Protein–RNA interactions for Protein: Q16665

HIF1A, Hypoxia-inducible factor 1-alpha, humanhuman

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Length 826 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HIF1AQ16665 NYAP1-201ENST00000300179 3581 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HIF1AQ16665 PSMG3-201ENST00000252329 1007 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HIF1AQ16665 PSMB6-201ENST00000270586 852 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HIF1AQ16665 CLEC1B-201ENST00000298527 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HIF1AQ16665 WLS-203ENST00000370971 700 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HIF1AQ16665 PLAC9P1-202ENST00000433290 400 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HIF1AQ16665 AL669970.3-201ENST00000435284 428 ntTSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HIF1AQ16665 COMT-209ENST00000449653 1035 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HIF1AQ16665 METTL6-204ENST00000450816 1221 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HIF1AQ16665 TPT1-AS1-219ENST00000523506 574 ntTSL 4 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HIF1AQ16665 LINC01481-203ENST00000549651 883 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HIF1AQ16665 RPL28-205ENST00000558131 444 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HIF1AQ16665 MOB3A-209ENST00000592280 1071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HIF1AQ16665 PSMB6-205ENST00000614486 871 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HIF1AQ16665 GPR39-203ENST00000622084 900 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HIF1AQ16665 CKMT1A-208ENST00000626814 1073 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HIF1AQ16665 RHNO1-202ENST00000461997 1655 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HIF1AQ16665 FAM230B-201ENST00000415376 1859 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HIF1AQ16665 AC008079.1-201ENST00000434390 1859 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HIF1AQ16665 PLEKHA4-201ENST00000263265 3088 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HIF1AQ16665 KLHDC7A-201ENST00000400664 5145 ntAPPRIS P1 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HIF1AQ16665 TNN-203ENST00000622870 3719 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HIF1AQ16665 CLPTM1-202ENST00000541297 2732 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HIF1AQ16665 LDLRAD4-205ENST00000585931 2118 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HIF1AQ16665 BRAP-201ENST00000327551 1947 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HIF1AQ16665 TRIP10-208ENST00000596758 1920 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HIF1AQ16665 SEPT8-212ENST00000458488 1726 ntTSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HIF1AQ16665 POLR2E-211ENST00000612655 1749 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HIF1AQ16665 CENPO-202ENST00000380834 4386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HIF1AQ16665 RNASE1-202ENST00000397967 1348 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HIF1AQ16665 C17orf107-201ENST00000381365 3199 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HIF1AQ16665 PAX6-202ENST00000379107 2579 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HIF1AQ16665 CCT3-201ENST00000295688 2150 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HIF1AQ16665 TMEM5-205ENST00000537373 1966 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HIF1AQ16665 ZMYND15-204ENST00000573751 2409 ntTSL 2 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HIF1AQ16665 CASC2-203ENST00000435944 3270 ntTSL 1 (best) BASIC15.62■□□□□ 0.09
HIF1AQ16665 LILRP1-201ENST00000444199 1370 ntBASIC15.62■□□□□ 0.09
HIF1AQ16665 AQP6-204ENST00000615425 2245 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.62■□□□□ 0.09
HIF1AQ16665 JPH1-201ENST00000342232 4378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HIF1AQ16665 TGFB1I1-202ENST00000394858 1803 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HIF1AQ16665 PFKFB4-201ENST00000232375 3586 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HIF1AQ16665 NKIRAS1-203ENST00000415901 1644 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HIF1AQ16665 OS9-204ENST00000389146 2091 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HIF1AQ16665 AP001267.2-201ENST00000532619 2086 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
