Protein–RNA interactions for Protein: Q14153

FAM53B, Protein FAM53B, humanhuman

Predictions only

Length 422 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FAM53BQ14153 LLPH-AS1-201ENST00000510317 623 ntTSL 4 BASIC14.32□□□□□ -0.12
FAM53BQ14153 CACNA2D4-208ENST00000538027 952 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
FAM53BQ14153 LINC02279-201ENST00000553435 737 ntTSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
FAM53BQ14153 NAA38-206ENST00000576384 424 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
FAM53BQ14153 MIR4259-201ENST00000584466 101 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
FAM53BQ14153 AC011510.1-201ENST00000598541 286 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
FAM53BQ14153 ZNF32-AS3-201ENST00000458063 1932 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
FAM53BQ14153 HCRTR1-202ENST00000373706 1642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
FAM53BQ14153 SF3A2-201ENST00000221494 1963 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
FAM53BQ14153 AHCYP2-201ENST00000430630 1300 ntBASIC14.32□□□□□ -0.12
FAM53BQ14153 ZBTB37-203ENST00000367704 2323 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
FAM53BQ14153 NXN-210ENST00000575801 2681 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
FAM53BQ14153 CACNA1A-240ENST00000637432 7809 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
FAM53BQ14153 MARCH4-201ENST00000273067 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
FAM53BQ14153 MTA2-201ENST00000278823 3058 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
FAM53BQ14153 PSMD2-201ENST00000310118 3449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
FAM53BQ14153 MKNK2-201ENST00000250896 3774 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
FAM53BQ14153 SLC16A3-211ENST00000581287 4830 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
FAM53BQ14153 AC026688.2-201ENST00000518984 1734 ntTSL 3 BASIC14.32□□□□□ -0.12
FAM53BQ14153 CRAMP1-201ENST00000293925 7671 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.32□□□□□ -0.12
FAM53BQ14153 TUFT1-201ENST00000353024 2107 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
FAM53BQ14153 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
FAM53BQ14153 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC14.32□□□□□ -0.12
FAM53BQ14153 GOLGA2P7-202ENST00000400817 2850 ntTSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
FAM53BQ14153 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.32□□□□□ -0.12
FAM53BQ14153 MBD1-222ENST00000590208 2913 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
FAM53BQ14153 RPP40-202ENST00000380051 1483 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
FAM53BQ14153 TNR-201ENST00000263525 5190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
FAM53BQ14153 PIGT-202ENST00000279036 2245 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
FAM53BQ14153 LRIT1-201ENST00000372105 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
FAM53BQ14153 CAMK2D-211ENST00000511664 2210 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
FAM53BQ14153 SMPDL3A-201ENST00000368440 1851 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
FAM53BQ14153 GABARAPL1-218ENST00000546017 2294 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
FAM53BQ14153 KAT8-201ENST00000219797 1525 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
FAM53BQ14153 LARP4-219ENST00000614335 1949 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
FAM53BQ14153 NEO1-202ENST00000339362 7342 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
FAM53BQ14153 ADAMTSL1-207ENST00000380566 2321 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
FAM53BQ14153 ISPD-202ENST00000407010 5524 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
FAM53BQ14153 SLC5A10-202ENST00000395643 1982 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
FAM53BQ14153 FBXL19-204ENST00000471231 3641 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
FAM53BQ14153 ABCG5-202ENST00000405322 2896 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
FAM53BQ14153 SSFA2-202ENST00000409001 4987 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
FAM53BQ14153 SLC8B1-201ENST00000202831 2975 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
FAM53BQ14153 BST2-201ENST00000252593 1019 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
FAM53BQ14153 GAL-201ENST00000265643 818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
FAM53BQ14153 UBXN1-202ENST00000301935 1153 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
FAM53BQ14153 CDK2-202ENST00000354056 1260 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
FAM53BQ14153 PHACTR1-202ENST00000379329 707 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
FAM53BQ14153 IGHV3-7-201ENST00000390598 430 ntAPPRIS P1 BASIC14.31□□□□□ -0.12
FAM53BQ14153 PEMT-203ENST00000395782 895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
