Protein–RNA interactions for Protein: Q16445

GABRA6, Gamma-aminobutyric acid receptor subunit alpha-6, humanhuman

Predictions only

Length 453 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GABRA6Q16445 NRBP1-201ENST00000233557 2887 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.3□□□□□ -0.28
GABRA6Q16445 RBCK1-201ENST00000353660 2511 ntTSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
GABRA6Q16445 RASAL1-207ENST00000548055 2502 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.3□□□□□ -0.28
GABRA6Q16445 FAM32A-201ENST00000263384 1455 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
GABRA6Q16445 SCARB1-202ENST00000339570 3329 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
GABRA6Q16445 TSC22D3-201ENST00000315660 2213 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
GABRA6Q16445 ANKRD42-208ENST00000531895 1887 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
GABRA6Q16445 GFRA2-204ENST00000518077 1503 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
GABRA6Q16445 TEX28-203ENST00000617225 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
GABRA6Q16445 WIPF3-202ENST00000409123 3491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
GABRA6Q16445 ADAM15-205ENST00000360674 2732 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
GABRA6Q16445 OPA1-208ENST00000392438 6340 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
GABRA6Q16445 ARAP2-201ENST00000303965 7514 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
GABRA6Q16445 ZNF662-201ENST00000328199 3186 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
GABRA6Q16445 APLN-201ENST00000429967 3205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
GABRA6Q16445 PDE1C-202ENST00000396182 2420 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
GABRA6Q16445 CHRNA7-217ENST00000636603 2012 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
GABRA6Q16445 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
GABRA6Q16445 KYAT1-202ENST00000320665 1623 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
GABRA6Q16445 TMED5-202ENST00000370282 6104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
GABRA6Q16445 AK5-203ENST00000354567 3251 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
GABRA6Q16445 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
GABRA6Q16445 CKM-201ENST00000221476 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
GABRA6Q16445 AC006001.1-201ENST00000325130 474 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
GABRA6Q16445 SURF4-202ENST00000371989 2984 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
GABRA6Q16445 CASK-202ENST00000378158 3848 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
GABRA6Q16445 MPV17-206ENST00000402722 827 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
GABRA6Q16445 AC007319.1-202ENST00000412276 829 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
GABRA6Q16445 DBH-AS1-201ENST00000425189 2139 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
GABRA6Q16445 AL354761.2-202ENST00000430816 546 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
GABRA6Q16445 RFPL4A-201ENST00000434937 1035 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
GABRA6Q16445 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
GABRA6Q16445 DICER1-AS1-202ENST00000439819 810 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
GABRA6Q16445 AC128709.1-201ENST00000445908 600 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
GABRA6Q16445 FO681548.1-201ENST00000455617 1132 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
GABRA6Q16445 CHCHD7-211ENST00000521831 573 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
GABRA6Q16445 AC136475.5-202ENST00000524824 587 ntTSL 4 BASIC13.29□□□□□ -0.28
GABRA6Q16445 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
GABRA6Q16445 LINC02449-203ENST00000536034 451 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
GABRA6Q16445 PAFAH1B3-202ENST00000538771 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
GABRA6Q16445 AC078819.1-201ENST00000547454 765 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
GABRA6Q16445 AC012085.1-201ENST00000548270 765 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
GABRA6Q16445 AC079316.1-201ENST00000548397 411 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
GABRA6Q16445 AC090502.1-201ENST00000549905 748 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
GABRA6Q16445 AC090502.1-204ENST00000551210 469 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
GABRA6Q16445 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
GABRA6Q16445 ACAP1-208ENST00000574499 412 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
GABRA6Q16445 MLF1-216ENST00000618075 2116 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
GABRA6Q16445 ENPP7P14-201ENST00000621765 1040 ntBASIC13.29□□□□□ -0.28
