Protein–RNA interactions for Protein: Q13753

LAMC2, Laminin subunit gamma-2, humanhuman

Predictions only

Length 1,193 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAMC2Q13753 AC009093.2-202ENST00000620513 2079 ntBASIC16.8■□□□□ 0.28
LAMC2Q13753 LTF-203ENST00000426532 2494 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
LAMC2Q13753 COPS3-201ENST00000268717 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LAMC2Q13753 AKR1B15-202ENST00000457545 1621 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
LAMC2Q13753 PCSK5-205ENST00000545128 9538 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
LAMC2Q13753 KRT23-201ENST00000209718 1987 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LAMC2Q13753 CYP1A1-203ENST00000395049 1594 ntTSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LAMC2Q13753 AC009242.1-201ENST00000634300 2706 ntTSL 5 BASIC16.8■□□□□ 0.28
LAMC2Q13753 FAM53B-202ENST00000337318 5431 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LAMC2Q13753 TMEM51-204ENST00000428417 1942 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC16.8■□□□□ 0.28
LAMC2Q13753 KLC4-204ENST00000453940 1945 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
LAMC2Q13753 KRT17-201ENST00000311208 1524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LAMC2Q13753 SGCE-205ENST00000437425 1508 ntTSL 2 BASIC16.8■□□□□ 0.28
LAMC2Q13753 EHF-212ENST00000533754 1501 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.8■□□□□ 0.28
LAMC2Q13753 SIN3B-201ENST00000248054 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LAMC2Q13753 ACOT7-203ENST00000377845 1432 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LAMC2Q13753 MFSD11-202ENST00000355954 2832 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LAMC2Q13753 UGDH-202ENST00000501493 2826 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LAMC2Q13753 SGK3-211ENST00000522398 3106 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LAMC2Q13753 HNRNPF-204ENST00000443950 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LAMC2Q13753 SYBU-230ENST00000532779 2765 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LAMC2Q13753 CDK11B-204ENST00000407249 2677 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LAMC2Q13753 CALM1-216ENST00000626705 1341 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LAMC2Q13753 ADGRA1-AS1-201ENST00000366099 3236 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
LAMC2Q13753 DDX5-201ENST00000225792 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LAMC2Q13753 WASHC2C-202ENST00000359860 4471 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LAMC2Q13753 FIS1-201ENST00000223136 734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LAMC2Q13753 SDCCAG3P2-201ENST00000326105 1023 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
LAMC2Q13753 NCR3-201ENST00000340027 1042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LAMC2Q13753 ERCC1-203ENST00000340192 949 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LAMC2Q13753 C1orf53-201ENST00000367393 588 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LAMC2Q13753 TPD52L2-207ENST00000369927 1094 ntTSL 4 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LAMC2Q13753 PPIE-203ENST00000372830 1198 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LAMC2Q13753 AK6-201ENST00000380818 1183 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LAMC2Q13753 IFITM5-201ENST00000382614 736 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LAMC2Q13753 CYP46A4P-201ENST00000414953 267 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
LAMC2Q13753 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LAMC2Q13753 TNNT1-203ENST00000536926 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LAMC2Q13753 RERG-205ENST00000537647 935 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LAMC2Q13753 EID1-202ENST00000560490 584 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LAMC2Q13753 AC110285.1-205ENST00000572301 559 ntTSL 3 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LAMC2Q13753 AC005324.6-201ENST00000587972 613 ntBASIC16.79■□□□□ 0.28
LAMC2Q13753 PAX4-207ENST00000611453 1235 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LAMC2Q13753 CDH16-207ENST00000568632 2526 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LAMC2Q13753 CACNA1A-221ENST00000636012 7500 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LAMC2Q13753 GRAMD2B-217ENST00000515200 3109 ntTSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LAMC2Q13753 GOLGA8M-201ENST00000563027 1899 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LAMC2Q13753 NPRL3-201ENST00000399953 2784 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LAMC2Q13753 VAV2-201ENST00000371850 4837 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LAMC2Q13753 AC092198.1-201ENST00000447651 2691 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LAMC2Q13753 C12orf29-201ENST00000356891 2919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LAMC2Q13753 SLC37A4-217ENST00000545985 2606 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LAMC2Q13753 LITAF-209ENST00000571688 2632 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LAMC2Q13753 MFSD5-202ENST00000534842 2038 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LAMC2Q13753 RECQL5-202ENST00000340830 1749 ntTSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LAMC2Q13753 TPGS2-202ENST00000383056 1726 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.79■□□□□ 0.28
