Protein–RNA interactions for Protein: Q15438

CYTH1, Cytohesin-1, humanhuman

Predictions only

Length 398 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CYTH1Q15438 TNFRSF12A-202ENST00000341627 881 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CYTH1Q15438 TNFRSF14-202ENST00000409119 896 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CYTH1Q15438 AL162726.2-201ENST00000438986 1017 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
CYTH1Q15438 AC078785.1-203ENST00000467342 573 ntTSL 4 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CYTH1Q15438 S100A6-205ENST00000496817 673 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CYTH1Q15438 MRNIP-212ENST00000520698 902 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CYTH1Q15438 HBS1L-208ENST00000525067 582 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CYTH1Q15438 RBM7-207ENST00000544582 692 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CYTH1Q15438 CR383656.12-201ENST00000549567 513 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
CYTH1Q15438 C17orf49-209ENST00000552775 779 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CYTH1Q15438 AC005520.2-201ENST00000556194 573 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CYTH1Q15438 AL110118.2-203ENST00000557574 554 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CYTH1Q15438 IFT20-206ENST00000578122 834 ntTSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CYTH1Q15438 IFT20-208ENST00000578985 831 ntTSL 3 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CYTH1Q15438 AC010503.1-201ENST00000596027 520 ntTSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CYTH1Q15438 AC005252.2-201ENST00000624630 1141 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
CYTH1Q15438 BCS1L-203ENST00000392110 1525 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CYTH1Q15438 RDM1-224ENST00000619262 1535 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CYTH1Q15438 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CYTH1Q15438 HPGD-202ENST00000296522 3027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CYTH1Q15438 CYLD-202ENST00000398568 3536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CYTH1Q15438 GALNTL6-205ENST00000511251 2905 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CYTH1Q15438 BICDL1-201ENST00000397558 3055 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.66■□□□□ 0.1
CYTH1Q15438 UVSSA-206ENST00000507531 2597 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CYTH1Q15438 AC023157.3-201ENST00000619086 2088 ntBASIC15.66■□□□□ 0.1
CYTH1Q15438 CDK5RAP2-202ENST00000360190 5985 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CYTH1Q15438 RGR-201ENST00000358110 1349 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CYTH1Q15438 AC006504.5-203ENST00000590628 1335 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CYTH1Q15438 PTPN9-206ENST00000618819 7813 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CYTH1Q15438 PDLIM5-202ENST00000318007 1960 ntTSL 1 (best) BASIC15.66■□□□□ 0.1
CYTH1Q15438 KTN1-AS1-201ENST00000335142 1465 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CYTH1Q15438 PKIA-202ENST00000396418 4163 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CYTH1Q15438 NEBL-203ENST00000417816 3008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CYTH1Q15438 PAK4-205ENST00000593690 3025 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CYTH1Q15438 DUS2-202ENST00000432752 1864 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CYTH1Q15438 MRPL11-201ENST00000310999 1605 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CYTH1Q15438 EDN3-201ENST00000311585 2655 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CYTH1Q15438 AL162457.1-201ENST00000317652 2000 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CYTH1Q15438 CICP4-201ENST00000447359 2812 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
CYTH1Q15438 HMOX2-204ENST00000414777 1752 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CYTH1Q15438 USE1-206ENST00000595101 1776 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CYTH1Q15438 GOLGA8DP-202ENST00000341390 2184 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
CYTH1Q15438 SHISA9-201ENST00000423335 4043 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CYTH1Q15438 LINC02495-201ENST00000508601 4167 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CYTH1Q15438 CSAD-202ENST00000379843 2086 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CYTH1Q15438 HIST3H2A-201ENST00000366695 895 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CYTH1Q15438 PRKN-203ENST00000366894 1157 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CYTH1Q15438 KRTAP1-4-201ENST00000377747 408 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CYTH1Q15438 FKBP1B-201ENST00000380986 952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CYTH1Q15438 HOPX-203ENST00000381255 1164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CYTH1Q15438 KRTAP10-2-201ENST00000391621 1149 ntAPPRIS P1 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CYTH1Q15438 AC104457.1-201ENST00000401024 814 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
