Protein–RNA interactions for Protein: Q15843

NEDD8, NEDD8, humanhuman

Predictions only

Length 81 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NEDD8Q15843 MRPL52-203ENST00000397496 1111 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
NEDD8Q15843 SGO1-208ENST00000437051 1187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
NEDD8Q15843 EGFR-207ENST00000455089 3844 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
NEDD8Q15843 PTK2-216ENST00000519881 863 ntTSL 3 BASIC13.96□□□□□ -0.17
NEDD8Q15843 HNRNPUP1-201ENST00000554987 333 ntBASIC13.96□□□□□ -0.17
NEDD8Q15843 MCRIP1-211ENST00000576679 751 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
NEDD8Q15843 AC008992.1-201ENST00000591132 446 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
NEDD8Q15843 SERF2-217ENST00000630046 862 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.17
NEDD8Q15843 ARHGEF1-201ENST00000337665 3171 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
NEDD8Q15843 PUF60-201ENST00000313352 1804 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
NEDD8Q15843 CTSA-202ENST00000354880 1820 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
NEDD8Q15843 MPZ-204ENST00000491222 1824 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.17
NEDD8Q15843 SETD7-204ENST00000506866 1602 ntTSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.17
NEDD8Q15843 TMPRSS12-202ENST00000551456 3336 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
NEDD8Q15843 B3GNTL1-211ENST00000576599 1787 ntTSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
NEDD8Q15843 SPAST-201ENST00000315285 5117 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
NEDD8Q15843 KRT74-203ENST00000549343 2858 ntTSL 5 BASIC13.96□□□□□ -0.18
NEDD8Q15843 UBFD1-207ENST00000567212 4727 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.96□□□□□ -0.18
NEDD8Q15843 RCL1-204ENST00000381750 2134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
NEDD8Q15843 ABCG8-201ENST00000272286 2665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
NEDD8Q15843 ALX4-201ENST00000329255 5750 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.96□□□□□ -0.18
NEDD8Q15843 UPB1-201ENST00000326010 2290 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
NEDD8Q15843 CCDC105-201ENST00000292574 1732 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
NEDD8Q15843 NTM-202ENST00000374786 3190 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
NEDD8Q15843 AC004241.5-201ENST00000623870 2448 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
NEDD8Q15843 ITGB8-201ENST00000222573 8751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
NEDD8Q15843 FAM219A-207ENST00000379089 3624 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
NEDD8Q15843 AC005332.1-201ENST00000577698 1310 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
NEDD8Q15843 SUOX-208ENST00000548274 2352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
NEDD8Q15843 FAM131A-203ENST00000383847 1483 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
NEDD8Q15843 CELF4-201ENST00000334919 3542 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
NEDD8Q15843 SPG21-203ENST00000433215 1613 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
NEDD8Q15843 ESS2-201ENST00000252137 5392 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
NEDD8Q15843 SFTPC-201ENST00000318561 997 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
NEDD8Q15843 MRPL20-201ENST00000344843 721 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
NEDD8Q15843 MFSD13A-202ENST00000369931 823 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
NEDD8Q15843 HRAS-202ENST00000397594 1099 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
NEDD8Q15843 ATP5J-203ENST00000400090 647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
NEDD8Q15843 IGF2-206ENST00000418738 934 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
NEDD8Q15843 LAGE3P1-201ENST00000425356 484 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
NEDD8Q15843 RABL2B-209ENST00000435118 1126 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
NEDD8Q15843 KRT16P4-201ENST00000453883 522 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
NEDD8Q15843 TMEM198B-204ENST00000484016 896 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
NEDD8Q15843 CCDC74BP1-201ENST00000508880 1123 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
NEDD8Q15843 AC022447.6-201ENST00000515522 438 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
NEDD8Q15843 NPM2-204ENST00000518119 1190 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
NEDD8Q15843 AP000777.3-201ENST00000538705 491 ntTSL 3 BASIC13.95□□□□□ -0.18
NEDD8Q15843 AC097359.3-201ENST00000603982 1210 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
NEDD8Q15843 IGHV3OR16-7-201ENST00000604106 360 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
