Protein–RNA interactions for Protein: Q13370

PDE3B, cGMP-inhibited 3',5'-cyclic phosphodiesterase B, humanhuman

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Length 1,112 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDE3BQ13370 AC006453.4-201ENST00000636949 1252 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
PDE3BQ13370 GOLM1-203ENST00000388712 3046 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PDE3BQ13370 TOB1-202ENST00000499247 2229 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PDE3BQ13370 AMBP-201ENST00000265132 1434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PDE3BQ13370 TBC1D1-219ENST00000615497 2383 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PDE3BQ13370 PHKA1-202ENST00000373539 4476 ntTSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PDE3BQ13370 KATNA1-201ENST00000335643 1564 ntTSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PDE3BQ13370 TBC1D26-206ENST00000579428 1583 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PDE3BQ13370 SLC52A3-201ENST00000217254 2654 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PDE3BQ13370 SLC25A34-201ENST00000294454 2986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PDE3BQ13370 PITPNM1-201ENST00000356404 4225 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.67■□□□□ 0.9
PDE3BQ13370 INTS14-204ENST00000442903 1863 ntTSL 2 BASIC20.67■□□□□ 0.9
PDE3BQ13370 LINC01101-201ENST00000622953 1884 ntBASIC20.67■□□□□ 0.9
PDE3BQ13370 LEKR1-209ENST00000491763 1940 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PDE3BQ13370 ACE-202ENST00000290866 4959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PDE3BQ13370 CACNA1I-201ENST00000401624 6740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PDE3BQ13370 ODF2-202ENST00000372791 2375 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PDE3BQ13370 PTBP1-204ENST00000394601 3185 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PDE3BQ13370 ZXDC-202ENST00000389709 3405 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PDE3BQ13370 NFATC4-202ENST00000413692 5700 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PDE3BQ13370 PRKG1-AS1-201ENST00000420193 971 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
PDE3BQ13370 POM121L10P-201ENST00000436994 1285 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
PDE3BQ13370 AP000320.1-201ENST00000440403 471 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
PDE3BQ13370 AL590640.2-201ENST00000457038 527 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
PDE3BQ13370 AC091390.4-201ENST00000484974 491 ntTSL 3 BASIC20.66■□□□□ 0.9
PDE3BQ13370 RN7SL720P-201ENST00000488178 304 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
PDE3BQ13370 AC126915.1-201ENST00000522847 1038 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
PDE3BQ13370 TMBIM4-205ENST00000535812 766 ntTSL 4 BASIC20.66■□□□□ 0.9
PDE3BQ13370 TMBIM4-212ENST00000556010 610 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
PDE3BQ13370 CMC2-214ENST00000565925 640 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
PDE3BQ13370 TSPO-206ENST00000583777 636 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PDE3BQ13370 SIRT2-219ENST00000613542 1170 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
PDE3BQ13370 FXYD3-202ENST00000346446 1320 ntTSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
PDE3BQ13370 AC007326.5-201ENST00000640084 1382 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
PDE3BQ13370 ELP6-201ENST00000296149 1401 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PDE3BQ13370 DMTN-209ENST00000517600 1569 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
PDE3BQ13370 AL138709.1-201ENST00000614840 1693 ntBASIC20.66■□□□□ 0.9
PDE3BQ13370 KRT71-201ENST00000267119 2265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PDE3BQ13370 PIGW-204ENST00000614443 2312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PDE3BQ13370 LAT2-202ENST00000344995 2363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PDE3BQ13370 CYP27B1-201ENST00000228606 2540 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PDE3BQ13370 DMTN-202ENST00000358242 2772 ntTSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
PDE3BQ13370 CPSF7-202ENST00000394888 3650 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC20.66■□□□□ 0.9
PDE3BQ13370 TAOK2-203ENST00000416441 4780 ntTSL 1 (best) BASIC20.66■□□□□ 0.9
PDE3BQ13370 MAGI3-203ENST00000369615 6508 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.66■□□□□ 0.9
PDE3BQ13370 CGGBP1-201ENST00000309534 4495 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PDE3BQ13370 GPRIN1-201ENST00000303991 4211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PDE3BQ13370 DDX55-201ENST00000238146 2654 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PDE3BQ13370 LINC01136-203ENST00000457348 2539 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PDE3BQ13370 RSPO1-204ENST00000615459 2331 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PDE3BQ13370 LSM6-201ENST00000296581 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PDE3BQ13370 AL928654.2-201ENST00000551271 2279 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PDE3BQ13370 AC023024.2-201ENST00000623561 1993 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
