Protein–RNA interactions for Protein: Q1MSJ5

CSPP1, Centrosome and spindle pole-associated protein 1, humanhuman

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Length 1,256 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CSPP1Q1MSJ5 SLC4A7-212ENST00000446700 4000 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CSPP1Q1MSJ5 C1orf159-202ENST00000379320 2324 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CSPP1Q1MSJ5 INSIG1-201ENST00000340368 3010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CSPP1Q1MSJ5 ELF2-202ENST00000379549 3005 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CSPP1Q1MSJ5 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CSPP1Q1MSJ5 SRGAP2C-201ENST00000304465 1477 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CSPP1Q1MSJ5 TAGLN3-202ENST00000393917 1488 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CSPP1Q1MSJ5 SRGAP2-201ENST00000419187 1477 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CSPP1Q1MSJ5 SRGAP2B-205ENST00000619678 1477 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CSPP1Q1MSJ5 IL17RA-204ENST00000612619 8506 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CSPP1Q1MSJ5 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CSPP1Q1MSJ5 SRRD-201ENST00000215917 4020 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CSPP1Q1MSJ5 SLC22A16-202ENST00000368919 1987 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CSPP1Q1MSJ5 LINC00691-201ENST00000432505 2232 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CSPP1Q1MSJ5 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CSPP1Q1MSJ5 EIF4E-201ENST00000280892 1097 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CSPP1Q1MSJ5 C11orf71-201ENST00000325636 652 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CSPP1Q1MSJ5 TAS2R41-201ENST00000408916 924 ntAPPRIS P1 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CSPP1Q1MSJ5 AC016876.1-201ENST00000415124 352 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CSPP1Q1MSJ5 GOLGA6L11P-201ENST00000417252 1298 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CSPP1Q1MSJ5 TTC28-AS1-213ENST00000434221 972 ntTSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CSPP1Q1MSJ5 CRB3P1-201ENST00000449338 276 ntBASIC18.01■□□□□ 0.47
CSPP1Q1MSJ5 FXR1-221ENST00000491674 365 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CSPP1Q1MSJ5 MIR210HG-203ENST00000533920 816 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CSPP1Q1MSJ5 TMSB15B-204ENST00000540220 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CSPP1Q1MSJ5 MAX-210ENST00000555419 765 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CSPP1Q1MSJ5 TMSB15B-205ENST00000563257 590 ntTSL 4 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CSPP1Q1MSJ5 TNNT1-211ENST00000588426 683 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CSPP1Q1MSJ5 MZF1-202ENST00000594108 1110 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CSPP1Q1MSJ5 SF3B4-201ENST00000271628 2085 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CSPP1Q1MSJ5 RGS9-202ENST00000443584 2078 ntTSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CSPP1Q1MSJ5 TMPRSS6-202ENST00000381792 3260 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CSPP1Q1MSJ5 SLC39A1-204ENST00000368623 2723 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CSPP1Q1MSJ5 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CSPP1Q1MSJ5 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CSPP1Q1MSJ5 BCL10-201ENST00000370580 2819 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CSPP1Q1MSJ5 SEC24D-202ENST00000419654 2786 ntTSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CSPP1Q1MSJ5 FER1L4-213ENST00000621044 2778 ntTSL 2 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CSPP1Q1MSJ5 CD1E-212ENST00000368167 1458 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CSPP1Q1MSJ5 UBR2-201ENST00000372899 7857 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.01■□□□□ 0.47
CSPP1Q1MSJ5 UBR2-202ENST00000372901 7857 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CSPP1Q1MSJ5 ZFAND6-222ENST00000613266 1729 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.01■□□□□ 0.47
CSPP1Q1MSJ5 GRB2-203ENST00000392562 3729 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CSPP1Q1MSJ5 PRMT2-202ENST00000334494 1334 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CSPP1Q1MSJ5 DDX49-201ENST00000247003 1830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CSPP1Q1MSJ5 AC006504.5-208ENST00000588784 2401 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CSPP1Q1MSJ5 TIA1-206ENST00000445587 1440 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CSPP1Q1MSJ5 SRSF8-201ENST00000587424 4028 ntAPPRIS P1 BASIC18■□□□□ 0.47