NEDD8Q15843 AL162497.1-201ENST00000615635 518 ntTSL 4 BASIC13.95□□□□□ -0.18
NEDD8Q15843 LAP3-211ENST00000618908 2100 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
NEDD8Q15843 BEAN1-211ENST00000622872 1171 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
NEDD8Q15843 EGR1-201ENST00000239938 3138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
NEDD8Q15843 SLC9B2-202ENST00000394785 3126 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
NEDD8Q15843 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
NEDD8Q15843 KRT8P37-201ENST00000451609 1420 ntBASIC13.95□□□□□ -0.18
NEDD8Q15843 B4GALT3-201ENST00000319769 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
NEDD8Q15843 SNCAIP-203ENST00000379538 2588 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
NEDD8Q15843 OAS3-201ENST00000228928 6719 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
NEDD8Q15843 ZC2HC1A-201ENST00000263849 3352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
NEDD8Q15843 ABCB9-203ENST00000346530 3399 ntTSL 5 BASIC13.95□□□□□ -0.18
NEDD8Q15843 AMOTL2-212ENST00000514516 4521 ntTSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
NEDD8Q15843 DDX19B-203ENST00000393657 1717 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
NEDD8Q15843 PELP1-201ENST00000301396 3673 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
NEDD8Q15843 GOPC-202ENST00000368498 4450 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
NEDD8Q15843 PVR-205ENST00000425690 3325 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
NEDD8Q15843 TARBP2-203ENST00000456234 1368 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
NEDD8Q15843 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
NEDD8Q15843 RNF14-201ENST00000347642 4213 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.95□□□□□ -0.18
NEDD8Q15843 COL18A1-AS1-201ENST00000397787 3425 ntTSL 1 (best) BASIC13.95□□□□□ -0.18
NEDD8Q15843 MGRN1-206ENST00000586183 1841 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC13.94□□□□□ -0.18
NEDD8Q15843 AGBL2-205ENST00000528244 2929 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
NEDD8Q15843 SHROOM1-203ENST00000378679 4019 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
NEDD8Q15843 TSEN2-202ENST00000402228 2149 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
NEDD8Q15843 FAM160A2-202ENST00000449352 3354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
NEDD8Q15843 RAD51-201ENST00000267868 2449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
NEDD8Q15843 LRP8-203ENST00000354412 2553 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
NEDD8Q15843 TMED1-201ENST00000214869 1340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
NEDD8Q15843 PKD1L2-209ENST00000531391 1488 ntTSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
NEDD8Q15843 MAP7D3-201ENST00000316077 4567 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
NEDD8Q15843 GOLGA7B-203ENST00000596005 6378 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
NEDD8Q15843 ZNF251-201ENST00000292562 2807 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
NEDD8Q15843 UBE2I-204ENST00000397515 3109 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC13.94□□□□□ -0.18
NEDD8Q15843 AP1G2-201ENST00000308724 3298 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
NEDD8Q15843 INTS5-201ENST00000330574 3285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
NEDD8Q15843 TYK2-205ENST00000525621 4347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
NEDD8Q15843 DAB2IP-202ENST00000309989 3500 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
NEDD8Q15843 PRSS55-201ENST00000328655 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
NEDD8Q15843 HRCT1-201ENST00000354323 950 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
NEDD8Q15843 CACNA2D1-202ENST00000356860 7563 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
NEDD8Q15843 EDN3-203ENST00000371025 1153 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
NEDD8Q15843 NACC2-202ENST00000371753 6802 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC13.94□□□□□ -0.18
NEDD8Q15843 ACTRT2-201ENST00000378404 1421 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
NEDD8Q15843 MRPL20P1-201ENST00000400819 433 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
NEDD8Q15843 FAM49B-201ENST00000401979 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
NEDD8Q15843 POM121L12-201ENST00000408890 1283 ntAPPRIS P1 BASIC13.94□□□□□ -0.18
NEDD8Q15843 SCRN1-205ENST00000425819 1552 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
NEDD8Q15843 AL136982.4-201ENST00000437689 1740 ntBASIC13.94□□□□□ -0.18
NEDD8Q15843 DDN-AS1-201ENST00000547395 858 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
NEDD8Q15843 LETMD1-235ENST00000552739 1713 ntTSL 2 BASIC13.94□□□□□ -0.18
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 31.8 ms