PDE3BQ13370 SNCAIP-207ENST00000504884 1885 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PDE3BQ13370 AL365199.1-201ENST00000421320 1714 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PDE3BQ13370 MUTYH-211ENST00000456914 1692 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PDE3BQ13370 CFLAR-205ENST00000342795 1613 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PDE3BQ13370 ZC2HC1C-202ENST00000439583 1509 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PDE3BQ13370 AL121723.1-201ENST00000445194 1519 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
PDE3BQ13370 FBXO8-202ENST00000503293 1546 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PDE3BQ13370 SPIB-201ENST00000270632 1443 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PDE3BQ13370 AL355493.2-201ENST00000568270 1395 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PDE3BQ13370 CCDC107-204ENST00000378409 1173 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PDE3BQ13370 MIR769-201ENST00000390225 118 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
PDE3BQ13370 CYP46A4P-201ENST00000414953 267 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
PDE3BQ13370 DEF8-202ENST00000418391 852 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PDE3BQ13370 LINC02158-201ENST00000432377 897 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PDE3BQ13370 MAGEA5-201ENST00000446757 942 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
PDE3BQ13370 KRT18P43-201ENST00000469825 1281 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
PDE3BQ13370 LEF1-AS1-204ENST00000508266 559 ntTSL 4 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PDE3BQ13370 AC005920.3-202ENST00000512717 789 ntTSL 3 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PDE3BQ13370 EIF3M-203ENST00000524896 1207 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PDE3BQ13370 AAMDC-206ENST00000526415 579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PDE3BQ13370 AC025259.3-202ENST00000564363 687 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PDE3BQ13370 NIP7-208ENST00000569637 1099 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PDE3BQ13370 AC005262.2-201ENST00000587701 452 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PDE3BQ13370 SEPT9-233ENST00000590917 541 ntTSL 4 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PDE3BQ13370 SMCO4-206ENST00000596676 180 ntAPPRIS P1 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PDE3BQ13370 AC107373.2-201ENST00000607735 490 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
PDE3BQ13370 SNAP91-205ENST00000439399 4452 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PDE3BQ13370 CACNB3-201ENST00000301050 2696 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PDE3BQ13370 DLGAP1-214ENST00000539435 2402 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PDE3BQ13370 PCSK2-205ENST00000536609 2275 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
PDE3BQ13370 MEOX1-202ENST00000329168 2129 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PDE3BQ13370 NIPAL4-201ENST00000311946 3274 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PDE3BQ13370 PRMT2-207ENST00000440086 1932 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
PDE3BQ13370 AP1S3-206ENST00000443700 1785 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
PDE3BQ13370 ADAMTS1-201ENST00000284984 5191 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
PDE3BQ13370 UGT3A1-204ENST00000507113 1650 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
PDE3BQ13370 FAM45BP-202ENST00000592932 1624 ntBASIC20.64■□□□□ 0.9
PDE3BQ13370 NDRG1-202ENST00000414097 3755 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.9
PDE3BQ13370 ITGB2-207ENST00000397854 2592 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
PDE3BQ13370 CPA1-201ENST00000011292 1487 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PDE3BQ13370 RAPSN-202ENST00000352508 1452 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PDE3BQ13370 KRT9-202ENST00000588431 1493 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PDE3BQ13370 LRRC57-202ENST00000397130 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PDE3BQ13370 ERRFI1-201ENST00000377482 3104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
PDE3BQ13370 PNPLA3-203ENST00000423180 2222 ntTSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PDE3BQ13370 LCN9-201ENST00000277526 531 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
PDE3BQ13370 SLURP2-201ENST00000317543 599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
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