Protein–RNA interactions for Protein: Q16695

HIST3H3, Histone H3.1t, humanhuman

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Length 136 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIST3H3Q16695 APBB1-219ENST00000608704 2095 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
HIST3H3Q16695 ZMYND15-201ENST00000269289 2448 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
HIST3H3Q16695 ENAH-203ENST00000366843 2758 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
HIST3H3Q16695 ZBTB17-201ENST00000375733 2770 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
HIST3H3Q16695 FABP1-202ENST00000393750 1839 ntTSL 2 BASIC13.41□□□□□ -0.26
HIST3H3Q16695 CYB561A3-203ENST00000447532 1803 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
HIST3H3Q16695 AL391244.1-206ENST00000447725 1843 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
HIST3H3Q16695 FASTKD5-201ENST00000380266 2874 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
HIST3H3Q16695 ERG28-201ENST00000256319 2633 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
HIST3H3Q16695 PKN2-201ENST00000316005 2632 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
HIST3H3Q16695 SCAF11-204ENST00000395454 1931 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
HIST3H3Q16695 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC13.41□□□□□ -0.26
HIST3H3Q16695 STOML1-204ENST00000541638 6336 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
HIST3H3Q16695 PCDHB8-201ENST00000239444 2740 ntAPPRIS P1 BASIC13.41□□□□□ -0.26
HIST3H3Q16695 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.41□□□□□ -0.26
HIST3H3Q16695 TMPRSS4-214ENST00000523251 1689 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
HIST3H3Q16695 DPYSL3-201ENST00000343218 5476 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
HIST3H3Q16695 PHLDA1-203ENST00000619060 5913 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
HIST3H3Q16695 TERF1-201ENST00000276602 3268 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
HIST3H3Q16695 SCLY-202ENST00000409736 1774 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
HIST3H3Q16695 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
HIST3H3Q16695 C6orf120-201ENST00000332290 2667 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
HIST3H3Q16695 ASIC4-201ENST00000347842 2684 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
HIST3H3Q16695 COL25A1-201ENST00000399126 2674 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
HIST3H3Q16695 CHDH-201ENST00000315251 7665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
HIST3H3Q16695 PCED1B-201ENST00000432328 1862 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
HIST3H3Q16695 UBR5-212ENST00000521922 9008 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
HIST3H3Q16695 AC067930.6-201ENST00000623257 4947 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
HIST3H3Q16695 SAP130-201ENST00000259234 4140 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
HIST3H3Q16695 MAGED2-201ENST00000218439 1958 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
HIST3H3Q16695 USP35-204ENST00000530267 2419 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
HIST3H3Q16695 MFSD13A-201ENST00000238936 2852 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
HIST3H3Q16695 FNDC1-201ENST00000297267 6552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
HIST3H3Q16695 CFLAR-204ENST00000341582 2056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
HIST3H3Q16695 AC018529.2-202ENST00000611482 3087 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
HIST3H3Q16695 F8-201ENST00000330287 2620 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
HIST3H3Q16695 FBXO15-201ENST00000419743 1708 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
HIST3H3Q16695 IQCE-203ENST00000402050 6844 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
HIST3H3Q16695 PHLDA2-201ENST00000314222 955 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
HIST3H3Q16695 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
HIST3H3Q16695 LCE3A-201ENST00000335674 270 ntAPPRIS P1 BASIC13.4□□□□□ -0.26
HIST3H3Q16695 LDLRAD1-201ENST00000371360 785 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
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HIST3H3Q16695 DGCR6-202ENST00000413981 1039 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
HIST3H3Q16695 AC073283.1-201ENST00000421759 860 ntTSL 3 BASIC13.4□□□□□ -0.26
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HIST3H3Q16695 CR589904.1-201ENST00000437830 732 ntTSL 5 BASIC13.4□□□□□ -0.26
HIST3H3Q16695 AC093433.1-201ENST00000458048 571 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
HIST3H3Q16695 FAM104B-207ENST00000489298 712 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
HIST3H3Q16695 ST8SIA2-202ENST00000539113 1089 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
HIST3H3Q16695 AC009486.1-201ENST00000569860 813 ntBASIC13.4□□□□□ -0.26
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HIST3H3Q16695 AC004477.1-202ENST00000584428 539 ntTSL 2 BASIC13.4□□□□□ -0.26
HIST3H3Q16695 PTPRS-208ENST00000590509 893 ntTSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
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HIST3H3Q16695 MYADML2-201ENST00000409745 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
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HIST3H3Q16695 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
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HIST3H3Q16695 IDH2-201ENST00000330062 2694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
HIST3H3Q16695 SHROOM4-201ENST00000289292 6261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
HIST3H3Q16695 BCAT2-201ENST00000316273 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
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HIST3H3Q16695 RTN4IP1-201ENST00000369063 1682 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.4□□□□□ -0.26
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HIST3H3Q16695 FOXJ2-201ENST00000162391 5523 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
HIST3H3Q16695 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
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HIST3H3Q16695 SLC25A36-203ENST00000446041 4638 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
HIST3H3Q16695 HLF-201ENST00000226067 5547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
HIST3H3Q16695 RPH3AL-201ENST00000323434 2809 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
HIST3H3Q16695 PPP2R5D-208ENST00000485511 3044 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
HIST3H3Q16695 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
HIST3H3Q16695 SCN3B-201ENST00000299333 5665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
HIST3H3Q16695 SFT2D1-201ENST00000361731 1079 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
HIST3H3Q16695 PNRC1-203ENST00000369472 816 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
HIST3H3Q16695 TEX26-AS1-201ENST00000411835 1203 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
HIST3H3Q16695 STMN1-204ENST00000426559 948 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
HIST3H3Q16695 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
HIST3H3Q16695 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC13.39□□□□□ -0.27
HIST3H3Q16695 LINC02298-201ENST00000546968 965 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
HIST3H3Q16695 LINC00928-204ENST00000561201 1123 ntTSL 1 (best) BASIC13.39□□□□□ -0.27
HIST3H3Q16695 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
HIST3H3Q16695 MRPS23-202ENST00000578444 580 ntTSL 2 BASIC13.39□□□□□ -0.27
HIST3H3Q16695 AC138761.1-201ENST00000584393 385 ntBASIC13.39□□□□□ -0.27
HIST3H3Q16695 ZNF180-204ENST00000586637 1023 ntTSL 5 BASIC13.39□□□□□ -0.27
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