Protein–RNA interactions for Protein: Q17RW2

COL24A1, Collagen alpha-1(XXIV) chain, humanhuman

Predictions only

Length 1,714 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
COL24A1Q17RW2 AC004528.1-201ENST00000588380 641 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
COL24A1Q17RW2 AP000322.3-201ENST00000608665 388 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
COL24A1Q17RW2 AC090510.3-201ENST00000615831 821 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
COL24A1Q17RW2 TAC3-211ENST00000615887 1120 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.51■□□□□ 0.55
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COL24A1Q17RW2 FOLH1-202ENST00000340334 2697 ntTSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
COL24A1Q17RW2 ABCB8-212ENST00000477719 1625 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
COL24A1Q17RW2 CCNC-209ENST00000520371 2186 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
COL24A1Q17RW2 MIB2-201ENST00000355826 3290 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.51■□□□□ 0.55
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COL24A1Q17RW2 KRT8P28-201ENST00000433288 1390 ntBASIC18.51■□□□□ 0.55
COL24A1Q17RW2 METTL7B-202ENST00000614691 1368 ntTSL 5 BASIC18.51■□□□□ 0.55
COL24A1Q17RW2 SLC25A22-201ENST00000320230 2796 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
COL24A1Q17RW2 AC025183.3-201ENST00000623526 1482 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
COL24A1Q17RW2 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
COL24A1Q17RW2 ADAM15-228ENST00000531455 2678 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
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COL24A1Q17RW2 RHOH-218ENST00000613272 1865 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
COL24A1Q17RW2 AC020658.6-201ENST00000623564 1870 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
COL24A1Q17RW2 TGOLN2-205ENST00000409232 2235 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
COL24A1Q17RW2 OR2V1-201ENST00000329365 948 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
COL24A1Q17RW2 KRTAP19-5-201ENST00000334151 461 ntAPPRIS P1 BASIC18.5■□□□□ 0.55
COL24A1Q17RW2 PPIA-201ENST00000355968 818 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
COL24A1Q17RW2 APOA1-203ENST00000375320 940 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
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COL24A1Q17RW2 AC013448.2-201ENST00000440341 787 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
COL24A1Q17RW2 FAHD2CP-203ENST00000467292 965 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
COL24A1Q17RW2 PPIA-208ENST00000489459 907 ntTSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
COL24A1Q17RW2 AC022858.1-202ENST00000521084 393 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
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COL24A1Q17RW2 RAP1B-216ENST00000537460 1072 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
COL24A1Q17RW2 AL132801.1-201ENST00000559675 567 ntTSL 4 BASIC18.5■□□□□ 0.55
COL24A1Q17RW2 TXNDC17-208ENST00000574838 746 ntTSL 3 BASIC18.5■□□□□ 0.55
COL24A1Q17RW2 AC006548.2-201ENST00000605217 529 ntBASIC18.5■□□□□ 0.55
COL24A1Q17RW2 PPIA-210ENST00000620047 827 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
COL24A1Q17RW2 AC027559.1-203ENST00000635726 517 ntTSL 5 BASIC18.5■□□□□ 0.55
COL24A1Q17RW2 IQCF3-205ENST00000456080 1685 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.5■□□□□ 0.55
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COL24A1Q17RW2 EIF4ENIF1-202ENST00000344710 3115 ntTSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
COL24A1Q17RW2 ACAP3-202ENST00000354700 3896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.5■□□□□ 0.55
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COL24A1Q17RW2 CSPG5-202ENST00000383738 4161 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
COL24A1Q17RW2 HIST1H2BJ-201ENST00000339812 381 ntAPPRIS P1 BASIC18.49■□□□□ 0.55
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COL24A1Q17RW2 LMF2-202ENST00000474879 2582 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
COL24A1Q17RW2 LINC00665-206ENST00000590622 1749 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
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COL24A1Q17RW2 BEGAIN-201ENST00000355173 2674 ntTSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
COL24A1Q17RW2 ITPK1-210ENST00000556603 3174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
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COL24A1Q17RW2 BCAS2-201ENST00000369541 1299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
COL24A1Q17RW2 AC093484.1-201ENST00000441875 477 ntTSL 5 BASIC18.49■□□□□ 0.55
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COL24A1Q17RW2 RN7SL665P-201ENST00000578793 300 ntBASIC18.49■□□□□ 0.55
COL24A1Q17RW2 ATRAID-207ENST00000606999 956 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
COL24A1Q17RW2 CD19-201ENST00000324662 1932 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.49■□□□□ 0.55
COL24A1Q17RW2 RUBCNL-212ENST00000631139 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
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COL24A1Q17RW2 STAG1-206ENST00000480733 1304 ntTSL 2 BASIC18.49■□□□□ 0.55
COL24A1Q17RW2 CERS3-202ENST00000394113 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
COL24A1Q17RW2 MAGEA2-209ENST00000623806 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.48■□□□□ 0.55
COL24A1Q17RW2 TCF25-201ENST00000263346 2233 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
COL24A1Q17RW2 SLC29A1-205ENST00000371740 2219 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
COL24A1Q17RW2 LTB4R2-202ENST00000528054 3092 ntBASIC18.48■□□□□ 0.55
COL24A1Q17RW2 THUMPD3-210ENST00000515662 2390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
COL24A1Q17RW2 RBPJL-201ENST00000343694 2489 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
COL24A1Q17RW2 BABAM2-204ENST00000379624 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
COL24A1Q17RW2 BNIP2-213ENST00000612191 2515 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
COL24A1Q17RW2 GINS3-203ENST00000426538 1728 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
COL24A1Q17RW2 RASGEF1B-202ENST00000335927 1756 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
COL24A1Q17RW2 CD34-202ENST00000356522 2874 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
COL24A1Q17RW2 SCUBE2-202ENST00000450649 2912 ntTSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
COL24A1Q17RW2 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
COL24A1Q17RW2 ASCL1-201ENST00000266744 2472 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.48■□□□□ 0.55
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