CYTH1Q15438 GAPDHP21-201ENST00000450301 1010 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
CYTH1Q15438 BX322559.1-201ENST00000456613 319 ntTSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CYTH1Q15438 LINC01336-201ENST00000503568 534 ntTSL 4 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CYTH1Q15438 AP001582.1-201ENST00000525856 295 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
CYTH1Q15438 PLEKHA7-214ENST00000532079 565 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CYTH1Q15438 HOPX-210ENST00000553379 1001 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CYTH1Q15438 HOPX-212ENST00000555760 1139 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CYTH1Q15438 HOPX-213ENST00000556376 1064 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CYTH1Q15438 AC105339.1-202ENST00000559535 1283 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CYTH1Q15438 AC129507.3-201ENST00000571512 913 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CYTH1Q15438 FXYD6-216ENST00000584230 566 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CYTH1Q15438 TPTE2P2-205ENST00000606711 505 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CYTH1Q15438 AC244517.11-204ENST00000624424 760 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CYTH1Q15438 FKBP4-208ENST00000630279 156 ntTSL 5 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CYTH1Q15438 ETV5-206ENST00000434744 2213 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CYTH1Q15438 MYH11-201ENST00000300036 6029 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CYTH1Q15438 AC007787.1-201ENST00000588095 1583 ntBASIC15.65■□□□□ 0.1
CYTH1Q15438 POU2F2-207ENST00000529067 2657 ntTSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CYTH1Q15438 MED15-202ENST00000292733 3252 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.65■□□□□ 0.1
CYTH1Q15438 ZNF208-205ENST00000601773 2027 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CYTH1Q15438 FAM160A2-203ENST00000524416 3327 ntTSL 2 BASIC15.65■□□□□ 0.1
CYTH1Q15438 FURIN-207ENST00000618099 4345 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.1
CYTH1Q15438 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.1
CYTH1Q15438 AC148477.4-201ENST00000613430 1793 ntBASIC15.64■□□□□ 0.1
CYTH1Q15438 AP4E1-201ENST00000261842 6758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CYTH1Q15438 HNRNPK-204ENST00000376263 2942 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CYTH1Q15438 GSG1L-203ENST00000447459 4916 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CYTH1Q15438 SHC1-204ENST00000368450 3059 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CYTH1Q15438 SHC1-205ENST00000368453 3062 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CYTH1Q15438 YTHDC1-202ENST00000355665 3244 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CYTH1Q15438 PRKAG3-206ENST00000529249 2222 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CYTH1Q15438 SEC13-201ENST00000337354 1363 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CYTH1Q15438 GSTO2-203ENST00000450629 1391 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CYTH1Q15438 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC15.64■□□□□ 0.09
CYTH1Q15438 EFCAB2-202ENST00000366522 6167 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CYTH1Q15438 TFB2M-201ENST00000366514 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CYTH1Q15438 NSUN5P1-206ENST00000457988 1836 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CYTH1Q15438 CAMSAP3-202ENST00000446248 4179 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CYTH1Q15438 ARVCF-202ENST00000401994 2700 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CYTH1Q15438 FAM160B1-203ENST00000369250 2870 ntTSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CYTH1Q15438 KRT77-201ENST00000341809 3305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CYTH1Q15438 LRCH1-202ENST00000389797 3314 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CYTH1Q15438 LPAR1-203ENST00000374431 3637 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CYTH1Q15438 BPIFB2-201ENST00000170150 1898 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CYTH1Q15438 NFU1-201ENST00000303698 1034 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
CYTH1Q15438 VAPA-201ENST00000340541 1227 ntTSL 5 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CYTH1Q15438 CRB2-201ENST00000359999 3659 ntTSL 2 BASIC15.64■□□□□ 0.09
CYTH1Q15438 MPV17-203ENST00000380044 1005 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.64■□□□□ 0.09
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