Protein–RNA interactions for Protein: Q14164

IKBKE, Inhibitor of nuclear factor kappa-B kinase subunit epsilon, humanhuman

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Length 716 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
IKBKEQ14164 AL353637.1-201ENST00000451571 732 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
IKBKEQ14164 CCKBR-204ENST00000531712 463 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
IKBKEQ14164 LINC01229-204ENST00000568751 720 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
IKBKEQ14164 RANGRF-205ENST00000580434 749 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
IKBKEQ14164 ZNF586-206ENST00000599802 581 ntTSL 3 BASIC16.4■□□□□ 0.22
IKBKEQ14164 NEAT1-203ENST00000601801 487 ntTSL 4 BASIC16.4■□□□□ 0.22
IKBKEQ14164 LINC01669-205ENST00000624561 713 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
IKBKEQ14164 AL590644.3-201ENST00000635428 1228 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
IKBKEQ14164 AC002472.3-201ENST00000640124 621 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
IKBKEQ14164 MAP4-202ENST00000360240 5142 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
IKBKEQ14164 SGO1-203ENST00000412997 2587 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
IKBKEQ14164 FAM189B-202ENST00000361361 3082 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
IKBKEQ14164 AC068418.2-201ENST00000577309 3703 ntBASIC16.4■□□□□ 0.22
IKBKEQ14164 CHAT-203ENST00000351556 2286 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
IKBKEQ14164 SEC14L4-204ENST00000381982 1603 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
IKBKEQ14164 PLEKHB2-207ENST00000438882 1460 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
IKBKEQ14164 SPATA20-202ENST00000356488 2634 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
IKBKEQ14164 CARD14-202ENST00000570421 2607 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
IKBKEQ14164 RALGPS1-203ENST00000373434 2466 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
IKBKEQ14164 CXorf40B-202ENST00000370404 1316 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
IKBKEQ14164 CPA5-202ENST00000431780 1803 ntTSL 2 BASIC16.4■□□□□ 0.22
IKBKEQ14164 HOXD3-201ENST00000249440 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
IKBKEQ14164 NFATC3-222ENST00000575270 3824 ntTSL 5 BASIC16.4■□□□□ 0.22
IKBKEQ14164 SLC29A1-209ENST00000427851 2171 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
IKBKEQ14164 OAS1-202ENST00000445409 1684 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
IKBKEQ14164 TRIM7-203ENST00000393315 2851 ntTSL 1 (best) BASIC16.4■□□□□ 0.22
IKBKEQ14164 PHACTR3-204ENST00000371015 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.22
IKBKEQ14164 SFRP1-201ENST00000220772 4492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
IKBKEQ14164 RNF32-204ENST00000392743 1746 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
IKBKEQ14164 TM9SF1-201ENST00000261789 2452 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
IKBKEQ14164 CPA5-201ENST00000393213 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
IKBKEQ14164 ZFAND5-204ENST00000376960 2686 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
IKBKEQ14164 HNRNPU-205ENST00000444376 6827 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
IKBKEQ14164 FBLN1-202ENST00000327858 2896 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
IKBKEQ14164 SLCO6A1-207ENST00000513675 1611 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
IKBKEQ14164 ABHD18-202ENST00000398965 2177 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
IKBKEQ14164 FZR1-201ENST00000313639 1215 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
IKBKEQ14164 NUDT1-203ENST00000356714 662 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
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IKBKEQ14164 EDF1-202ENST00000371648 809 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
IKBKEQ14164 ARMC12-203ENST00000373869 1111 ntTSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
IKBKEQ14164 C6orf136-202ENST00000376471 614 ntTSL 3 BASIC16.39■□□□□ 0.21
IKBKEQ14164 NUDT1-204ENST00000397046 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
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IKBKEQ14164 ERBB3-202ENST00000411731 1027 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
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IKBKEQ14164 AC026434.2-201ENST00000506094 1078 ntBASIC16.39■□□□□ 0.21
IKBKEQ14164 AP003065.1-201ENST00000540912 562 ntTSL 4 BASIC16.39■□□□□ 0.21
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IKBKEQ14164 SMIM24-203ENST00000587847 820 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
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IKBKEQ14164 SLC12A8-207ENST00000469902 2989 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.39■□□□□ 0.21
IKBKEQ14164 INHBB-201ENST00000295228 3204 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
IKBKEQ14164 GLUD2-201ENST00000328078 2493 ntAPPRIS P1 BASIC16.39■□□□□ 0.21
IKBKEQ14164 TMEM9-204ENST00000367334 1529 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
IKBKEQ14164 TMEM184C-204ENST00000508208 1528 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
IKBKEQ14164 IL12RB2-205ENST00000541374 3849 ntTSL 1 (best) BASIC16.39■□□□□ 0.21
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IKBKEQ14164 ARHGEF28-201ENST00000296794 5246 ntTSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
IKBKEQ14164 PLIN1-202ENST00000430628 2900 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.39■□□□□ 0.21
IKBKEQ14164 STAT5A-201ENST00000345506 4301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IKBKEQ14164 UIMC1-201ENST00000377227 2570 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
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IKBKEQ14164 LENG8-209ENST00000616932 2825 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
IKBKEQ14164 MAMSTR-201ENST00000318083 1837 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
IKBKEQ14164 BRMS1-201ENST00000359957 1445 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IKBKEQ14164 SPDYE6-201ENST00000563237 1691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
IKBKEQ14164 ZBTB45P1-201ENST00000452761 1456 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
IKBKEQ14164 TMEM170A-207ENST00000569540 2331 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
IKBKEQ14164 C6orf52-201ENST00000259983 619 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
IKBKEQ14164 RAB36-202ENST00000341989 936 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IKBKEQ14164 RN7SKP214-201ENST00000364208 315 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
IKBKEQ14164 FGF14-202ENST00000376143 744 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IKBKEQ14164 UFM1-202ENST00000379649 846 ntTSL 4 BASIC16.38■□□□□ 0.21
IKBKEQ14164 LINC00487-201ENST00000382045 2131 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
IKBKEQ14164 GEM-202ENST00000396194 2103 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IKBKEQ14164 RN7SKP175-201ENST00000408472 289 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
IKBKEQ14164 PARVG-202ENST00000415224 999 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
IKBKEQ14164 AL731661.1-201ENST00000438217 758 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
IKBKEQ14164 PABPC5-AS1-201ENST00000456187 426 ntTSL 5 BASIC16.38■□□□□ 0.21
IKBKEQ14164 PRSS30P-205ENST00000506153 699 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IKBKEQ14164 WSPAR-201ENST00000513561 683 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
IKBKEQ14164 BHMT-206ENST00000524080 1207 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
IKBKEQ14164 GATD1-205ENST00000524550 995 ntTSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IKBKEQ14164 AP001547.1-201ENST00000527440 374 ntTSL 3 BASIC16.38■□□□□ 0.21
IKBKEQ14164 TP53AIP1-204ENST00000530777 363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.38■□□□□ 0.21
IKBKEQ14164 AF111169.4-201ENST00000556368 749 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
IKBKEQ14164 AC009955.4-201ENST00000597192 544 ntBASIC16.38■□□□□ 0.21
IKBKEQ14164 NDUFB5-216ENST00000611971 951 ntTSL 2 BASIC16.38■□□□□ 0.21
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