Protein–RNA interactions for Protein: Q15573

TAF1A, TATA box-binding protein-associated factor RNA polymerase I subunit A, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 450 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF1AQ15573 ASNA1-204ENST00000591090 1368 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TAF1AQ15573 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TAF1AQ15573 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TAF1AQ15573 DMRT2-202ENST00000302441 1495 ntTSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TAF1AQ15573 CAPN2-201ENST00000295006 3573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TAF1AQ15573 TP53I11-208ENST00000525680 2647 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TAF1AQ15573 USP37-202ENST00000338465 1771 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TAF1AQ15573 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TAF1AQ15573 AC055811.4-201ENST00000624039 1754 ntBASIC15.18■□□□□ 0.02
TAF1AQ15573 TLX1NB-202ENST00000445873 1862 ntTSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TAF1AQ15573 XKR5-201ENST00000618742 4893 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TAF1AQ15573 SPPL2B-207ENST00000610743 2583 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TAF1AQ15573 MAP7-207ENST00000616617 4326 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.18■□□□□ 0.02
TAF1AQ15573 EXOG-201ENST00000287675 2792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TAF1AQ15573 SLC12A9-201ENST00000354161 3273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.18■□□□□ 0.02
TAF1AQ15573 PPP1R27-202ENST00000570394 1443 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TAF1AQ15573 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TAF1AQ15573 RPS6KL1-201ENST00000354625 5195 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TAF1AQ15573 ZCCHC17-202ENST00000373714 1730 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TAF1AQ15573 AGPAT1-201ENST00000336984 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TAF1AQ15573 LINC00917-207ENST00000601556 2618 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TAF1AQ15573 PODNL1-204ENST00000538517 2744 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TAF1AQ15573 RER1-203ENST00000378513 3000 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TAF1AQ15573 NEDD4L-202ENST00000356462 3335 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TAF1AQ15573 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TAF1AQ15573 NUMBL-201ENST00000252891 3561 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TAF1AQ15573 REPIN1-209ENST00000479668 3182 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TAF1AQ15573 GRB7-203ENST00000394209 1955 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TAF1AQ15573 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TAF1AQ15573 ABCC9-203ENST00000326684 1693 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TAF1AQ15573 MFN2-203ENST00000444836 4531 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TAF1AQ15573 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TAF1AQ15573 VCX2-201ENST00000317103 815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TAF1AQ15573 UBE2G2-201ENST00000330942 721 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TAF1AQ15573 KIAA0907-201ENST00000368319 1155 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TAF1AQ15573 TCF20-203ENST00000404876 1058 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TAF1AQ15573 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TAF1AQ15573 AL589986.1-201ENST00000429230 789 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TAF1AQ15573 GNB3-202ENST00000435982 1110 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TAF1AQ15573 PTPA-220ENST00000436883 532 ntTSL 4 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TAF1AQ15573 KDM4A-AS1-204ENST00000439057 686 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TAF1AQ15573 LINC00473-201ENST00000444465 798 ntTSL 3 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TAF1AQ15573 RN7SL837P-201ENST00000463010 287 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TAF1AQ15573 SPDYE16-201ENST00000515340 858 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TAF1AQ15573 AP005018.1-201ENST00000525475 301 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TAF1AQ15573 ACRV1-202ENST00000527795 782 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TAF1AQ15573 TDH-203ENST00000531764 1110 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TAF1AQ15573 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TAF1AQ15573 VCX-203ENST00000620630 812 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TAF1AQ15573 AC233723.1-201ENST00000635921 386 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TAF1AQ15573 SLC35A3-221ENST00000640600 3341 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TAF1AQ15573 PODN-201ENST00000312553 3010 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TAF1AQ15573 PPP2R5C-204ENST00000422945 4481 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TAF1AQ15573 RTP1-201ENST00000312295 2217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TAF1AQ15573 AC023090.2-201ENST00000625182 2110 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TAF1AQ15573 DHX36-201ENST00000308361 3487 ntTSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TAF1AQ15573 ESPNL-201ENST00000343063 4836 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TAF1AQ15573 CELF4-223ENST00000603232 1906 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TAF1AQ15573 PCYOX1-201ENST00000264441 2959 ntTSL 5 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TAF1AQ15573 SLC41A1-201ENST00000367137 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TAF1AQ15573 NR1H3-211ENST00000441012 1637 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TAF1AQ15573 ROBO1-209ENST00000495273 5600 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TAF1AQ15573 FUCA2-201ENST00000002165 2356 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TAF1AQ15573 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TAF1AQ15573 UGDH-201ENST00000316423 3216 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TAF1AQ15573 HYAL2-208ENST00000447092 4054 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TAF1AQ15573 ENO3-206ENST00000519584 1322 ntTSL 2 BASIC15.17■□□□□ 0.02
TAF1AQ15573 AC134312.5-201ENST00000568031 1313 ntBASIC15.17■□□□□ 0.02
TAF1AQ15573 SIK3-205ENST00000446921 3858 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.17■□□□□ 0.02
TAF1AQ15573 ZBTB32-202ENST00000392197 2068 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TAF1AQ15573 AC018442.1-201ENST00000421439 2061 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
TAF1AQ15573 MAP3K4-202ENST00000366919 5397 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TAF1AQ15573 TNFRSF10A-201ENST00000221132 2714 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TAF1AQ15573 KIAA1211-206ENST00000541073 4117 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TAF1AQ15573 SYT13-201ENST00000020926 5144 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TAF1AQ15573 DTNB-228ENST00000496972 2328 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TAF1AQ15573 RBM46-204ENST00000514866 2315 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TAF1AQ15573 DUS4L-201ENST00000265720 2220 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TAF1AQ15573 PSMD13-215ENST00000621534 1572 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TAF1AQ15573 EGOT-201ENST00000414938 1464 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TAF1AQ15573 FZD4-201ENST00000531380 7383 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TAF1AQ15573 PUDP-202ENST00000412827 1376 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TAF1AQ15573 TBCEL-205ENST00000529397 1375 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TAF1AQ15573 HM13-201ENST00000335574 1809 ntTSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TAF1AQ15573 DDX1-202ENST00000381341 2817 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TAF1AQ15573 FAM169B-201ENST00000332908 579 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TAF1AQ15573 NTMT1-202ENST00000372481 741 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TAF1AQ15573 IFI27L1-201ENST00000393115 674 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TAF1AQ15573 NDUFC1-201ENST00000394223 598 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TAF1AQ15573 ATP5D-202ENST00000395633 704 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TAF1AQ15573 BLVRA-202ENST00000402924 1161 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TAF1AQ15573 HSPC324-201ENST00000411904 557 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TAF1AQ15573 ABHD11-AS1-201ENST00000427153 662 ntTSL 5 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TAF1AQ15573 HCST-202ENST00000437550 445 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.16■□□□□ 0.02
TAF1AQ15573 AL035588.1-201ENST00000438967 408 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TAF1AQ15573 AC073130.2-202ENST00000444244 842 ntTSL 3 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TAF1AQ15573 PRSS42-202ENST00000447340 1280 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TAF1AQ15573 AC007389.4-201ENST00000454674 793 ntBASIC15.16■□□□□ 0.02
TAF1AQ15573 TAF8-206ENST00000472818 719 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
TAF1AQ15573 LINC00824-206ENST00000523173 920 ntTSL 2 BASIC15.16■□□□□ 0.02
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 43.1 ms