FAM53BQ14153 MPV17-205ENST00000402310 906 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
FAM53BQ14153 AC099336.1-201ENST00000417053 1171 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
FAM53BQ14153 Z82214.2-201ENST00000420269 531 ntTSL 4 BASIC14.31□□□□□ -0.12
FAM53BQ14153 PRPS2-205ENST00000489404 763 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
FAM53BQ14153 ZNF720-210ENST00000534369 791 ntTSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
FAM53BQ14153 ANAPC15-208ENST00000538393 867 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
FAM53BQ14153 VASH1-AS1-201ENST00000554058 871 ntTSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
FAM53BQ14153 DYNLRB2-205ENST00000568035 409 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
FAM53BQ14153 SPECC1-223ENST00000584527 940 ntTSL 3 BASIC14.31□□□□□ -0.12
FAM53BQ14153 DMAC2-208ENST00000589970 979 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
FAM53BQ14153 YIF1B-216ENST00000592694 1181 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
FAM53BQ14153 DMAC2-215ENST00000597457 492 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
FAM53BQ14153 ECM1P1-201ENST00000604092 1279 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
FAM53BQ14153 Six3os1_5.1-201ENST00000611000 271 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
FAM53BQ14153 AC044839.1-204ENST00000634777 1058 ntTSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
FAM53BQ14153 AC103702.1-201ENST00000548801 2630 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
FAM53BQ14153 HTR4-209ENST00000521530 1323 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
FAM53BQ14153 RNF168-201ENST00000318037 5347 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
FAM53BQ14153 TNRC18P2-201ENST00000417666 2714 ntBASIC14.31□□□□□ -0.12
FAM53BQ14153 HID1-202ENST00000425042 3271 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
FAM53BQ14153 HENMT1-202ENST00000370032 1874 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
FAM53BQ14153 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.31□□□□□ -0.12
FAM53BQ14153 ACOT7-210ENST00000608083 1403 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
FAM53BQ14153 UNKL-201ENST00000248104 4320 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
FAM53BQ14153 IL1RN-203ENST00000361779 1922 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
FAM53BQ14153 AC093525.2-201ENST00000564543 1944 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
FAM53BQ14153 CES4A-203ENST00000535696 1472 ntTSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
FAM53BQ14153 CLEC18C-210ENST00000569347 1970 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
FAM53BQ14153 P3H1-201ENST00000236040 2993 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
FAM53BQ14153 ELMO3-202ENST00000393997 2531 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.31□□□□□ -0.12
FAM53BQ14153 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
FAM53BQ14153 CKMT2-201ENST00000254035 1512 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
FAM53BQ14153 TMEM40-204ENST00000435218 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
FAM53BQ14153 SFTA3-204ENST00000518529 1531 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
FAM53BQ14153 RB1CC1-201ENST00000025008 6635 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.31□□□□□ -0.12
FAM53BQ14153 GARS-201ENST00000389266 2634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
FAM53BQ14153 DNAJC10-210ENST00000616986 5783 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
FAM53BQ14153 CACNA2D2-203ENST00000423994 5329 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
FAM53BQ14153 ANKRD30BP2-201ENST00000435744 1610 ntBASIC14.3□□□□□ -0.12
FAM53BQ14153 WFIKKN2-202ENST00000426127 2193 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
FAM53BQ14153 LINC01267-201ENST00000502417 2284 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
FAM53BQ14153 SLC12A5-209ENST00000616201 2955 ntTSL 5 BASIC14.3□□□□□ -0.12
FAM53BQ14153 PITPNM1-202ENST00000436757 4216 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
FAM53BQ14153 TM4SF19-AS1-203ENST00000452051 1829 ntTSL 2 BASIC14.3□□□□□ -0.12
FAM53BQ14153 ANXA8L1-208ENST00000622769 1861 ntTSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
FAM53BQ14153 SURF6-201ENST00000372022 4447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
FAM53BQ14153 CLCN2-202ENST00000344937 3187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
FAM53BQ14153 LGALS2-201ENST00000215886 591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
FAM53BQ14153 CARTPT-201ENST00000296777 915 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
FAM53BQ14153 KLK11-201ENST00000319720 1198 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.3□□□□□ -0.12
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 52.9 ms