Protein–RNA interactions for Protein: Q16600

ZNF239, Zinc finger protein 239, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 458 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF239Q16600 RAI14-202ENST00000428746 5064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ZNF239Q16600 SSH3-203ENST00000376757 2990 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ZNF239Q16600 JAKMIP1-204ENST00000409831 2371 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ZNF239Q16600 AP000439.3-201ENST00000545202 2376 ntTSL 2 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ZNF239Q16600 SBF1P1-201ENST00000444527 5631 ntBASIC13.73□□□□□ -0.21
ZNF239Q16600 GPR84-201ENST00000267015 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ZNF239Q16600 RTEL1-205ENST00000370018 4955 ntTSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ZNF239Q16600 ADD2-208ENST00000430656 2332 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ZNF239Q16600 SLC36A1-207ENST00000520701 2005 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ZNF239Q16600 R3HDM2-201ENST00000347140 4331 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.73□□□□□ -0.21
ZNF239Q16600 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC13.73□□□□□ -0.21
ZNF239Q16600 TCP11L1-201ENST00000334274 2817 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ZNF239Q16600 GOPC-203ENST00000535237 4460 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ZNF239Q16600 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ZNF239Q16600 CLIC6-202ENST00000360731 3860 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ZNF239Q16600 ACRBP-201ENST00000229243 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ZNF239Q16600 SCAMP2-201ENST00000268099 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ZNF239Q16600 C4orf19-201ENST00000284437 1949 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ZNF239Q16600 NCK1-201ENST00000288986 1937 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ZNF239Q16600 AL390038.1-201ENST00000419814 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ZNF239Q16600 AL359258.1-201ENST00000438965 2481 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ZNF239Q16600 PAAF1-207ENST00000536003 1639 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ZNF239Q16600 SEMA3B-212ENST00000616701 2958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ZNF239Q16600 STAT5B-201ENST00000293328 5103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ZNF239Q16600 AC010642.2-201ENST00000634676 2413 ntTSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
ZNF239Q16600 GLMP-214ENST00000614643 1851 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.72□□□□□ -0.21
ZNF239Q16600 HNRNPUL1-220ENST00000602130 2932 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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ZNF239Q16600 KAT5-202ENST00000352980 2059 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ZNF239Q16600 SLC5A7-201ENST00000264047 5152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ZNF239Q16600 CCDC50-201ENST00000392455 8429 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ZNF239Q16600 SCGN-201ENST00000334979 704 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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ZNF239Q16600 DRAP1-208ENST00000532933 751 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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ZNF239Q16600 C17orf62-239ENST00000585080 741 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.72□□□□□ -0.21
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ZNF239Q16600 NFATC4-206ENST00000539237 5686 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
ZNF239Q16600 GHRLOS-201ENST00000439539 1708 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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ZNF239Q16600 OIT3-202ENST00000622652 1602 ntTSL 1 (best) BASIC13.72□□□□□ -0.21
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ZNF239Q16600 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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ZNF239Q16600 ATP6V0D1-201ENST00000290949 1716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
ZNF239Q16600 NCR1-201ENST00000291890 1155 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
ZNF239Q16600 CSF2-201ENST00000296871 787 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
ZNF239Q16600 TM4SF4-201ENST00000305354 2101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
ZNF239Q16600 CACNG5-201ENST00000307139 926 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
ZNF239Q16600 NCR1-202ENST00000338835 973 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
ZNF239Q16600 NCR1-203ENST00000350790 739 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
ZNF239Q16600 VCX3B-202ENST00000381032 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
ZNF239Q16600 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
ZNF239Q16600 PGGT1BP2-201ENST00000398621 1028 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
ZNF239Q16600 BAATP1-201ENST00000412284 1225 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
ZNF239Q16600 RHCE-206ENST00000413854 1198 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
ZNF239Q16600 SNHG11-209ENST00000440918 556 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
ZNF239Q16600 NUTM2A-AS1-212ENST00000458739 733 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
ZNF239Q16600 AC095060.1-201ENST00000502455 549 ntTSL 4 BASIC13.71□□□□□ -0.21
ZNF239Q16600 KRT18P25-201ENST00000508931 1278 ntBASIC13.71□□□□□ -0.21
ZNF239Q16600 BRF2-202ENST00000520601 1192 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
ZNF239Q16600 CDK2AP2-205ENST00000531506 634 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
ZNF239Q16600 MRPL52-216ENST00000557221 922 ntTSL 2 BASIC13.71□□□□□ -0.21
ZNF239Q16600 GCHFR-203ENST00000558670 412 ntTSL 3 BASIC13.71□□□□□ -0.21
ZNF239Q16600 TMEM170A-203ENST00000566980 547 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
ZNF239Q16600 RAMP2-202ENST00000587142 549 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
ZNF239Q16600 RAMP2-203ENST00000588576 573 ntTSL 5 BASIC13.71□□□□□ -0.21
ZNF239Q16600 TUBB6-213ENST00000591909 1017 ntTSL 1 (best) BASIC13.71□□□□□ -0.21
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