LAMC2Q13753 MAGEA4-205ENST00000393920 1721 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LAMC2Q13753 SLC47A1-203ENST00000436810 1719 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LAMC2Q13753 MIF4GD-208ENST00000579297 1419 ntTSL 2 BASIC16.79■□□□□ 0.28
LAMC2Q13753 SH3BP5-202ENST00000383791 2822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LAMC2Q13753 JRK-211ENST00000615982 2823 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LAMC2Q13753 SCLT1-209ENST00000511426 1696 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LAMC2Q13753 CCNE1-202ENST00000357943 1641 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LAMC2Q13753 ADM-201ENST00000278175 1885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LAMC2Q13753 MAP4K1-208ENST00000589130 2654 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LAMC2Q13753 ZNF331-217ENST00000512387 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LAMC2Q13753 AP000845.1-201ENST00000581677 2131 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
LAMC2Q13753 ZNF821-203ENST00000446827 1822 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LAMC2Q13753 FAM57B-202ENST00000380495 2313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LAMC2Q13753 FRMPD4-201ENST00000380682 8465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LAMC2Q13753 MYRIP-202ENST00000396217 4877 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LAMC2Q13753 SLC30A4-201ENST00000261867 7157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LAMC2Q13753 PKDREJ-201ENST00000253255 7693 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LAMC2Q13753 C11orf52-201ENST00000278601 1141 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LAMC2Q13753 MRPL43-206ENST00000370236 866 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LAMC2Q13753 MRPL43-207ENST00000370241 824 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LAMC2Q13753 TMEM254-204ENST00000372277 366 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LAMC2Q13753 NQO2-202ENST00000380430 1098 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LAMC2Q13753 IGLC7-201ENST00000390331 441 ntAPPRIS P1 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LAMC2Q13753 CRCP-204ENST00000398684 492 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LAMC2Q13753 TLE1P1-201ENST00000422965 589 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
LAMC2Q13753 FAM58BP-201ENST00000439056 645 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
LAMC2Q13753 OARD1-204ENST00000464633 717 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LAMC2Q13753 AGTRAP-212ENST00000510878 849 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LAMC2Q13753 AC022217.1-201ENST00000521069 738 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
LAMC2Q13753 AL445483.1-201ENST00000568695 736 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LAMC2Q13753 NRN1L-202ENST00000576147 681 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LAMC2Q13753 MIR4783-201ENST00000580343 82 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
LAMC2Q13753 KLK3-207ENST00000595952 969 ntTSL 3 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LAMC2Q13753 MLLT10-216ENST00000621220 381 ntTSL 1 (best) BASIC16.78■□□□□ 0.28
LAMC2Q13753 AC100757.4-201ENST00000626934 759 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
LAMC2Q13753 AC126365.1-201ENST00000578585 1514 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
LAMC2Q13753 HLA-DQB2-231ENST00000435145 2026 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
LAMC2Q13753 TNN-201ENST00000239462 5008 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LAMC2Q13753 AC096667.1-201ENST00000640078 3465 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LAMC2Q13753 SPIN3-224ENST00000639583 2245 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LAMC2Q13753 SLC18A1-207ENST00000519026 1980 ntTSL 5 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LAMC2Q13753 CCDC90B-213ENST00000529611 1986 ntTSL 2 BASIC16.78■□□□□ 0.28
LAMC2Q13753 AC112693.3-201ENST00000624819 1983 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
LAMC2Q13753 AC004899.1-201ENST00000424687 1714 ntBASIC16.78■□□□□ 0.28
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