HIF1AQ16665 SLC39A9-209ENST00000556605 2065 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HIF1AQ16665 SP6-201ENST00000342234 3800 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HIF1AQ16665 HNRNPUL1-201ENST00000263367 2952 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HIF1AQ16665 NAP1L1-202ENST00000393263 1896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HIF1AQ16665 ZBED1-202ENST00000381222 4507 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HIF1AQ16665 TMCC2-202ENST00000330675 2780 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HIF1AQ16665 ACOT9-201ENST00000336430 1675 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HIF1AQ16665 PDP1-203ENST00000517764 2140 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HIF1AQ16665 WARS2-202ENST00000369426 2811 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HIF1AQ16665 PDGFRL-201ENST00000251630 1901 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HIF1AQ16665 CDIP1-206ENST00000563507 1463 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HIF1AQ16665 SEMA4F-210ENST00000611975 6007 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HIF1AQ16665 RNF222-202ENST00000399398 3062 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HIF1AQ16665 BIRC2-214ENST00000621637 3331 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HIF1AQ16665 DSE-202ENST00000359564 4037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HIF1AQ16665 RCSD1-202ENST00000367854 3135 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HIF1AQ16665 RPL18A-201ENST00000222247 665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HIF1AQ16665 TMEM191A-202ENST00000419950 663 ntTSL 3 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HIF1AQ16665 TMEM120A-203ENST00000439537 1161 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HIF1AQ16665 HLA-V-204ENST00000476601 1289 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
HIF1AQ16665 AC067930.5-201ENST00000531730 1173 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HIF1AQ16665 LINC01089-211ENST00000543334 1282 ntTSL 4 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HIF1AQ16665 AL512356.2-201ENST00000546955 174 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
HIF1AQ16665 RNASEK-C17orf49-201ENST00000547302 900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HIF1AQ16665 AL512361.1-201ENST00000554200 418 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
HIF1AQ16665 CUEDC1-207ENST00000577840 875 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HIF1AQ16665 COLCA2-204ENST00000610738 975 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HIF1AQ16665 AC105277.1-203ENST00000635492 1293 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HIF1AQ16665 C11orf53-203ENST00000637637 1049 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HIF1AQ16665 KIAA1683-209ENST00000612316 2684 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HIF1AQ16665 TSC2-203ENST00000382538 5264 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HIF1AQ16665 CNTNAP3P2-201ENST00000617175 3861 ntBASIC15.61■□□□□ 0.09
HIF1AQ16665 CLCN1-201ENST00000343257 3172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HIF1AQ16665 SLC16A9-202ENST00000395348 4178 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HIF1AQ16665 KLHL33-203ENST00000637228 5404 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HIF1AQ16665 NWD2-201ENST00000309447 8325 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HIF1AQ16665 HAP1-204ENST00000393939 5683 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HIF1AQ16665 TFAP2A-213ENST00000482890 2071 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HIF1AQ16665 SLC7A4-202ENST00000403586 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HIF1AQ16665 SCYL1-208ENST00000527009 2586 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HIF1AQ16665 NELFA-202ENST00000382882 3343 ntTSL 1 (best) BASIC15.61■□□□□ 0.09
HIF1AQ16665 FES-203ENST00000394302 2133 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HIF1AQ16665 LINC00924-202ENST00000556053 2682 ntTSL 2 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HIF1AQ16665 BRD1-205ENST00000457780 4997 ntTSL 5 BASIC15.61■□□□□ 0.09
HIF1AQ16665 VAC14-202ENST00000536184 2161 ntTSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HIF1AQ16665 KIAA1468-201ENST00000256858 5579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HIF1AQ16665 PCDHB14-201ENST00000239449 4828 ntAPPRIS P1 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HIF1AQ16665 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HIF1AQ16665 TRAF3-202ENST00000351691 2239 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HIF1AQ16665 FAM47E-STBD1-204ENST00000515604 3029 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HIF1AQ16665 XPNPEP1-218ENST00000502935 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HIF1AQ16665 RPS6KL1-210ENST00000555647 3309 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HIF1AQ16665 SLC43A2-201ENST00000301335 8136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
HIF1AQ16665 NOP2-222ENST00000617555 2017 ntTSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HIF1AQ16665 MAP3K4-201ENST00000348824 5295 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.6■□□□□ 0.09
HIF1AQ16665 MAGED4B-207ENST00000485287 2618 ntTSL 1 (best) BASIC15.6■□□□□ 0.09
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