ENST00000541451 944 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
RRN3P1Q2M238 PSMD7-204ENST00000567958 692 ntTSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
RRN3P1Q2M238 AC141424.1-203ENST00000599026 887 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
RRN3P1Q2M238 MRNIP-225ENST00000610475 810 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
RRN3P1Q2M238 FAM92A-219ENST00000620645 1014 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
RRN3P1Q2M238 AL590560.3-201ENST00000623350 461 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
RRN3P1Q2M238 ABHD11-201ENST00000222800 1483 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
RRN3P1Q2M238 PTGES3-202ENST00000414274 1547 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
RRN3P1Q2M238 DYNC1LI2-203ENST00000443351 1502 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
RRN3P1Q2M238 PGAP2-205ENST00000396993 1566 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
RRN3P1Q2M238 RNF32-202ENST00000317955 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
RRN3P1Q2M238 SNAP47-AS1-201ENST00000413347 1708 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
RRN3P1Q2M238 TRIM46-209ENST00000543729 1703 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
RRN3P1Q2M238 TRPM2-204ENST00000397932 5216 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
RRN3P1Q2M238 IL18BP-204ENST00000393703 1788 ntAPPRIS P2 TSL 3 BASIC11.48□□□□□ -0.57
RRN3P1Q2M238 NFIC-202ENST00000395111 1755 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
RRN3P1Q2M238 UEVLD-203ENST00000379387 1848 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
RRN3P1Q2M238 POM121-205ENST00000627934 5480 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
RRN3P1Q2M238 CNGA4-201ENST00000379936 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
RRN3P1Q2M238 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
RRN3P1Q2M238 MYRF-203ENST00000389602 2052 ntTSL 2 BASIC11.48□□□□□ -0.57
RRN3P1Q2M238 BRSK2-204ENST00000526678 2091 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
RRN3P1Q2M238 ASAH1-249ENST00000637528 2215 ntTSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
RRN3P1Q2M238 CD83-201ENST00000379153 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
RRN3P1Q2M238 AC018892.3-201ENST00000623986 2499 ntBASIC11.48□□□□□ -0.57
RRN3P1Q2M238 GLIDR-202ENST00000625350 2588 ntTSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
RRN3P1Q2M238 KRT82-201ENST00000257974 2664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
RRN3P1Q2M238 HOXA3-201ENST00000317201 2761 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC11.48□□□□□ -0.57
RRN3P1Q2M238 DBF4-201ENST00000265728 3907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
RRN3P1Q2M238 RASA3-201ENST00000334062 4191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
RRN3P1Q2M238 LIMS1-215ENST00000544547 4461 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC11.48□□□□□ -0.57
RRN3P1Q2M238 UNC13B-206ENST00000617908 6432 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
RRN3P1Q2M238 UNC13B-207ENST00000619578 6426 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
RRN3P1Q2M238 KIAA1211L-201ENST00000397899 3907 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
RRN3P1Q2M238 BAG1-210ENST00000634734 3786 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
RRN3P1Q2M238 CLCN7-201ENST00000262318 3717 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
RRN3P1Q2M238 TRAF7-201ENST00000326181 3700 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
RRN3P1Q2M238 HSDL2-202ENST00000398805 3350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
RRN3P1Q2M238 ANKMY1-204ENST00000391987 3221 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
RRN3P1Q2M238 RBPMS-201ENST00000287771 2974 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
RRN3P1Q2M238 SCAP-215ENST00000545718 2950 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
RRN3P1Q2M238 AC100803.3-201ENST00000606664 2961 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
RRN3P1Q2M238 BRCC3-201ENST00000330045 2496 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
RRN3P1Q2M238 PIK3IP1-203ENST00000441972 2374 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
RRN3P1Q2M238 FLII-221ENST00000578558 2377 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
RRN3P1Q2M238 ZNF586-201ENST00000391702 2265 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
RRN3P1Q2M238 CYB5D2-201ENST00000301391 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
RRN3P1Q2M238 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
RRN3P1Q2M238 PHLDB1-201ENST00000356063 5240 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
RRN3P1Q2M238 PITX2-204ENST00000394595 1693 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
RRN3P1Q2M238 TRPM2-208ENST00000621064 1669 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
RRN3P1Q2M238 GRN-214ENST00000589265 1632 ntTSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
RRN3P1Q2M238 PPRC1-203ENST00000413464 4580 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
RRN3P1Q2M238 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
RRN3P1Q2M238 ZFPL1-201ENST00000294258 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
RRN3P1Q2M238 GMNN-201ENST00000230056 1262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
RRN3P1Q2M238 EVA1A-203ENST00000410010 696 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC11.47□□□□□ -0.57
RRN3P1Q2M238 PCAT6-201ENST00000417262 748 ntTSL 2 BASIC11.47□□□□□ -0.57
RRN3P1Q2M238 HNRNPA1P40-201ENST00000426371 1278 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
RRN3P1Q2M238 XXYLT1-204ENST00000429994 865 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
RRN3P1Q2M238 ZMYND10-AS1-201ENST00000440013 250 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
RRN3P1Q2M238 RPL10P19-202ENST00000520582 722 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
RRN3P1Q2M238 MTFR1L-218ENST00000526894 733 ntTSL 4 BASIC11.47□□□□□ -0.57
RRN3P1Q2M238 AL139349.1-201ENST00000530479 577 ntTSL 4 BASIC11.47□□□□□ -0.57
RRN3P1Q2M238 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
RRN3P1Q2M238 RNF24-204ENST00000545616 1128 ntTSL 1 (best) BASIC11.47□□□□□ -0.57
RRN3P1Q2M238 DUT-210ENST00000559935 569 ntTSL 3 BASIC11.47□□□□□ -0.57
RRN3P1Q2M238 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC11.47□□□□□ -0.57
RRN3P1Q2M238 AC027796.2-201ENST00000575326 344 ntBASIC11.47□□□□□ -0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 33.2 ms