GABRA6Q16445 MMRN2-201ENST00000372027 4375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
GABRA6Q16445 SNRNP27-202ENST00000409116 1339 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
GABRA6Q16445 CHST10-203ENST00000409701 1338 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
GABRA6Q16445 ZSCAN30-212ENST00000639929 1305 ntTSL 5 BASIC13.29□□□□□ -0.28
GABRA6Q16445 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
GABRA6Q16445 CARNMT1-202ENST00000376834 4130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
GABRA6Q16445 CLDND1-215ENST00000507874 1380 ntTSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
GABRA6Q16445 CHD1L-203ENST00000369259 2358 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
GABRA6Q16445 C5orf38-207ENST00000515640 1441 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC13.29□□□□□ -0.28
GABRA6Q16445 APBA2-205ENST00000558330 3349 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
GABRA6Q16445 RALYL-207ENST00000521695 1924 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
GABRA6Q16445 PIMREG-205ENST00000572447 1948 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
GABRA6Q16445 TYSND1-202ENST00000335494 3397 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
GABRA6Q16445 ZNF219-202ENST00000421093 2908 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
GABRA6Q16445 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
GABRA6Q16445 MAX-204ENST00000358402 1973 ntTSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
GABRA6Q16445 CNOT8-201ENST00000285896 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.29□□□□□ -0.28
GABRA6Q16445 TUB-AS1-201ENST00000506601 2021 ntTSL 2 BASIC13.29□□□□□ -0.28
GABRA6Q16445 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
GABRA6Q16445 TYSND1-201ENST00000287078 3644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
GABRA6Q16445 HGNC:18790-202ENST00000421177 4172 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
GABRA6Q16445 GTF2A1L-203ENST00000430487 1575 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
GABRA6Q16445 AL136379.1-201ENST00000623471 2642 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
GABRA6Q16445 SATB2-206ENST00000457245 2656 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
GABRA6Q16445 CUL3-202ENST00000344951 6592 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
GABRA6Q16445 AC013268.4-201ENST00000637413 2228 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
GABRA6Q16445 UBAC2-AS1-201ENST00000426037 1771 ntTSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
GABRA6Q16445 HSD17B6-205ENST00000554643 1751 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
GABRA6Q16445 INPP5K-204ENST00000421807 2988 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
GABRA6Q16445 CEP70-213ENST00000489254 1811 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.28□□□□□ -0.28
GABRA6Q16445 BLVRB-201ENST00000263368 873 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
GABRA6Q16445 TPM3P8-201ENST00000330554 643 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
GABRA6Q16445 SS18L1-202ENST00000370848 1238 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
GABRA6Q16445 IGLV4-69-201ENST00000390282 419 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
GABRA6Q16445 AL355483.2-201ENST00000421637 675 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
GABRA6Q16445 AC233976.1-201ENST00000425150 451 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
GABRA6Q16445 AL031283.3-201ENST00000439788 727 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
GABRA6Q16445 CSF2RBP1-201ENST00000447905 391 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
GABRA6Q16445 MPZL1-209ENST00000474859 630 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
GABRA6Q16445 AHRR-211ENST00000515206 462 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
GABRA6Q16445 AC100818.1-201ENST00000524167 563 ntTSL 4 BASIC13.28□□□□□ -0.28
GABRA6Q16445 ANAPC15-214ENST00000543587 883 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
GABRA6Q16445 AP001453.3-201ENST00000545800 853 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
GABRA6Q16445 AC005597.1-201ENST00000588092 420 ntTSL 3 BASIC13.28□□□□□ -0.28
GABRA6Q16445 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
GABRA6Q16445 AC138951.2-201ENST00000623455 1161 ntBASIC13.28□□□□□ -0.28
GABRA6Q16445 ANKMY2-201ENST00000306999 2555 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
GABRA6Q16445 PCDHGB2-202ENST00000622527 2588 ntAPPRIS P1 BASIC13.28□□□□□ -0.28
GABRA6Q16445 CHL1-202ENST00000397491 5235 ntTSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
GABRA6Q16445 PSMD14-201ENST00000409682 1954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.28□□□□□ -0.28
GABRA6Q16445 DRC3-216ENST00000584166 1953 ntTSL 5 BASIC13.28□□□□□ -0.28
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 55.1 ms