CSPP1Q1MSJ5 JADE2-203ENST00000395003 6465 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CSPP1Q1MSJ5 AXL-201ENST00000301178 4737 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CSPP1Q1MSJ5 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CSPP1Q1MSJ5 SNHG18-201ENST00000508179 1799 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CSPP1Q1MSJ5 KIAA0930-203ENST00000391627 2623 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CSPP1Q1MSJ5 ERLIN2-205ENST00000518586 2623 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CSPP1Q1MSJ5 FAM84B-201ENST00000304916 5404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CSPP1Q1MSJ5 SLC6A20-202ENST00000358525 5423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CSPP1Q1MSJ5 ZNF790-207ENST00000614179 2361 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18■□□□□ 0.47
CSPP1Q1MSJ5 TP73-205ENST00000378285 2117 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CSPP1Q1MSJ5 PSMA8-203ENST00000415576 1280 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CSPP1Q1MSJ5 FLG-AS1-204ENST00000420707 906 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CSPP1Q1MSJ5 UGT1A2P-201ENST00000454886 866 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CSPP1Q1MSJ5 NAA50-208ENST00000497255 789 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CSPP1Q1MSJ5 SPIB-207ENST00000597855 564 ntTSL 4 BASIC18■□□□□ 0.47
CSPP1Q1MSJ5 AL606495.2-201ENST00000605867 535 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CSPP1Q1MSJ5 HEATR3-201ENST00000299192 3560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CSPP1Q1MSJ5 HSD17B4-206ENST00000504811 2740 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CSPP1Q1MSJ5 SOAT1-203ENST00000539888 6794 ntTSL 2 BASIC18■□□□□ 0.47
CSPP1Q1MSJ5 FKBP5-201ENST00000357266 3772 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CSPP1Q1MSJ5 TNFSF13-201ENST00000338784 1971 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CSPP1Q1MSJ5 ACE3P-201ENST00000423435 1973 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CSPP1Q1MSJ5 PCDHGB8P-201ENST00000502926 1973 ntBASIC18■□□□□ 0.47
CSPP1Q1MSJ5 PITPNB-202ENST00000335272 2926 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CSPP1Q1MSJ5 UBE2D4-201ENST00000222402 3974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CSPP1Q1MSJ5 ZNF324-201ENST00000196482 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CSPP1Q1MSJ5 MBD1-209ENST00000398495 2178 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CSPP1Q1MSJ5 KIF1BP-214ENST00000638119 2537 ntTSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CSPP1Q1MSJ5 GTF2IRD1-205ENST00000476977 5868 ntTSL 1 (best) BASIC18■□□□□ 0.47
CSPP1Q1MSJ5 SETD1B-203ENST00000604567 5969 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18■□□□□ 0.47
CSPP1Q1MSJ5 CYB5R1-201ENST00000367249 1651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CSPP1Q1MSJ5 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CSPP1Q1MSJ5 GPD2-208ENST00000438166 2457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CSPP1Q1MSJ5 AC092384.2-204ENST00000565053 2566 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CSPP1Q1MSJ5 C1R-201ENST00000535233 2211 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CSPP1Q1MSJ5 MATN3-202ENST00000421259 1443 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CSPP1Q1MSJ5 AC140479.7-201ENST00000636301 2332 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CSPP1Q1MSJ5 KHNYN-201ENST00000251343 6725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CSPP1Q1MSJ5 FBLIM1-201ENST00000332305 1530 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CSPP1Q1MSJ5 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CSPP1Q1MSJ5 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CSPP1Q1MSJ5 CENPT-235ENST00000626059 1737 ntTSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CSPP1Q1MSJ5 KIF26B-202ENST00000407071 7287 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CSPP1Q1MSJ5 AC104452.1-203ENST00000636166 2266 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CSPP1Q1MSJ5 NME3-201ENST00000219302 1069 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CSPP1Q1MSJ5 CCNL1-201ENST00000295925 549 ntTSL 1 (best) BASIC17.99■□□□□ 0.47
CSPP1Q1MSJ5 OR52W1-201ENST00000311352 1114 ntAPPRIS P1 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CSPP1Q1MSJ5 AC097493.3-201ENST00000509725 367 ntBASIC17.99■□□□□ 0.47
CSPP1Q1MSJ5 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CSPP1Q1MSJ5 AC008750.1-201ENST00000532473 492 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CSPP1Q1MSJ5 SUOX-214ENST00000551841 906 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
CSPP1Q1MSJ5 AL356805.1-201ENST00000556383 341 ntTSL 3 BASIC17.99■□□□□ 0.47
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