Protein–RNA interactions for Protein: Q16610

ECM1, Extracellular matrix protein 1, humanhuman

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ECM1Q16610 CNN2P8-201ENST00000421872 913 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
ECM1Q16610 USB1-202ENST00000423271 1217 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ECM1Q16610 ADAMTSL1-210ENST00000431052 824 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ECM1Q16610 HILS1-202ENST00000545329 423 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
ECM1Q16610 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
ECM1Q16610 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
ECM1Q16610 KRT90P-201ENST00000549264 1064 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
ECM1Q16610 AC012645.3-203ENST00000567153 520 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ECM1Q16610 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
ECM1Q16610 C19orf53-206ENST00000593274 491 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ECM1Q16610 AC132938.4-201ENST00000623835 848 ntBASIC16.85■□□□□ 0.29
ECM1Q16610 SLC22A7-202ENST00000372585 2555 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ECM1Q16610 PWP2-201ENST00000291576 3297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ECM1Q16610 TAF6-201ENST00000344095 2727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ECM1Q16610 MPP1-204ENST00000393531 1389 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ECM1Q16610 ZNF18-201ENST00000322748 2767 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ECM1Q16610 PNPLA5-204ENST00000593866 2197 ntTSL 2 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ECM1Q16610 DNAJC19-201ENST00000382564 1453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ECM1Q16610 FBXO5-202ENST00000367241 2221 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ECM1Q16610 NTRK3-203ENST00000357724 2980 ntTSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ECM1Q16610 ECSIT-201ENST00000252440 1501 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ECM1Q16610 MYOZ1-201ENST00000359322 1541 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ECM1Q16610 MAP2K6-209ENST00000613873 1509 ntTSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ECM1Q16610 ARHGAP4-202ENST00000370016 3095 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.85■□□□□ 0.29
ECM1Q16610 EOMES-201ENST00000295743 3386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.85■□□□□ 0.29
ECM1Q16610 LINC00552-201ENST00000625151 2579 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
ECM1Q16610 MLST8-201ENST00000301724 1735 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ECM1Q16610 ARMC8-220ENST00000489213 1714 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ECM1Q16610 NBPF15-202ENST00000488031 4535 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ECM1Q16610 ASB10-201ENST00000275838 1820 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ECM1Q16610 RBM14-201ENST00000310137 2828 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ECM1Q16610 PERM1-201ENST00000341290 3035 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ECM1Q16610 SMARCA4-201ENST00000344626 5392 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ECM1Q16610 ANKRD46-205ENST00000520311 3270 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ECM1Q16610 SLC2A10-201ENST00000359271 4389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ECM1Q16610 MSTO1-202ENST00000368341 2245 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ECM1Q16610 WNK2-201ENST00000297954 7138 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ECM1Q16610 TMPO-203ENST00000343315 2465 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ECM1Q16610 PXN-201ENST00000228307 3785 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ECM1Q16610 RN7SKP230-201ENST00000365642 335 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
ECM1Q16610 GNG5-201ENST00000370641 920 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ECM1Q16610 GPR17-202ENST00000393018 1177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ECM1Q16610 AC016694.1-201ENST00000434179 700 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
ECM1Q16610 AC245100.3-201ENST00000441281 285 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
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ECM1Q16610 LINC02299-201ENST00000556669 430 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
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ECM1Q16610 DDX1-201ENST00000233084 2739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ECM1Q16610 GLT1D1-201ENST00000281703 2725 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
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ECM1Q16610 CREB3L3-204ENST00000602147 1382 ntTSL 1 (best) BASIC16.84■□□□□ 0.29
ECM1Q16610 AC060234.2-201ENST00000428825 1610 ntTSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ECM1Q16610 CNOT9-208ENST00000542068 3259 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.84■□□□□ 0.29
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ECM1Q16610 DNAJC7-202ENST00000426588 1774 ntTSL 2 BASIC16.84■□□□□ 0.29
ECM1Q16610 AC020910.5-201ENST00000623668 1865 ntBASIC16.84■□□□□ 0.29
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ECM1Q16610 KDM4B-211ENST00000611640 5703 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.29
ECM1Q16610 LRP4-201ENST00000378623 8076 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.29
ECM1Q16610 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ECM1Q16610 PA2G4-201ENST00000303305 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
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ECM1Q16610 HORMAD1-201ENST00000322343 1771 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
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ECM1Q16610 PLAC9-201ENST00000372263 785 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ECM1Q16610 UBE2D1-201ENST00000373910 2659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ECM1Q16610 DBI-203ENST00000393103 599 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
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ECM1Q16610 HS1BP3-203ENST00000406618 1375 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
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ECM1Q16610 COPS6-202ENST00000418625 1107 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ECM1Q16610 KCNQ1-AS1-201ENST00000440887 1084 ntTSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
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ECM1Q16610 ACA64.2-201ENST00000459014 129 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
ECM1Q16610 AL354710.2-201ENST00000468244 550 ntTSL 4 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ECM1Q16610 LIMS3-203ENST00000480744 1197 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ECM1Q16610 MESTP3-201ENST00000503460 968 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
ECM1Q16610 AC119751.2-201ENST00000504529 210 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
ECM1Q16610 AL391280.1-201ENST00000506969 1062 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
ECM1Q16610 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ECM1Q16610 CALCOCO2-211ENST00000508679 1396 ntTSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ECM1Q16610 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ECM1Q16610 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ECM1Q16610 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ECM1Q16610 RPL8-205ENST00000527914 551 ntTSL 3 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ECM1Q16610 CRISPLD2-203ENST00000564567 1651 ntTSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ECM1Q16610 AC133550.2-201ENST00000567731 544 ntTSL 4 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ECM1Q16610 PRCD-204ENST00000586148 630 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ECM1Q16610 AC003102.2-201ENST00000589195 1469 ntBASIC16.83■□□□□ 0.28
ECM1Q16610 C19orf38-203ENST00000592854 1060 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ECM1Q16610 TMTC1-206ENST00000551659 4228 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
ECM1Q16610 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.83■□□□□ 0.28
ECM1Q16610 ELFN1-201ENST00000424383 3845 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.83■□□□□ 0.28
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